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AS-PCR方法检测中国人群CYP2C19基因多态性
被引量:
7
1
作者
薛丽
叶玉兴
+1 位作者
易国辉
白玉杰
《海南医学院学报》
CAS
2010年第9期1101-1105,1110,共6页
目的:建立一种快速、灵敏的细胞色素氧化酶P4502C19基因多态性检测方法。方法:分离外周血淋巴细胞基因组DNA,分别用一对等位基因特异性(allele-specific,AS)的反向引物与共用正向引物进行PCR扩增,通过电泳分析对应的PCR产物来判断CYP2C1...
目的:建立一种快速、灵敏的细胞色素氧化酶P4502C19基因多态性检测方法。方法:分离外周血淋巴细胞基因组DNA,分别用一对等位基因特异性(allele-specific,AS)的反向引物与共用正向引物进行PCR扩增,通过电泳分析对应的PCR产物来判断CYP2C19基因型。在AS引物3′端倒数第三位或第二位引入错配碱基改进特异性。采用优化后方法对278例健康人进行CYP2C19基因型分析。结果:AS-PCR可检测CYP2C19基因多态性,引入第二个错配碱基可提高检测特异性。经直接测序验证结果完全一致。结论:建立和优化的AS-PCR方法适用于CYP2C19基因多态性快速检测。
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关键词
细胞色素氧化酶2C19
遗传多态性
基因型
等位基因特异性PCR
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职称材料
金纳米微粒DNA芯片检测EGFR基因突变
2
作者
薛丽
费晶晶
+1 位作者
宋毅
白玉杰
《海南医学院学报》
CAS
2012年第8期1019-1023,共5页
目的:研制以金纳米微粒标记和银染色信号放大技术为基础的DNA芯片,用于快速检测表皮生长因子受体(EGFR)基因突变。方法:氨基修饰的寡核苷酸探针固定于醛基化玻璃片基制备DNA芯片,5′-生物素标记引物用于PCR扩增EGFR基因第18、19、20、2...
目的:研制以金纳米微粒标记和银染色信号放大技术为基础的DNA芯片,用于快速检测表皮生长因子受体(EGFR)基因突变。方法:氨基修饰的寡核苷酸探针固定于醛基化玻璃片基制备DNA芯片,5′-生物素标记引物用于PCR扩增EGFR基因第18、19、20、21外显子片段,杂交后含互补序列的PCR产物结合于芯片,金纳米微粒借助表面包被的链亲和素识别标记于PCR产物5′-端的生物素而与之结合,再经银染色法放大杂交信号,依据芯片杂交结果判读EGFR基因突变,并用DNA直接测序法进行验证。结果:所制备的DNA芯片可快速检测肿瘤组织标本中EGFR基因突变,检测敏感性达到10-9 mol/L,可检出标本中5%的基因突变。结论:所制备的DNA芯片具有高特异性和敏感性,且操作简便,适用于临床肿瘤组织标本基因突变的快速检测。
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关键词
表皮生长因子受体
DNA芯片
金纳米微粒
银染色法
药物基因组学
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职称材料
题名
AS-PCR方法检测中国人群CYP2C19基因多态性
被引量:
7
1
作者
薛丽
叶玉兴
易国辉
白玉杰
机构
海南
医学
院科学实验
中心
浙江大学-迪诺遗传与基因组医学研究中心
出处
《海南医学院学报》
CAS
2010年第9期1101-1105,1110,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(30760282)~~
文摘
目的:建立一种快速、灵敏的细胞色素氧化酶P4502C19基因多态性检测方法。方法:分离外周血淋巴细胞基因组DNA,分别用一对等位基因特异性(allele-specific,AS)的反向引物与共用正向引物进行PCR扩增,通过电泳分析对应的PCR产物来判断CYP2C19基因型。在AS引物3′端倒数第三位或第二位引入错配碱基改进特异性。采用优化后方法对278例健康人进行CYP2C19基因型分析。结果:AS-PCR可检测CYP2C19基因多态性,引入第二个错配碱基可提高检测特异性。经直接测序验证结果完全一致。结论:建立和优化的AS-PCR方法适用于CYP2C19基因多态性快速检测。
关键词
细胞色素氧化酶2C19
遗传多态性
基因型
等位基因特异性PCR
Keywords
CYP2C19
Genetic polymorphism
Genotype
Allele-specific PCR
分类号
Q343.15 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
金纳米微粒DNA芯片检测EGFR基因突变
2
作者
薛丽
费晶晶
宋毅
白玉杰
机构
海南
医学
院科学实验
中心
浙江大学-迪诺遗传与基因组医学研究中心
海南
医学
院海南省干细胞
研究
所
出处
《海南医学院学报》
CAS
2012年第8期1019-1023,共5页
基金
海南省重点科技项目(080204)~~
文摘
目的:研制以金纳米微粒标记和银染色信号放大技术为基础的DNA芯片,用于快速检测表皮生长因子受体(EGFR)基因突变。方法:氨基修饰的寡核苷酸探针固定于醛基化玻璃片基制备DNA芯片,5′-生物素标记引物用于PCR扩增EGFR基因第18、19、20、21外显子片段,杂交后含互补序列的PCR产物结合于芯片,金纳米微粒借助表面包被的链亲和素识别标记于PCR产物5′-端的生物素而与之结合,再经银染色法放大杂交信号,依据芯片杂交结果判读EGFR基因突变,并用DNA直接测序法进行验证。结果:所制备的DNA芯片可快速检测肿瘤组织标本中EGFR基因突变,检测敏感性达到10-9 mol/L,可检出标本中5%的基因突变。结论:所制备的DNA芯片具有高特异性和敏感性,且操作简便,适用于临床肿瘤组织标本基因突变的快速检测。
关键词
表皮生长因子受体
DNA芯片
金纳米微粒
银染色法
药物基因组学
Keywords
EGFR; Microarray; Gold nanoparticle; Silver staining; Pharmacogenomics
分类号
Q343.15 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
AS-PCR方法检测中国人群CYP2C19基因多态性
薛丽
叶玉兴
易国辉
白玉杰
《海南医学院学报》
CAS
2010
7
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职称材料
2
金纳米微粒DNA芯片检测EGFR基因突变
薛丽
费晶晶
宋毅
白玉杰
《海南医学院学报》
CAS
2012
0
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