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分子场快速计算及在蛋白质识别研究中的应用
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作者 张繁 王章野 +1 位作者 吴韬 彭群生 《计算机科学与探索》 CSCD 2013年第3期227-235,共9页
蛋白质识别关键区域的研究对揭示生命现象的本质规律,提高药物设计效率,降低新药物开发的成本和周期有重大的应用价值。但由于蛋白质大分子结构的高度复杂性,一般的计算机系统难以对蛋白质识别过程中结构与功能的连续性变化实现快速动... 蛋白质识别关键区域的研究对揭示生命现象的本质规律,提高药物设计效率,降低新药物开发的成本和周期有重大的应用价值。但由于蛋白质大分子结构的高度复杂性,一般的计算机系统难以对蛋白质识别过程中结构与功能的连续性变化实现快速动态分析。设计并实现了一种基于GPU/CPU异构的集群系统,根据生物计算的特点对异构集群进行数据结构和算法设计,建立起基于GPU的Kd-tree构造和访问的高效算法,以提高系统并行计算的性能。在此基础上对蛋白质分子场的动态时变序列进行快速计算,对结果进行分类,能快速高效地确定出蛋白质的相互作用关键区域。该方法得到了相应的生化实验结果验证,为揭示蛋白质作用机制提供了一种高效直观的新方法。 展开更多
关键词 生物计算 第一性原理 并行计算 分子对接 蛋白质识别
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二维十字排列椭圆孔声子晶体带隙研究 被引量:1
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作者 高楠 李剑 +1 位作者 鲍荣浩 陈伟球 《浙江大学学报(工学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第4期811-818,共8页
采用有限元及实验方法,研究二维十字排列椭圆孔声子晶体中弹性波传播的带隙以及人为引入的夹杂对带隙的调控.当声子晶体薄板沿板厚方向均匀施加面内激励时,将激发面内的动力响应,对应于平面应力状态.基于逆向思维,针对二维十字排列椭圆... 采用有限元及实验方法,研究二维十字排列椭圆孔声子晶体中弹性波传播的带隙以及人为引入的夹杂对带隙的调控.当声子晶体薄板沿板厚方向均匀施加面内激励时,将激发面内的动力响应,对应于平面应力状态.基于逆向思维,针对二维十字排列椭圆孔声子晶体薄板,建立平面有限元模型,计算该模型沿晶格ΓX方向的波动传输特性,分析孔洞长短轴之比、孔隙率和线缺陷等因素对带隙及弹性波传播特性的影响.制作与计算模型同尺寸的声子晶体试样进行传输特性实验,测试结果与有限元仿真结果吻合.结果表明,带隙的宽度随着椭圆孔长短轴比例的增加而增大,可以通过引入合适的线缺陷来反向调控声子晶体的带隙. 展开更多
关键词 声子晶体 十字排列椭圆孔 带隙 弹性波调控
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基于L-S理论的压电球壳广义热冲击分析 被引量:4
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作者 刘承斌 刘文耀 +2 位作者 陈伟球 王惠明 吕朝锋 《浙江大学学报(工学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1185-1193,共9页
基于L-S广义热弹性理论,针对压电球壳受表面球对称热冲击作用下的热弹性问题进行分析.从三维压电弹性理论基本方程出发,利用Laplace变换,建立耦合的6阶状态方程;采用层合近似模型,将状态方程转化为关于径向坐标的常系数状态方程.利用界... 基于L-S广义热弹性理论,针对压电球壳受表面球对称热冲击作用下的热弹性问题进行分析.从三维压电弹性理论基本方程出发,利用Laplace变换,建立耦合的6阶状态方程;采用层合近似模型,将状态方程转化为关于径向坐标的常系数状态方程.利用界面连续条件得到球壳内、外状态变量的整体传递关系,结合球壳内、外边界条件,可以确定频域内所有状态变量,通过数值反变换获得时域解.数值算例给出热冲击作用下压电球壳的位移、应力、电势和温度等物理量的分布规律,考察热松弛时间对热冲击作用效果的影响. 展开更多
