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基于人工智能算法和数字病理切片对非酒精性脂肪性肝病病理特征的识别效果
被引量:
1
1
作者
孙丹辉
荣义辉
+8 位作者
廖心怡
潘雅婷
王珏
黄萍
朱思越
柳苏桐
王亚妮
杜帆
于观贞
《海军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期1000-1006,共7页
目的开发基于人工智能算法的非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)病理特征识别模型,探究模型能否识别并可视化脂肪变性细胞、炎症细胞和纤维化等病理特征。方法选择65只NAFLD小鼠的肝组织H-E染色和天狼猩红染色病理切片各65张,通过数字化扫描获...
目的开发基于人工智能算法的非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)病理特征识别模型,探究模型能否识别并可视化脂肪变性细胞、炎症细胞和纤维化等病理特征。方法选择65只NAFLD小鼠的肝组织H-E染色和天狼猩红染色病理切片各65张,通过数字化扫描获得数字病理切片。对于H-E染色切片,使用CaseViewer 2.3软件在放大200、300、400倍后截取病变部位图像各2张,共获得390张脂肪变性细胞病理图像和390张炎症细胞病理图像;将图像上传至Horizope标注平台进行手动标注,然后通过数据增强得到2340张脂肪变性细胞图像及2340张炎症细胞图像;按4∶1∶1划分为训练集、验证集和测试集,其中训练集(1560张)、验证集(390张)用于U-Net深度学习模型的训练学习和参数迭代,测试集(390张)用于模型的识别分析。采用Dice相似系数(DSC)、平均交互比(MIoU)、平均准确度(MA)和灵敏度对模型性能进行评估。对于天狼猩红染色切片,使用CaseViewer 2.3软件在放大50倍后进行全视野截取,采用了颜色特征提取算法进行纤维化识别。对130张数字病理切片进行人工NAFLD活动度积分(NAS)评分和机器评分,并计算和分析脂肪变性细胞面积占比(PFA)、炎症细胞密度(DIC)和纤维化面积占比(RFA)。结果基于人工智能算法的NAFLD病理特征识别模型识别脂肪变性细胞的DSC为0.87,MIoU为0.80,MA为0.88,灵敏度为0.84;识别炎症细胞的DSC为0.84,MIoU为0.78,MA为0.85,灵敏度为0.80。65张病理切片的PFA为0.371(0.013~0.743),DIC为288(19~894)/mm^(2),RFA为0.0485±0.0254,PFA、DIC、RFA均与机器评分和人工NAS评分呈正相关(r_(s)=0.953和0.928、0.883和0.869、0.887和0.749,P均<0.001)。结论基于人工智能算法的NAFLD病理特征识别模型有良好的表现,能够帮助病理医师识别NAFLD的病理特征、提高识别效率与准确率。
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关键词
非酒精性脂肪性肝病
脂肪变性
炎症细胞
纤维化
U-Net
深度学习
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职称材料
海洋中药氢化珊瑚钙防治化疗药物外渗性皮肤溃疡的实验研究
2
作者
廖心怡
潘雅婷
+3 位作者
唐美霞
邓娅婷
徐家华
于观贞
《海军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期1303-1309,共7页
目的探讨海洋中药氢化珊瑚钙对表柔比星所致小鼠皮肤外渗性溃疡的防护作用,为海洋中药氢化珊瑚钙的临床应用提供依据。方法建立表柔比星所致小鼠皮肤外渗性溃疡模型,将模型小鼠分为对照组(予以基础处理及生理盐水冲洗)和实验组(除予以...
目的探讨海洋中药氢化珊瑚钙对表柔比星所致小鼠皮肤外渗性溃疡的防护作用,为海洋中药氢化珊瑚钙的临床应用提供依据。方法建立表柔比星所致小鼠皮肤外渗性溃疡模型,将模型小鼠分为对照组(予以基础处理及生理盐水冲洗)和实验组(除予以基础处理及生理盐水冲洗外,另予以早、中、晚氢化珊瑚钙0.375 g/cm^(2)局部均匀涂抹创口各1次)。观察并记录对照组及实验组小鼠的皮肤外渗性溃疡面积、程度和愈合时间。在连续用药15 d后,切除溃疡组织,用H-E染色观察病理形态学改变,免疫组织化学染色检测溃疡部位皮肤及皮下组织中Ki-67和氧化应激相关指标血红素加氧酶1(HO-1)、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶2(NOX2)、诱导型一氧化氮合酶2(iNOS2)和超氧化物歧化酶1(SOD1)的表达情况。结果对照组小鼠的皮肤外渗性溃疡发生率为100.0%(5/5),而实验组为60.0%(3/5)。实验组的溃疡面积小于对照组(P<0.05),愈合速度快于对照组。H-E染色显示对照组小鼠皮下结缔组织增生、组织结构紊乱、毛囊扩张、鳞状上皮增厚,而实验组小鼠皮下组织结构稍显紊乱、少见毛囊扩张、鳞状上皮稍厚。免疫组织化学染色显示实验组小鼠皮下组织中Ki-67表达强于对照组,对照组中iNOS2、NOX2的表达高于实验组(P均<0.05),对照组中HO-1、SOD1的表达低于实验组(P均<0.05)。结论海洋中药氢化珊瑚钙对表柔比星外渗所致的皮肤溃疡有良好的防护作用。
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关键词
海洋中药
氢化珊瑚钙
表柔比星
化疗药物外渗
外渗性溃疡
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职称材料
基于复杂系统中因果关系的单细胞病理学
3
作者
于观贞
苏金珠
陈颖
《海军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期168-173,共6页
病理学从微观角度展现了生物组织发育、分化、成熟和凋亡的复杂变化状态,单细胞分析技术为病理学复杂系统的研究提供了更多的信息。肿瘤是由肿瘤细胞和周围微环境组成的复杂生态系统。在病理学上,肿瘤中细胞各异、分布和生理功能千差万...
