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浙江省地方菜豆种质资源鉴定与遗传多样性分析 被引量：7
1
作者 汪宝根 董君暘 +6 位作者 汪颖 李素娟 王尖 鲁忠富 吴晓花 李国景 吴新义 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第11期2416-2427,共12页
为鉴定浙江省地方菜豆种质遗传多样性,对浙江省历年来收集到的44份菜豆种质进行13个重要农艺性状的田间调查。结果表明,浙江地方菜豆种质在生长习性、嫩荚商品性等性状上均存在丰富的遗传变异。从发表的菜豆BARCBean6K_3 BeadChip芯片... 为鉴定浙江省地方菜豆种质遗传多样性,对浙江省历年来收集到的44份菜豆种质进行13个重要农艺性状的田间调查。结果表明,浙江地方菜豆种质在生长习性、嫩荚商品性等性状上均存在丰富的遗传变异。从发表的菜豆BARCBean6K_3 BeadChip芯片中随机、均匀挑选了185个SNP转化成KASP标记,对44份种质进行基因型鉴定后获得了88个高质量SNP基因型,主成分分析和系统进化树分析发现这些种质可以分为2大类,亚群分化与千粒重高度相关,且浙江省菜豆种质以中美洲基因池为主。研究结果可进一步丰富我国菜豆遗传基础,为地方菜豆资源的高效利用和新品种选育提供科学依据,所开发的KASP标记也可为菜豆种质基础研究提供有力的遗传工具。 展开更多
关键词 菜豆 种质资源 农艺性状 遗传多样性 基因型
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浙江豇豆地方品种的遗传多样性 被引量：2
2
作者 汪宝根 陈小央 +9 位作者 吴健 李潇 汪颖 王尖 吴晓花 鲁忠富 孙玉燕 董文其 李国景 吴新义 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第7期1569-1582,共14页
浙江省是我国豇豆的主要产区之一,为全面梳理、鉴定浙江省地方豇豆种质资源,对浙江省历年来收集到的220份豇豆地方品种进行21个重要性状的田间鉴定。结果表明,浙江省豇豆地方种质具有丰富的表型变异,基于表型数据的聚类分析可以将它们分... 浙江省是我国豇豆的主要产区之一,为全面梳理、鉴定浙江省地方豇豆种质资源,对浙江省历年来收集到的220份豇豆地方品种进行21个重要性状的田间鉴定。结果表明,浙江省豇豆地方种质具有丰富的表型变异,基于表型数据的聚类分析可以将它们分为4个类群,其中类群Ⅲ的综合表现接近目前生产上的育成品种,具有较高的育种使用价值。本研究还利用豇豆物种特异的核心单核苷酸多态性(SNP)标记对其进行基因型鉴定,构建了各种质DNA指纹图谱,基于基因型数据将之分为4个亚群,其中亚群Ⅲ的荚长较长。本研究从多角度评价了浙江省豇豆地方种质的遗传多样性,研究结果可以为豇豆种质创新和新品种选育提供科学依据。 展开更多
关键词 豇豆 种质资源 遗传多样性 基因型
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基于病虫害绿色防控的豇豆优质高效栽培模式 被引量：3
3
作者 杨新琴 吴新义 +5 位作者 李国景 吴晓花 王尖 汪颖 刘庭付 汪宝根 《浙江农业科学》 2024年第12期2972-2976,共5页
