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表达谱芯片筛选獭兔毛色相关候选差异表达基因被引量：3: 1; 作者施丽娟秦立志 +3 位作者王文洲闫晓荣翁巧琴吴信生《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期568-575,共8页; 本研究旨在了解青紫蓝色獭兔和白色獭兔毛色形成的分子遗传学机理。试验分为3组,每组包含全同胞青紫蓝獭兔和白色獭兔各1只。利用安捷伦基因芯片技术分析不同分组之间差异基因表达情况,并通过实时荧光定量PCR方法对部分差异显著基因进... 展开更多; 关键词獭兔毛色差异表达基因基因芯片; 在线阅读下载PDF 职称材料

獭兔酪氨酸酶相关蛋白1(Tyrp1)基因序列分析及外显子多态性研究被引量：5: 2; 作者郝晔施丽娟 +5 位作者闫晓荣赵博昊朱杰陈阳翁巧琴吴信生《安徽农业科学》 CAS 2016年第9期164-167,196,共5页; [目的]探索獭兔酪氨酸相关蛋白1(Tyrp1)基因在毛色形成过程中的分子机制。[方法]对獭兔Tyrp1基因序列的核苷酸序列、编码产物的基本理化性质等进行预测和分析,同时利用PCR-SSCP(Single strand conformation polymorphism analysis of po... 展开更多; 关键词獭兔 Tyrp1 SNPS 序列分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

獭兔CREB1基因的编码区克隆、生物信息学及表达规律分析被引量：1: 3; 作者陈阳秦立志 +5 位作者赵博昊胡帅帅穆琳翁巧琴鲍国连吴信生《江苏农业科学》 2018年第23期165-168,共4页; 利用分子克隆技术和生物信息学方法,对獭兔CREB1基因编码区序列(coding sequence,CDS)进行克隆和生物信息学特征分析,同时比较其在不同毛色獭兔的皮肤组织中的表达水平差异。结果表明,CREB1基因CDS长984 bp,共编码327个氨基酸,在不同的... 展开更多; 关键词獭兔 CREB1基因克隆表达规律; 在线阅读下载PDF 职称材料