关键词 L-S广义热弹性 压电球壳 LAPLACE变换 状态空间法 热冲击
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周期结构后屈曲新算法及其应用 被引量:3
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作者 黄屹澜 高楠 +1 位作者 鲍荣浩 陈伟球 《计算力学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期509-515,共7页
提出了周期结构后屈曲分析的一种新算法。在屈曲点附近,通过加载模型和诱导后屈曲边值问题之间的相互切换,避开屈曲点附近刚度矩阵的奇异性,并诱导结构产生预期的后屈曲变形,避免了以往后屈曲算法中引入几何初始缺陷后对系统带来的可能... 提出了周期结构后屈曲分析的一种新算法。在屈曲点附近,通过加载模型和诱导后屈曲边值问题之间的相互切换,避开屈曲点附近刚度矩阵的奇异性,并诱导结构产生预期的后屈曲变形,避免了以往后屈曲算法中引入几何初始缺陷后对系统带来的可能影响。通过对三种由超弹性材料所构成的周期孔隙结构的后屈曲分析,验证了本文所提出的后屈曲算法的有效性和灵活性。分析了周期孔隙材料多向加载对屈曲模式转换的影响,以及后屈曲变形对弹性波传播带隙的影响,为周期结构中弹性波传播的调控提供良好的基础。 展开更多
关键词 周期结构 孔隙软材料 后屈曲 带隙 弹性波调控
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力电耦合偏场理论:回顾、比较与展望 被引量:2
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作者 伍斌 张春利 +1 位作者 张传增 陈伟球 《力学进展》 EI CSCD 北大核心 2016年第1期1-94,共94页
力电耦合固体的非线性连续介质理论最早出现于20世纪50年代,而成熟于70年代.80年代末、90年代初则因智能材料与结构的兴起而又得到了新的发展,引起了较为广泛的关注,但应用上以线性分析为主.21世纪初以来,力电耦合软材料因其潜在的应用... 力电耦合固体的非线性连续介质理论最早出现于20世纪50年代,而成熟于70年代.80年代末、90年代初则因智能材料与结构的兴起而又得到了新的发展,引起了较为广泛的关注,但应用上以线性分析为主.21世纪初以来,力电耦合软材料因其潜在的应用前景激发了众多的研究兴趣.由于牵涉到大变形,必须在一般非线性连续介质力学的框架内进行问题的建模和开展定量分析,因此力电耦合固体的非线性理论重新得到了大家的重视,出现了很多新版本.本文旨在阐述力电耦合固体非线性连续介质理论一般框架的基础上,采用3个构型的表述方式,较为详细地给出拉格朗日描述和更新拉格朗日描述下的力电耦合偏场理论,甄别不同理论表述版本之间的异同,以廓清目前文献中的混乱现象,为今后的相关研究提供理论指导.最后,本文讨论和展望了力电耦合偏场理论在不同研究领域的若干研究重点及其未来发展趋势. 展开更多
关键词 力电耦合 非线性连续介质力学 偏场理论 表述 比较
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铁电驻极体-液晶高弹体光电转换器性能分析
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作者 李无穷 李铁风 +1 位作者 洪樟连 曲绍兴 《材料科学与工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期423-426,445,共5页
基于在紫外光照下可变形的液晶高弹体与铁电驻极体材料,设计了一种光电转换器模型器件。该模型器件能实现在紫外光照射下的电信号输出功能。建立了光电耦合分析模型,并分析了紫外光光强对产生感应电荷的影响。结果表明,该模型器件可指... 基于在紫外光照下可变形的液晶高弹体与铁电驻极体材料,设计了一种光电转换器模型器件。该模型器件能实现在紫外光照射下的电信号输出功能。建立了光电耦合分析模型,并分析了紫外光光强对产生感应电荷的影响。结果表明,该模型器件可指导开发一种能够测量一定光强范围内紫外光强度的光电传感器。 展开更多
关键词 铁电驻极体 液晶高弹体 光-电耦合
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