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高粱千粒重全基因组关联分析和候选基因预测
被引量：
2
1
作者
邹桂花
丁延庆
+5 位作者
徐建霞
曹宁
陈合云
刘合芹
郑学强
张立异
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期2124-2136,共13页
千粒重是作物产量构成的三要素之一。增加粒重是提高作物产量的重要途径。为阐明高梁千粒重的遗传机理,本试验以主要来自于我国16个高粱种植省份的242份高粱品种(系)组成的关联群体为研究材料,借助覆盖全基因组的2015850个高质量SNPs标...
千粒重是作物产量构成的三要素之一。增加粒重是提高作物产量的重要途径。为阐明高梁千粒重的遗传机理,本试验以主要来自于我国16个高粱种植省份的242份高粱品种(系)组成的关联群体为研究材料,借助覆盖全基因组的2015850个高质量SNPs标记,采用多位点分析软件mrMLM 4.0 R软件包中的mrMLM、FASTmrMLM、FASTmrEMMA、ISIS EM-BLASSO、pLARmEB、pKWmEB 6种模型,对2018—2020年贵州贵阳、浙江杭州、海南乐东、海南陵水3年4点7个环境的高梁千粒重进行全基因组关联分析。结果表明,7个环境的高梁千粒重均表现连续正态分布,呈现明显的数量性状遗传特性,变异范围于10~50 g之间。利用6个模型共检测到323个与千粒重显著关联的数量性状核苷酸位点(QTNs),这些位点不均匀地分布在10条染色体上。单个QTN可解释0.4%~26.6%的表型变异。不同模型检测到的位点数目不同,FASTmrMLM模型最多,然后依次是pKWmEB模型、pLARmEB模型、mrMLM模型、ISIS EM-BLASSO模型和FASTmrEMMA模型。合并共同QTNs后得到96个显著影响千粒重的QTNs,其中4个QTNs与前人报道的高粱基因位点重叠,另有4个QTNs包含与水稻中克隆的粒重相关基因qGW7/GL7、BG2、OsARF4、RSR1、TGW6等同源的基因。本研究结果为探究高粱千粒重性状分子遗传机理和高粱分子设计育种提供了科学依据。
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关键词
高粱
千粒重
多位点全基因组关联分析
数量性状核苷酸(QTNs)
候选基因
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职称材料
西藏油菜产业现状及发展建议
被引量：
15
2
作者
华水金
杨勇
+8 位作者
唐琳
袁玉婷
次仁白珍
王晋雄
尼玛次仁
赵彩霞
南志强
李施蒙
杨广环
《西藏农业科技》
2022年第3期1-6,共6页
油菜是西藏自治区唯一的大宗油料作物,具有油用、菜用、花用、饲用、肥用、蜜用和药用等多种功能。大力发展油菜产业,对于保障我区油料安全,促进青稞等粮食作物永续安全,打造生态文明高地、农旅结合以及农牧共富等方面具有重大意义。该...
油菜是西藏自治区唯一的大宗油料作物,具有油用、菜用、花用、饲用、肥用、蜜用和药用等多种功能。大力发展油菜产业,对于保障我区油料安全,促进青稞等粮食作物永续安全,打造生态文明高地、农旅结合以及农牧共富等方面具有重大意义。该文从西藏自治区油菜产业现状、存在问题以及发展建议等方面进行剖析和讨论,为该区油菜产业高质量发展提供了思路。
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关键词
油菜
产业
生态文明
农旅结合
农牧共富
西藏
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职称材料
题名
高粱千粒重全基因组关联分析和候选基因预测
被引量：
2
1
作者
邹桂花
丁延庆
徐建霞
曹宁
陈合云
刘合芹
郑学强
张立异
机构
浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所/浙江省数字旱粮重点实验室
贵州省
农业
科学院
贵州省
旱
粮
研究所
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期2124-2136,共13页
基金
国家重点研发计划(2018YFD1000706-11)
浙江省农业新品种选育重大科技专项资助(2021C02064-6)
+1 种基金
浙江省数字旱粮重点实验室(2022E10012)
贵州省科技计划项目(黔科合基础[2020]1Y103)。
文摘
千粒重是作物产量构成的三要素之一。增加粒重是提高作物产量的重要途径。为阐明高梁千粒重的遗传机理,本试验以主要来自于我国16个高粱种植省份的242份高粱品种(系)组成的关联群体为研究材料,借助覆盖全基因组的2015850个高质量SNPs标记,采用多位点分析软件mrMLM 4.0 R软件包中的mrMLM、FASTmrMLM、FASTmrEMMA、ISIS EM-BLASSO、pLARmEB、pKWmEB 6种模型,对2018—2020年贵州贵阳、浙江杭州、海南乐东、海南陵水3年4点7个环境的高梁千粒重进行全基因组关联分析。结果表明,7个环境的高梁千粒重均表现连续正态分布,呈现明显的数量性状遗传特性,变异范围于10~50 g之间。利用6个模型共检测到323个与千粒重显著关联的数量性状核苷酸位点(QTNs),这些位点不均匀地分布在10条染色体上。单个QTN可解释0.4%~26.6%的表型变异。不同模型检测到的位点数目不同,FASTmrMLM模型最多,然后依次是pKWmEB模型、pLARmEB模型、mrMLM模型、ISIS EM-BLASSO模型和FASTmrEMMA模型。合并共同QTNs后得到96个显著影响千粒重的QTNs,其中4个QTNs与前人报道的高粱基因位点重叠,另有4个QTNs包含与水稻中克隆的粒重相关基因qGW7/GL7、BG2、OsARF4、RSR1、TGW6等同源的基因。本研究结果为探究高粱千粒重性状分子遗传机理和高粱分子设计育种提供了科学依据。
关键词
高粱
千粒重
多位点全基因组关联分析
数量性状核苷酸(QTNs)
候选基因
Keywords
Sorghum
1000-grain weight
multi-locus genome-wide association studies
quantitative trait nucleotides(QTNs)
candidate gene
分类号
S514 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
西藏油菜产业现状及发展建议
被引量：
15
2
作者
华水金
杨勇
唐琳
袁玉婷
次仁白珍
王晋雄
尼玛次仁
赵彩霞
南志强
李施蒙
杨广环
机构
西藏自治区农牧
科学院
农业
研究所
浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所/浙江省数字旱粮重点实验室
出处
《西藏农业科技》
2022年第3期1-6,共6页
基金
财政部与农业农村部项目:国家油菜产业技术体系(CARS-12)。
文摘
油菜是西藏自治区唯一的大宗油料作物,具有油用、菜用、花用、饲用、肥用、蜜用和药用等多种功能。大力发展油菜产业,对于保障我区油料安全,促进青稞等粮食作物永续安全,打造生态文明高地、农旅结合以及农牧共富等方面具有重大意义。该文从西藏自治区油菜产业现状、存在问题以及发展建议等方面进行剖析和讨论,为该区油菜产业高质量发展提供了思路。
关键词
油菜
产业
生态文明
农旅结合
农牧共富
西藏
Keywords
rapeseed
lndustry
ecological civilization
combination of agriculture and travelling
both enrichment for farmer and hersman
Tibet
分类号
S634.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高粱千粒重全基因组关联分析和候选基因预测
邹桂花
丁延庆
徐建霞
曹宁
陈合云
刘合芹
郑学强
张立异
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
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职称材料
2
西藏油菜产业现状及发展建议
华水金
杨勇
唐琳
袁玉婷
次仁白珍
王晋雄
尼玛次仁
赵彩霞
南志强
李施蒙
杨广环
《西藏农业科技》
2022
15
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职称材料
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