病理学从微观角度展现了生物组织发育、分化、成熟和凋亡的复杂变化状态,单细胞分析技术为病理学复杂系统的研究提供了更多的信息。肿瘤是由肿瘤细胞和周围微环境组成的复杂生态系统。在病理学上,肿瘤中细胞各异、分布和生理功能千差万别,并且受自身、周围环境和治疗方法的调节,自成复杂系统。利用复杂系统中的因果判定方法,可以揭示单细胞复杂的调节作用,以及不同类型的肿瘤细胞与患者治疗方案、治疗效果、疾病复发和生存时间之间的因果关系。本文以肿瘤为例,阐述基于复杂系统中因果关系的单细胞病理学的意义和研究方法。
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关键词
复杂系统
因果关系
单细胞病理学
肿瘤病理学
人工智能
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职称材料
题名
基于人工智能算法和数字病理切片对非酒精性脂肪性肝病病理特征的识别效果
被引量:
1
1
作者
孙丹辉
荣义辉
廖心怡
潘雅婷
王珏
黄萍
朱思越
柳苏桐
王亚妮
杜帆
于观贞
机构
北京大学国际医院感染性疾病科
上海中医药大学附属龙华医院肿瘤科
上海中医药大学附属龙华医院脾胃病
研究
所
浙江数字内容研究院数字医疗与人工智能实验室
出处
《海军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期1000-1006,共7页
基金
上海中医药大学附属龙华医院高层次人才引进科研启动经费(LH02.51.002)
文摘
目的开发基于人工智能算法的非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)病理特征识别模型,探究模型能否识别并可视化脂肪变性细胞、炎症细胞和纤维化等病理特征。方法选择65只NAFLD小鼠的肝组织H-E染色和天狼猩红染色病理切片各65张,通过数字化扫描获得数字病理切片。对于H-E染色切片,使用CaseViewer 2.3软件在放大200、300、400倍后截取病变部位图像各2张,共获得390张脂肪变性细胞病理图像和390张炎症细胞病理图像;将图像上传至Horizope标注平台进行手动标注,然后通过数据增强得到2340张脂肪变性细胞图像及2340张炎症细胞图像;按4∶1∶1划分为训练集、验证集和测试集,其中训练集(1560张)、验证集(390张)用于U-Net深度学习模型的训练学习和参数迭代,测试集(390张)用于模型的识别分析。采用Dice相似系数(DSC)、平均交互比(MIoU)、平均准确度(MA)和灵敏度对模型性能进行评估。对于天狼猩红染色切片,使用CaseViewer 2.3软件在放大50倍后进行全视野截取,采用了颜色特征提取算法进行纤维化识别。对130张数字病理切片进行人工NAFLD活动度积分(NAS)评分和机器评分,并计算和分析脂肪变性细胞面积占比(PFA)、炎症细胞密度(DIC)和纤维化面积占比(RFA)。结果基于人工智能算法的NAFLD病理特征识别模型识别脂肪变性细胞的DSC为0.87,MIoU为0.80,MA为0.88,灵敏度为0.84;识别炎症细胞的DSC为0.84,MIoU为0.78,MA为0.85,灵敏度为0.80。65张病理切片的PFA为0.371(0.013~0.743),DIC为288(19~894)/mm^(2),RFA为0.0485±0.0254,PFA、DIC、RFA均与机器评分和人工NAS评分呈正相关(r_(s)=0.953和0.928、0.883和0.869、0.887和0.749,P均<0.001)。结论基于人工智能算法的NAFLD病理特征识别模型有良好的表现,能够帮助病理医师识别NAFLD的病理特征、提高识别效率与准确率。
关键词
非酒精性脂肪性肝病
脂肪变性
炎症细胞
纤维化
U-Net
深度学习
Keywords
non-alcoholic fatty liver disease
steatosis
inflammatory cells
fibrosis
U-Net
deep learning
分类号
R575.5 [医药卫生—消化系统]
R365 [医药卫生—病理学]
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职称材料
题名
海洋中药氢化珊瑚钙防治化疗药物外渗性皮肤溃疡的实验研究
2
作者
廖心怡
潘雅婷
唐美霞
邓娅婷
徐家华
于观贞
机构
上海中医药大学附属龙华医院肿瘤科
浙江数字内容研究院数字医疗与人工智能实验室
出处
《海军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期1303-1309,共7页
基金
上海中医药大学附属龙华医院高层次人才引进项目(LH02.51.002)
上海市大学生创新创业训练计划项目(S202110268118).