豇豆是浙江省传统优势蔬菜作物之一,生产上病虫害多发,尤以枯萎病、蓟马、豆野螟危害严重。目前浙江省豇豆病虫害防控主要依赖化学农药,但对蓟马等虫害防治效果不佳,容易造成农药残留超标、环境污染等问题。通过综合分析浙江省豇豆病虫... 豇豆是浙江省传统优势蔬菜作物之一,生产上病虫害多发,尤以枯萎病、蓟马、豆野螟危害严重。目前浙江省豇豆病虫害防控主要依赖化学农药,但对蓟马等虫害防治效果不佳,容易造成农药残留超标、环境污染等问题。通过综合分析浙江省豇豆病虫害防控现状,结合浙江省气候条件及农民种植习惯,本文提出基于病虫害绿色防控的早春设施栽培和高山栽培模式,为浙江省豇豆产业可持续发展提供科学指导和实践依据。 展开更多
关键词 豇豆 病虫害 早春设施栽培 高山栽培 绿色防控
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利用核心SNP标记构建豆类蔬菜品种指纹图谱
4
作者 吴新义 刘娜 +2 位作者 汪宝根 龚亚明 李国景 《浙江农业科学》 2025年第2期363-369,共7页
豆类蔬菜是我国重要的蔬菜作物。为促进豆类蔬菜品种权保护,以豇豆和菜用豌豆为研究对象,分别利用物种特异的核心单核苷酸多态性(SNP)标记构建了52份豇豆品种(系)和48份豌豆种质的DNA指纹图谱,并对14份豇豆品种(系)的种子纯度进行了检... 豆类蔬菜是我国重要的蔬菜作物。为促进豆类蔬菜品种权保护,以豇豆和菜用豌豆为研究对象,分别利用物种特异的核心单核苷酸多态性(SNP)标记构建了52份豇豆品种(系)和48份豌豆种质的DNA指纹图谱,并对14份豇豆品种(系)的种子纯度进行了检测。该研究结果表明,基于竞争性等位基因特异性PCR(KASP)技术的SNP标记可以用于豆类蔬菜品种的品种权保护、种子真伪区分以及种子纯度鉴定,建议尽快制订并发布基于SNP标记的豆类蔬菜品种鉴定技术标准,为种业和产业健康发展提供技术支撑。 展开更多
关键词 豆类蔬菜 SNP标记 KASP 品种保护 种子纯度
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丁酸梭菌对全氟辛酸暴露斑马鱼肝脏损伤关键转录信号的影响
5
作者 任若琛 余敏洁 +4 位作者 郑文彤 孙倩倩 曾洪波 靳远祥 肖英平 《生态毒理学报》 北大核心 2025年第4期407-416,共10页
本试验旨在探究丁酸梭菌(Clostridium butyricum,CB)对全氟辛酸(perfluorooctanoic acid,PFOA)暴露斑马鱼肝脏损伤的缓解作用。选用120条8~9月龄AB品系的斑马鱼随机分为对照组(Control)、PFOA暴露组(PFOA)和丁酸梭菌处理组(CB+PFOA),在... 本试验旨在探究丁酸梭菌(Clostridium butyricum,CB)对全氟辛酸(perfluorooctanoic acid,PFOA)暴露斑马鱼肝脏损伤的缓解作用。选用120条8~9月龄AB品系的斑马鱼随机分为对照组(Control)、PFOA暴露组(PFOA)和丁酸梭菌处理组(CB+PFOA),在第28天采集各组斑马鱼肝脏样品。结果发现PFOA暴露使斑马鱼肝脏组织中细胞排列松散,肝细胞核出现易位或消失,而丁酸梭菌处理后肝脏细胞排列紧致,减少了细胞核的易位或消失。代谢组学分析发现3组之间共存在21种差异代谢物,丁酸梭菌处理可显著缓解PFOA暴露引起的肝脏胆固醇和亚精胺丰度升高。转录组学分析发现3组之间共存在499个差异表达基因,差异基因主要富集在新陈代谢、钙离子信号通路和MAPK信号通路等;PFOA暴露显著上调了肿瘤坏死因子α(TNFA)、NFKB2、NFKBIAB和血小板衍生生长因子(PDGFAA)等促炎基因的表达,丁酸梭菌上调了热休克蛋白70L(HSP70L)、热休克蛋白B1(HSPB1)、热休克蛋白70.2(HSP70.2)和双特异性磷酸酶1(DUSP1)等抗炎基因的表达。相关性分析表明胆固醇和亚精胺与TNFA、白介素-6受体(IL6R)和PDGFAA等促炎基因有较强相关性。综上所述,丁酸梭菌可通过降低肝脏胆固醇和亚精胺代谢物丰度以及TNFA和PDGFAA等促炎基因的表达,提高HSP70L和HSPB1等抗炎因子的表达,减少肝脏细胞核的易位或消失,从而减轻PFOA的毒性损伤。 展开更多
