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三唑磷对斑马鱼H19和Sox2OT基因表达调控的影响
被引量：
1
1
作者
乔嘉凯
杜羽亭
+3 位作者
贾龙略
张丹燕
黄涵年
郭江峰
《农药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期291-299,共9页
长链非编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA)是指长度大于200 nt且不具有编码蛋白质功能的一类RNA分子。当生物体暴露于环境污染物时,其lncRNA通常会异常表达,并与癌症等疾病的发生相关。采用亚致死浓度的三唑磷处理斑马鱼后,利用人...
长链非编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA)是指长度大于200 nt且不具有编码蛋白质功能的一类RNA分子。当生物体暴露于环境污染物时,其lncRNA通常会异常表达,并与癌症等疾病的发生相关。采用亚致死浓度的三唑磷处理斑马鱼后,利用人源基因芯片初步筛选出了异常表达的斑马鱼lncRNA,并通过生物信息学软件预测了与lncRNA相互作用的微RNA(micro RNA, miRNA)及其靶基因,最后通过实时荧光定量PCR验证了该miRNA及其靶基因在斑马鱼中的表达,从而构建起了长链非编码RNA-微RNA-信使RNA (lncRNA-miRNA-mRNA)的调控网络。荧光定量PCR检测结果表明:与空白对照组相比,经三唑磷处理后,斑马鱼lncRNA Sox2OT基因的表达下调了35%;lncRNA H19基因的表达上调了1.41倍,而与其可能存在相互作用的dre-let-7c基因的表达则下调了78%,同时dre-let-7c的靶基因ddx18的表达上调了2.11倍;差异均达显著水平(P <0.05)。据此推测,在三唑磷的作用下,lncRNA H19可能作为靶基因ddx18的竞争性内源RNA而与dre-let-7c发生相互作用,从而调控靶基因ddx18的表达。因此,lncRNA H19、dre-let-7c及ddx18都有可能作为生物标志物用于监测三唑磷对环境和生物体的影响。
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关键词
三唑磷
斑马鱼
长链非编码RNA-微RNA-信使RNA
生物信息学
基因表达
污染监测
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职称材料
题名
三唑磷对斑马鱼H19和Sox2OT基因表达调控的影响
被引量：
1
1
作者
乔嘉凯
杜羽亭
贾龙略
张丹燕
黄涵年
郭江峰
机构
浙江理工大学生命科学与医药学院生物工程研究所
浙江
经贸职业技术
学院
应用
工程
系
出处
《农药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期291-299,共9页
基金
浙江省自然科学基金(LY15B070012)
文摘
长链非编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA)是指长度大于200 nt且不具有编码蛋白质功能的一类RNA分子。当生物体暴露于环境污染物时,其lncRNA通常会异常表达,并与癌症等疾病的发生相关。采用亚致死浓度的三唑磷处理斑马鱼后,利用人源基因芯片初步筛选出了异常表达的斑马鱼lncRNA,并通过生物信息学软件预测了与lncRNA相互作用的微RNA(micro RNA, miRNA)及其靶基因,最后通过实时荧光定量PCR验证了该miRNA及其靶基因在斑马鱼中的表达,从而构建起了长链非编码RNA-微RNA-信使RNA (lncRNA-miRNA-mRNA)的调控网络。荧光定量PCR检测结果表明:与空白对照组相比,经三唑磷处理后,斑马鱼lncRNA Sox2OT基因的表达下调了35%;lncRNA H19基因的表达上调了1.41倍,而与其可能存在相互作用的dre-let-7c基因的表达则下调了78%,同时dre-let-7c的靶基因ddx18的表达上调了2.11倍;差异均达显著水平(P <0.05)。据此推测,在三唑磷的作用下,lncRNA H19可能作为靶基因ddx18的竞争性内源RNA而与dre-let-7c发生相互作用,从而调控靶基因ddx18的表达。因此,lncRNA H19、dre-let-7c及ddx18都有可能作为生物标志物用于监测三唑磷对环境和生物体的影响。
关键词
三唑磷
斑马鱼
长链非编码RNA-微RNA-信使RNA
生物信息学
基因表达
污染监测
Keywords
triazophos
zebrafish(Danio rerio)
lncRNA-miRNA-mRNA
bioinformatics
gene expression
pollution monitoring
分类号
X503.225 [环境科学与工程—环境工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
三唑磷对斑马鱼H19和Sox2OT基因表达调控的影响
乔嘉凯
杜羽亭
贾龙略
张丹燕
黄涵年
郭江峰
《农药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
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