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二化螟实时荧光定量PCR内参基因筛选和表达稳定性评价
被引量:
10
1
作者
徐红星
王国荣
+4 位作者
鲁艳辉
杨亚军
郑许松
田俊策
吕仲贤
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期75-84,共10页
【目的】筛选特定试验条件下二化螟(Chilosuppressalis)稳定表达的内参基因,为二化螟基因表达研究奠定基础。【方法】根据二化螟转录组测序结果挑选出11个候选基因,利用实时荧光定量PCR测定其在二化螟不同发育历期、不同组织、温度处理...
【目的】筛选特定试验条件下二化螟(Chilosuppressalis)稳定表达的内参基因,为二化螟基因表达研究奠定基础。【方法】根据二化螟转录组测序结果挑选出11个候选基因,利用实时荧光定量PCR测定其在二化螟不同发育历期、不同组织、温度处理、杀虫剂处理、取食不同饲料、取食不同水稻、dsRNA处理和混合样品的表达量,利用RefFinder、BestKeeper、Ge Norm和NormFinder等软件和ΔC_t值对11个候选基因的稳定性进行评估。【结果】5种分析方法表明,在二化螟不同发育历期稳定性较高的内参基因是AK、RPL10和EF1,不同组织中稳定性较高的内参基因是EF1、TUB和ACTB,不同温度下较稳定的内参基因为TUB、RPL10和EF1,杀虫剂处理样品中较稳定的是TF4和ACTA,取食不同饲料较稳定的是TUB、TF4、EF1和RPL10,取食不同品种水稻较稳定的是TUB和EF1,dsRNA处理样品中较稳定的是TUB、AK、ACTB和EF1,混合样品中较稳定的是EF1、TUB和ACTB。【结论】为不同试验条件下选择合适的内参基因提供了参考,也有利于在二化螟基因表达研究中获得更加可靠准确的数据。
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关键词
二化螟
内参基因
荧光定量PCR
基因表达
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职称材料
题名
二化螟实时荧光定量PCR内参基因筛选和表达稳定性评价
被引量:
10
1
作者
徐红星
王国荣
鲁艳辉
杨亚军
郑许松
田俊策
吕仲贤
机构
浙江省农业科学院农业部农产品信息溯源重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地
杭州市萧山区
农业
技术推广中心
出处
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期75-84,共10页
基金
国家自然科学基金资助项目(31672050)
浙江省植物有害生物防控省部共建国家重点实验室培育基地自主设计项目(2010DS700124-ZZ1601)
文摘
【目的】筛选特定试验条件下二化螟(Chilosuppressalis)稳定表达的内参基因,为二化螟基因表达研究奠定基础。【方法】根据二化螟转录组测序结果挑选出11个候选基因,利用实时荧光定量PCR测定其在二化螟不同发育历期、不同组织、温度处理、杀虫剂处理、取食不同饲料、取食不同水稻、dsRNA处理和混合样品的表达量,利用RefFinder、BestKeeper、Ge Norm和NormFinder等软件和ΔC_t值对11个候选基因的稳定性进行评估。【结果】5种分析方法表明,在二化螟不同发育历期稳定性较高的内参基因是AK、RPL10和EF1,不同组织中稳定性较高的内参基因是EF1、TUB和ACTB,不同温度下较稳定的内参基因为TUB、RPL10和EF1,杀虫剂处理样品中较稳定的是TF4和ACTA,取食不同饲料较稳定的是TUB、TF4、EF1和RPL10,取食不同品种水稻较稳定的是TUB和EF1,dsRNA处理样品中较稳定的是TUB、AK、ACTB和EF1,混合样品中较稳定的是EF1、TUB和ACTB。【结论】为不同试验条件下选择合适的内参基因提供了参考,也有利于在二化螟基因表达研究中获得更加可靠准确的数据。
关键词
二化螟
内参基因
荧光定量PCR
基因表达
Keywords
Chilo suppressalis
reference gene
qRT-PCR
gene expression
分类号
Q755 [生物学—分子生物学]
S435.112.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
二化螟实时荧光定量PCR内参基因筛选和表达稳定性评价
徐红星
王国荣
鲁艳辉
杨亚军
郑许松
田俊策
吕仲贤
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019
10
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