关键词 丁酸梭菌 全氟辛酸 斑马鱼 肝脏
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饲料中添加乙酸钠对小黄鱼生长性能和肝脏脂质组的影响
6
作者 谢小玲 吴酬飞 +4 位作者 吕文涛 任若琛 楼宝 张煜 梁骁 《中国饲料》 北大核心 2025年第7期135-143,共9页
为探究日粮中添加乙酸钠对小黄鱼(Larimichthys polyactis)生长性能和肝脏脂质组的影响,试验选择大小均一的小黄鱼幼鱼30尾,随机分为两组,对照组(C组)饲喂基础饲料,试验组(SA组)在基础饲料中添加0.5 g/kg乙酸钠,每天投喂两次,试验为期1... 为探究日粮中添加乙酸钠对小黄鱼(Larimichthys polyactis)生长性能和肝脏脂质组的影响,试验选择大小均一的小黄鱼幼鱼30尾,随机分为两组,对照组(C组)饲喂基础饲料,试验组(SA组)在基础饲料中添加0.5 g/kg乙酸钠,每天投喂两次,试验为期10周。试验结束后,测定小黄鱼的体重,采集肝脏组织,并利用液相色谱-质谱联用仪(LC-MS)对小黄鱼肝脏进行脂质组学分析。结果显示:饲料中添加0.5 g/kg乙酸钠可以显著提升小黄鱼的增重率(P<0.05)。同时,饲料中添加0.5 g/kg乙酸钠会提升小黄鱼肝脏脂质总水平,且双甲基磷脂酸(BisMePA)、神经酰胺(Cer)等16种脂质亚类都呈显著上升趋势。进一步进行多维统计分析和单变量统计分析,以VIP≥1.6且P<0.05为条件筛选到68个显著差异脂质分子,与C组相比,SA组有13个磷脂酰胆碱(PC)和6个Cer的水平显著上升。本试验探究了日粮乙酸钠对小黄鱼肝脏脂质组和生长性能的影响,为进一步阐明乙酸钠在水产养殖中的应用提供理论依据。 展开更多
关键词 小黄鱼 乙酸钠 肝脏 脂质组
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豇豆抗锈病全基因组关联分析 被引量：2
7
作者 吴健 汪宝根 +10 位作者 陈小央 吴晓花 李潇 韩磊 汪颖 王尖 鲁忠富 杨易 张艳 李国景 吴新义 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期1907-1922,共16页
豇豆是世界范围内重要的豆类作物,在我国既是重要的杂粮作物,也是传统的豆类蔬菜作物。锈病是豇豆生产上三大主要病害之一,选育抗锈病品种是防治锈病最经济有效的策略,筛选抗锈病种质、解析其遗传基础是抗锈病育种的关键和前提。本研究... 豇豆是世界范围内重要的豆类作物,在我国既是重要的杂粮作物,也是传统的豆类蔬菜作物。锈病是豇豆生产上三大主要病害之一,选育抗锈病品种是防治锈病最经济有效的策略,筛选抗锈病种质、解析其遗传基础是抗锈病育种的关键和前提。本研究对215份豇豆地方品种进行抗锈病精准鉴定,筛选出40份抗锈病种质。利用重测序技术鉴定了215份种质的基因型,获得3880169个高质量SNPs和469398个高质量InDels。群体结构分析将之分为4个亚群,亚群分类与荚长、荚型高度相关。采用全基因组关联分析,鉴定出10个与锈病抗性显著相关的基因组区段,分布在7条染色体上。单倍型分析显示各峰值SNP的不同等位变异与锈病抗性高度相关,且随着有利等位变异的聚合,群体内抗病材料的比例显著升高。本研究鉴定出10个可能的抗锈病候选基因,包括含BTB/POZ结构域蛋白基因、LRR受体类丝氨酸/苏氨酸激酶基因、乙烯反应转录因子、交替氧化酶基因等。本研究为豇豆抗锈病分子育种提供了理论指导和基因资源。 展开更多