文摘
目的探讨海洋中药氢化珊瑚钙对表柔比星所致小鼠皮肤外渗性溃疡的防护作用,为海洋中药氢化珊瑚钙的临床应用提供依据。方法建立表柔比星所致小鼠皮肤外渗性溃疡模型,将模型小鼠分为对照组(予以基础处理及生理盐水冲洗)和实验组(除予以基础处理及生理盐水冲洗外,另予以早、中、晚氢化珊瑚钙0.375 g/cm^(2)局部均匀涂抹创口各1次)。观察并记录对照组及实验组小鼠的皮肤外渗性溃疡面积、程度和愈合时间。在连续用药15 d后,切除溃疡组织,用H-E染色观察病理形态学改变,免疫组织化学染色检测溃疡部位皮肤及皮下组织中Ki-67和氧化应激相关指标血红素加氧酶1(HO-1)、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶2(NOX2)、诱导型一氧化氮合酶2(iNOS2)和超氧化物歧化酶1(SOD1)的表达情况。结果对照组小鼠的皮肤外渗性溃疡发生率为100.0%(5/5),而实验组为60.0%(3/5)。实验组的溃疡面积小于对照组(P<0.05),愈合速度快于对照组。H-E染色显示对照组小鼠皮下结缔组织增生、组织结构紊乱、毛囊扩张、鳞状上皮增厚,而实验组小鼠皮下组织结构稍显紊乱、少见毛囊扩张、鳞状上皮稍厚。免疫组织化学染色显示实验组小鼠皮下组织中Ki-67表达强于对照组,对照组中iNOS2、NOX2的表达高于实验组(P均<0.05),对照组中HO-1、SOD1的表达低于实验组(P均<0.05)。结论海洋中药氢化珊瑚钙对表柔比星外渗所致的皮肤溃疡有良好的防护作用。
关键词
海洋中药
氢化珊瑚钙
表柔比星
化疗药物外渗
外渗性溃疡
Keywords
marine traditional Chinese medicine
coral calcium hydride
epirubicin
extravasation of chemotherapeutic drugs
extravasated ulcer
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
基于复杂系统中因果关系的单细胞病理学
3
作者
于观贞
苏金珠
陈颖
机构
浙江数字内容研究院数字医疗与人工智能实验室
海军军医大学(第二军医大学)第一附属医院消化内科
出处
《海军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期168-173,共6页
基金
国家自然科学基金面上项目(81972721)。
文摘
病理学从微观角度展现了生物组织发育、分化、成熟和凋亡的复杂变化状态,单细胞分析技术为病理学复杂系统的研究提供了更多的信息。肿瘤是由肿瘤细胞和周围微环境组成的复杂生态系统。在病理学上,肿瘤中细胞各异、分布和生理功能千差万别,并且受自身、周围环境和治疗方法的调节,自成复杂系统。利用复杂系统中的因果判定方法,可以揭示单细胞复杂的调节作用,以及不同类型的肿瘤细胞与患者治疗方案、治疗效果、疾病复发和生存时间之间的因果关系。本文以肿瘤为例,阐述基于复杂系统中因果关系的单细胞病理学的意义和研究方法。
关键词
复杂系统
因果关系
单细胞病理学
肿瘤病理学
人工智能
Keywords
complex systems
causality
single-cell pathology
tumor pathology
artificial intelligence
分类号
R730.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于人工智能算法和数字病理切片对非酒精性脂肪性肝病病理特征的识别效果
孙丹辉
荣义辉
廖心怡
潘雅婷
王珏
黄萍
朱思越
柳苏桐
王亚妮
杜帆
于观贞
《海军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
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职称材料
2
海洋中药氢化珊瑚钙防治化疗药物外渗性皮肤溃疡的实验研究
廖心怡
潘雅婷
唐美霞
邓娅婷
徐家华
于观贞
《海军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
基于复杂系统中因果关系的单细胞病理学
于观贞
苏金珠
陈颖
《海军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
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