獭兔Tyr基因外显子3多态性检测及序列分析被引量：3: 4; 作者赵博昊施丽娟 +5 位作者闫晓荣郝晔朱杰陈阳翁巧琴吴信生《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第5期1111-1116,共6页; 以不同獭兔群体为研究对象,采用PCR-SSCP技术检测了Tyr基因外显子3的多态性,针对獭兔Tyr基因外显子3中的碱基突变,进行了生物信息学预测比较分析,以期为獭兔毛色形成机制提供分子生物学基础。结果表明,外显子3存在2个等位基因、3种基因... 展开更多; 关键词 Tyr基因外显子3 多态性序列分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名表达谱芯片筛选獭兔毛色相关候选差异表达基因被引量：3: 1; 作者施丽娟秦立志王文洲闫晓荣翁巧琴吴信生; 机构扬州大学动物科学与技术学院江苏省动物繁育与分子设计重点实验室浙江省余姚市欣农兔业有限公司; 出处《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期568-575,共8页; 基金现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-44-1) 江苏省高校优势学科建设工程资助项目(PAPD-2014-134); 文摘本研究旨在了解青紫蓝色獭兔和白色獭兔毛色形成的分子遗传学机理。试验分为3组,每组包含全同胞青紫蓝獭兔和白色獭兔各1只。利用安捷伦基因芯片技术分析不同分组之间差异基因表达情况,并通过实时荧光定量PCR方法对部分差异显著基因进行验证。差异表达分析结果显示,3组青紫蓝色獭兔对白色獭兔分别筛选出545、1 680和2 092个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),共有172个共同基因;GO(Gene Ontology)分类结果显示,这些基因主要参与细胞分化、增殖、凋亡、发育、离子转运、免疫应答等生物学过程。通过实时荧光定量PCR技术对Creb1、Wnt2、Gnaq和Gna14基因在组织样中的表达量进行检测,结果与表达谱芯片一致。通过表达谱芯片结果结合生物信息学分析和文献报道,筛选出了Creb1、TH、Wnt2、Gnaq、Dvl1、Mapk12等对毛色形成可能具有重要影响的候选基因。; 关键词獭兔毛色差异表达基因基因芯片; Keywords rex rabbit fur color DEGs gene chip; 分类号 S829.1 [农业科学—畜牧学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名獭兔酪氨酸酶相关蛋白1(Tyrp1)基因序列分析及外显子多态性研究被引量：5: 2; 作者郝晔施丽娟闫晓荣赵博昊朱杰陈阳翁巧琴吴信生; 机构扬州大学动物科学与技术学院江苏省动物繁育与分子设计重点实验室浙江省余姚市欣农兔业有限公司; 出处《安徽农业科学》 CAS 2016年第9期164-167,196,共5页; 基金现代农业产业技术体系建设专项(CARS-44-1) 江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD 2014-134); 文摘 [目的]探索獭兔酪氨酸相关蛋白1(Tyrp1)基因在毛色形成过程中的分子机制。[方法]对獭兔Tyrp1基因序列的核苷酸序列、编码产物的基本理化性质等进行预测和分析,同时利用PCR-SSCP(Single strand conformation polymorphism analysis of polymerase chain reaction products)技术检测Tyrp1基因CDS序列的多态性分布状况。[结果]信息学分析发现,TYRP1蛋白是不稳定的亲水性蛋白,有信号肽,具有酪氨酸酶家族特征性功能结构域。多态性检测发现仅在Tyrp1基因CDS的483 bp处存在1个C→T的同义突变,位于外显子2上,该碱基的突变没有造成氨基酸的改变(AUC→AUT,异亮氨酸)。Hardy-Weinberg平衡检验表明,青紫蓝色獭兔群体处于非平衡状态,白色獭兔群体处于平衡状态。青紫蓝兔群体为中度多态信息含量(0.25<PIC<0.50),白色獭兔群体为低度多态信息含量(PIC<0.25)。[结论]Tyrp1基因对獭兔的毛色有一定的影响。该研究结果可为獭兔毛色的选种选育提供一定的参考。; 关键词獭兔 Tyrp1 SNPS 序列分析; Keywords Rex rabbit Tyrp1 SNPs Sequence analysis; 分类号 S829.1 [农业科学—畜牧学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名獭兔CREB1基因的编码区克隆、生物信息学及表达规律分析被引量：1: 3; 作者陈阳秦立志赵博昊胡帅帅穆琳翁巧琴鲍国连吴信生; 机构扬州大学动物科学与技术学院浙江省余姚市欣农兔业有限公司浙江省农业科学院; 出处《江苏农业科学》 2018年第23期165-168,共4页; 基金现代农业产业技术体系建设专项资金(编号:CARS-44-A-1) 浙江省农业(畜禽)新品种选育重大科技专项(编号:2016C02054-10); 文摘利用分子克隆技术和生物信息学方法,对獭兔CREB1基因编码区序列(coding sequence,CDS)进行克隆和生物信息学特征分析,同时比较其在不同毛色獭兔的皮肤组织中的表达水平差异。结果表明,CREB1基因CDS长984 bp,共编码327个氨基酸,在不同的哺乳动物中具有较高的同源性,系统进化情况与其亲缘关系远近一致。经Hopfield、Swiss-model等预测发现,CREB1基因编码蛋白为亲水蛋白质,其二级结构包含α螺旋(h) 33. 33%、无规则卷曲(c) 44. 95%、延伸链(e) 21. 71%;三级结构为1条简单的螺旋链。荧光定量PCR结果显示,CREB1基因在黑色獭兔和青紫蓝色獭兔皮肤组织中的表达量极显著高于白色獭兔(P <0. 01),且在黑色獭兔中表达量最高。该结果为进一步探索CREB1基因在哺乳动物毛色形成过程中的功能奠定了基础。; 关键词獭兔 CREB1基因克隆表达规律; 分类号 S829.9 [农业科学—畜牧学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名獭兔Tyr基因外显子3多态性检测及序列分析被引量：3: 4; 作者赵博昊施丽娟闫晓荣郝晔朱杰陈阳翁巧琴吴信生; 机构扬州大学动物科学与技术学院江苏省动物繁育与分子设计重点实验室浙江省余姚市欣农兔业有限公司; 出处《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第5期1111-1116,共6页; 基金现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-44-1) 江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD 2014-134); 文摘以不同獭兔群体为研究对象,采用PCR-SSCP技术检测了Tyr基因外显子3的多态性,针对獭兔Tyr基因外显子3中的碱基突变,进行了生物信息学预测比较分析,以期为獭兔毛色形成机制提供分子生物学基础。结果表明,外显子3存在2个等位基因、3种基因型,A1118C的突变导致编码的赖氨酸变成了苏氨酸。白色和青紫蓝色獭兔各基因型和基因型频率的卡方适合性检验结果显示,BB基因型频率在青紫蓝色獭兔和白色獭兔中均较高,说明等位基因B是青紫蓝色獭兔群体和白色獭兔中的优势等位基因。Hardy-Weinberg平衡检验结果表明,两个群体均处于平衡状态。青紫蓝色獭兔群体的多态信息含量为中度多态(0.25<PIC<0.50),白色獭兔群体的多态信息含量为低度多态(PIC<0.25)。青紫蓝色獭兔杂合度较高,白色獭兔杂合度较低。生物信息学分析结果表明,外显子3中A1118C的突变未改变TYR蛋白质的理化性质、二硫键、跨膜结构、信号肽、磷酸化位、二级结构和三级结构,但改变了TYR蛋白质的糖基化位点,从而有可能影响到TYR蛋白质的功能。; 关键词 Tyr基因外显子3 多态性序列分析; Keywords Tyr gene exon 3 polymorphism sequence analysis; 分类号 S829.1 [农业科学—畜牧学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	表达谱芯片筛选獭兔毛色相关候选差异表达基因	施丽娟秦立志王文洲闫晓荣翁巧琴吴信生	《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心	2015	3	在线阅读下载PDF 职称材料
2	獭兔酪氨酸酶相关蛋白1(Tyrp1)基因序列分析及外显子多态性研究	郝晔施丽娟闫晓荣赵博昊朱杰陈阳翁巧琴吴信生	《安徽农业科学》 CAS	2016	5	在线阅读下载PDF 职称材料
3	獭兔CREB1基因的编码区克隆、生物信息学及表达规律分析	陈阳秦立志赵博昊胡帅帅穆琳翁巧琴鲍国连吴信生	《江苏农业科学》	2018	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	獭兔Tyr基因外显子3多态性检测及序列分析	赵博昊施丽娟闫晓荣郝晔朱杰陈阳翁巧琴吴信生	《江苏农业学报》 CSCD 北大核心	2016	3	在线阅读下载PDF 职称材料