关键词 豇豆 锈病 关联分析 重测序
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小球藻(Chlorella vulgaris)对泰乐菌素的胁迫响应与耐受性 被引量：1
8
作者 聂红丽 成琪璐 +3 位作者 孙万春 马进川 林辉 马军伟 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第10期2316-2327,共12页
抗生素是一类典型的新兴污染物,对水生生物有较高的生态风险。微藻作为自然水体的初级生产者,极易受到环境变化尤其是污染物暴露的影响。但是目前关于微藻对泰乐菌素(tylosin, TYN)胁迫的响应研究还十分有限。本研究选用模式藻种小球藻(... 抗生素是一类典型的新兴污染物,对水生生物有较高的生态风险。微藻作为自然水体的初级生产者,极易受到环境变化尤其是污染物暴露的影响。但是目前关于微藻对泰乐菌素(tylosin, TYN)胁迫的响应研究还十分有限。本研究选用模式藻种小球藻(Chlorella vulgaris)为试验材料,从细胞生长、生理、代谢、基因表达等层面研究TYN处理下微藻的胁迫耐受性。结果表明,TYN对C.vulgaris的生长呈典型的hormesis效应:即低质量浓度(≤0.5 mg·L^(-1))促进藻的生长;随着TYN处理浓度的升高,其对C.vulgaris生长的抑制作用越明显,并导致细胞形态改变、质壁分离、类囊体降解等不同程度的氧化损伤。转录组测序发现,高质量浓度TYN处理8 d后,C.vulgaris中光合作用、核糖体生物合成、抗氧化等相关的基因表达水平显著下调,进一步表明高质量浓度TYN对微藻细胞有抑制效应。值得注意的是,C.vulgaris可通过增加胞外多糖和蛋白质含量提高TYN与胞外聚合物中-OH、-COOH、-NH等官能团的结合水平,以应对高质量浓度TYN对细胞的胁迫效应。研究系统揭示了C.vulgaris对TYN的胁迫响应与耐受性,相关结果可以为抗生素的水体生态风险评估提供参考依据。 展开更多
关键词 新兴污染物 微藻 胁迫响应 转录组学分析 胞外聚合物 逆境耐受
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公猪和不同生理阶段母猪粪便真菌结构多样性分析
9
作者 任若琛 肖英平 +4 位作者 李阳 吴酬飞 马灵燕 施伟领 王剑峰 《中国饲料》 北大核心 2024年第13期62-69,共8页
本试验旨在探究公猪、妊娠母猪和哺乳母猪粪便真菌菌群结构多样性,为种猪肠道真菌功能研究以及猪饲料配制提供参考。试验选用18头杜洛克公猪及其交配的18头长大母猪,分别收集公猪、母猪妊娠和哺乳阶段的新鲜粪便样品用于真菌ITS2测序。... 本试验旨在探究公猪、妊娠母猪和哺乳母猪粪便真菌菌群结构多样性,为种猪肠道真菌功能研究以及猪饲料配制提供参考。试验选用18头杜洛克公猪及其交配的18头长大母猪,分别收集公猪、母猪妊娠和哺乳阶段的新鲜粪便样品用于真菌ITS2测序。结果表明:(1)公猪、妊娠母猪和哺乳母猪粪便中共享12个核心真菌属,主要包括曲霉菌属(Aspergillus)、地霉菌属(Geotrichum)和毕赤酵母属(Pichia),占总序列的47.73%。(2)α多样性分析发现公猪的辛普森指数显著高于妊娠母猪(P <0.05),妊娠母猪的扩增序列变体(ASV)数量、香农指数和Chao1指数显著高于哺乳母猪(P <0.05)。