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豇豆抗锈病全基因组关联分析
被引量:
2
1
作者
吴健
汪宝根
+10 位作者
陈小央
吴晓花
李潇
韩磊
汪颖
王尖
鲁忠富
杨易
张艳
李国景
吴新义
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期1907-1922,共16页
豇豆是世界范围内重要的豆类作物,在我国既是重要的杂粮作物,也是传统的豆类蔬菜作物。锈病是豇豆生产上三大主要病害之一,选育抗锈病品种是防治锈病最经济有效的策略,筛选抗锈病种质、解析其遗传基础是抗锈病育种的关键和前提。本研究...
豇豆是世界范围内重要的豆类作物,在我国既是重要的杂粮作物,也是传统的豆类蔬菜作物。锈病是豇豆生产上三大主要病害之一,选育抗锈病品种是防治锈病最经济有效的策略,筛选抗锈病种质、解析其遗传基础是抗锈病育种的关键和前提。本研究对215份豇豆地方品种进行抗锈病精准鉴定,筛选出40份抗锈病种质。利用重测序技术鉴定了215份种质的基因型,获得3880169个高质量SNPs和469398个高质量InDels。群体结构分析将之分为4个亚群,亚群分类与荚长、荚型高度相关。采用全基因组关联分析,鉴定出10个与锈病抗性显著相关的基因组区段,分布在7条染色体上。单倍型分析显示各峰值SNP的不同等位变异与锈病抗性高度相关,且随着有利等位变异的聚合,群体内抗病材料的比例显著升高。本研究鉴定出10个可能的抗锈病候选基因,包括含BTB/POZ结构域蛋白基因、LRR受体类丝氨酸/苏氨酸激酶基因、乙烯反应转录因子、交替氧化酶基因等。本研究为豇豆抗锈病分子育种提供了理论指导和基因资源。
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关键词
豇豆
锈病
关联分析
重测序
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职称材料
题名
豇豆抗锈病全基因组关联分析
被引量:
2
1
作者
吴健
汪宝根
陈小央
吴晓花
李潇
韩磊
汪颖
王尖
鲁忠富
杨易
张艳
李国景
吴新义
机构
浙江
农林大学园艺
科学
学院
浙江省
农业
科学院
蔬菜
研究所
/农业
农村部
南方
豆类蔬菜
种质
创新与
分子
育种
重点
实验室
(
部
省
共建
)
浙江省
种子管理总站
广东
省
农业
科学院
蔬菜
研究所
浙江省
农业
科学院
省
部
共建
农产品质量安全危害因子与风险防控国家
重点
实验室
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期1907-1922,共16页
基金
2022-2024年浙江省农作物种质资源精准鉴定评价任务(2023R23T60D01,2022R23T60D04)
国家自然科学基金(32172568)
+1 种基金
浙江省农业新品种选育重大科技专项(2021C02065-6-3)
山东省重点研发计划(2023LZGCQY012)。
文摘
豇豆是世界范围内重要的豆类作物,在我国既是重要的杂粮作物,也是传统的豆类蔬菜作物。锈病是豇豆生产上三大主要病害之一,选育抗锈病品种是防治锈病最经济有效的策略,筛选抗锈病种质、解析其遗传基础是抗锈病育种的关键和前提。本研究对215份豇豆地方品种进行抗锈病精准鉴定,筛选出40份抗锈病种质。利用重测序技术鉴定了215份种质的基因型,获得3880169个高质量SNPs和469398个高质量InDels。群体结构分析将之分为4个亚群,亚群分类与荚长、荚型高度相关。采用全基因组关联分析,鉴定出10个与锈病抗性显著相关的基因组区段,分布在7条染色体上。单倍型分析显示各峰值SNP的不同等位变异与锈病抗性高度相关,且随着有利等位变异的聚合,群体内抗病材料的比例显著升高。本研究鉴定出10个可能的抗锈病候选基因,包括含BTB/POZ结构域蛋白基因、LRR受体类丝氨酸/苏氨酸激酶基因、乙烯反应转录因子、交替氧化酶基因等。本研究为豇豆抗锈病分子育种提供了理论指导和基因资源。
关键词
豇豆
锈病
关联分析
重测序
Keywords
cowpea
rust
association study
re-sequencing
分类号
S643.4 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
豇豆抗锈病全基因组关联分析
吴健
汪宝根
陈小央
吴晓花
李潇
韩磊
汪颖
王尖
鲁忠富
杨易
张艳
李国景
吴新义
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
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