主坐标分析显示公猪、妊娠母猪和哺乳母猪粪便真菌菌群呈现不同的聚类(P=0.001)。(3)公猪粪便内壶菌门(Chytridiomycota)丰度显著高于母猪(P <0.05),担子菌门(Basidiomycota)丰度显著低于母猪(P <0.05)。母猪妊娠期粪便子囊菌门(Ascomycota)的相对丰度高于哺乳期(P> 0.05),而担子菌门的相对丰度低于哺乳期(P <0.05)。在属水平上,公猪粪便哈萨克斯坦酵母属(Kazachstania)、Tahromyces属和梨囊鞭菌属(Piromyces)显著高于母猪(P <0.05),而节担菌属(Wallemia)和念珠菌属(Candida)显著低于母猪(P <0.05)。对于不同生理阶段的母猪而言,妊娠母猪粪便内曲霉菌属和棒孢酵母属(Clavispora)的丰度显著高于哺乳母猪(P <0.05),毕赤酵母属、念珠菌属和青霉菌属(Penicillium)的丰度显著低于哺乳母猪(P <0.05)。综上所述,公猪和不同生理阶段母猪粪便真菌结构和多样性存在显著差异,这为公猪和母猪肠道真菌的功能研究以及种猪饲料研发奠定了理论基础。 展开更多
关键词 粪便真菌 公猪 母猪 生理阶段
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不同腹脂率番鸭回肠转录组差异分析 被引量：1
10
作者 王小骊 王兴鑫 +3 位作者 杨彩梅 肖英平 杨华 吕文涛 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第8期2899-2909,共11页
【目的】解析番鸭回肠组织中与腹脂沉积相关的主效基因。【方法】从2000只番鸭中随机选取200只70日龄的番鸭进行屠宰,采集腹脂并称重,计算腹脂率。按腹脂率大小排序,选取腹脂率最高的5只和最低的5只番鸭的回肠组织进行转录组测序分析。... 【目的】解析番鸭回肠组织中与腹脂沉积相关的主效基因。【方法】从2000只番鸭中随机选取200只70日龄的番鸭进行屠宰,采集腹脂并称重,计算腹脂率。按腹脂率大小排序,选取腹脂率最高的5只和最低的5只番鸭的回肠组织进行转录组测序分析。利用Illumina NovaSeq 6000高通量RNA-Seq测序技术对2种腹脂率番鸭的回肠进行转录组测序,使用RSEM软件将测序得到的reads序列与Trinity拼接的参考基因组进行序列比对,筛选出差异表达基因,利用GO和KEGG数据库进行功能注释、富集分析和聚类分析,并利用皮尔森相关性分析方法分析了腹脂重和腹脂率与差异表达基因的相关性。【结果】高腹脂率和低腹脂率番鸭的回肠差异表达基因共有602个;与低腹脂率番鸭相比,高腹脂率番鸭回肠中有285个基因上调,317个基因下调。GO和KEGG富集分析显示,有5个与脂肪代谢相关的GO条目(脂质应答、类固醇激素介导的信号通路、类固醇激素应答、类固醇激素刺激的细胞应答和脂质的细胞应答)和4个KEGG通路(PPAR信号通路、初级胆汁酸的生物合成、花生四烯酸代谢和胆汁分泌),并筛选出与脂肪代谢显著相关的6个基因(P<0.05),包括NR5A2、ACBP、ACOX2、FABP2、FABP4和FABP5,其中,ACOX2和FABP5基因与腹脂重和腹脂率呈显著正相关(P<0.05),ACBP基因与腹脂重和腹脂率呈极显著正相关(P<0.01)。【结论】不同腹脂率番鸭回肠转录组存在差异,发现5个GO条目和4个KEGG通路,NR5A2、ACBP、ACOX2、FABP2、FABP4和FABP5等基因与番鸭腹部脂肪沉积相关。 展开更多
关键词 番鸭 腹脂 脂肪代谢 转录组
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