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大口黑鲈幼鱼肝脏抗大口黑鲈弹状病毒应答的转录组分析
1
作者
乔娣
雷宁
+3 位作者
朱俊杰
张超楠
王艳超
周玲
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期164-176,共13页
为探究大口黑鲈(Micropterus salmoides)对大口黑鲈弹状病毒(Micropterus salmoides rhabdovirus,MSRV)的抗病反应和代谢调控网络,揭示其抗病的免疫分子机制并为后续大口黑鲈的分子生物学研究提供基础数据,利用Illumina NovaSeq 6000测...
为探究大口黑鲈(Micropterus salmoides)对大口黑鲈弹状病毒(Micropterus salmoides rhabdovirus,MSRV)的抗病反应和代谢调控网络,揭示其抗病的免疫分子机制并为后续大口黑鲈的分子生物学研究提供基础数据,利用Illumina NovaSeq 6000测序平台,对MSRV感染的大口黑鲈易感组、抗病组和对照组的肝脏组织进行转录组测序分析,对所得基因的功能注释发现,被注释的差异基因主要与细胞过程、细胞、结合和催化活性等功能有关。KEGG通路富集分析结果显示,大口黑鲈肝脏组织在MSRV感染下高表达的差异基因富集在药物代谢-细胞色素P450、细胞色素P450对外源性药物的代谢作用、蛋白酶体、抗坏血酸和醛酸盐代谢、脂肪酸降解等代谢相关通路;进一步筛选免疫相关基因进行通路分析发现,与抗MSRV免疫应答相关的通路主要为NOD样受体信号传导、C型凝集素受体信号、细胞溶质DNA传感途径、Toll样受体信号传导和RIG-I样受体信号传导等。最后,通过qRT-PCR验证了差异基因的变化趋势与转录组测序分析结果的一致性,证明了转录组数据的可靠性。获得的差异基因和调控通路可为大口黑鲈抗MSRV免疫的分子机制和疾病防控研究提供理论基础。
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关键词
大口黑鲈
大口黑鲈弹状病毒
肝脏
转录组测序
差异表达基因
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职称材料
题名
大口黑鲈幼鱼肝脏抗大口黑鲈弹状病毒应答的转录组分析
1
作者
乔娣
雷宁
朱俊杰
张超楠
王艳超
周玲
机构
湖州师范
学院
生命
科学
学院
浙江
生态文明研究院
浙江大学环境科学与工程学院
邢台
学院
/河北省数字化淡水水产养殖技术重点实验室
出处
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期164-176,共13页
基金
浙江省农业新品种选育重大科技专项资金资助(2021C02069-2-02)。
文摘
为探究大口黑鲈(Micropterus salmoides)对大口黑鲈弹状病毒(Micropterus salmoides rhabdovirus,MSRV)的抗病反应和代谢调控网络,揭示其抗病的免疫分子机制并为后续大口黑鲈的分子生物学研究提供基础数据,利用Illumina NovaSeq 6000测序平台,对MSRV感染的大口黑鲈易感组、抗病组和对照组的肝脏组织进行转录组测序分析,对所得基因的功能注释发现,被注释的差异基因主要与细胞过程、细胞、结合和催化活性等功能有关。KEGG通路富集分析结果显示,大口黑鲈肝脏组织在MSRV感染下高表达的差异基因富集在药物代谢-细胞色素P450、细胞色素P450对外源性药物的代谢作用、蛋白酶体、抗坏血酸和醛酸盐代谢、脂肪酸降解等代谢相关通路;进一步筛选免疫相关基因进行通路分析发现,与抗MSRV免疫应答相关的通路主要为NOD样受体信号传导、C型凝集素受体信号、细胞溶质DNA传感途径、Toll样受体信号传导和RIG-I样受体信号传导等。最后,通过qRT-PCR验证了差异基因的变化趋势与转录组测序分析结果的一致性,证明了转录组数据的可靠性。获得的差异基因和调控通路可为大口黑鲈抗MSRV免疫的分子机制和疾病防控研究提供理论基础。
关键词
大口黑鲈
大口黑鲈弹状病毒
肝脏
转录组测序
差异表达基因
Keywords
Micropterus salmoides
M.salmoides rhabdovirus
Liver
Transcriptome sequencing
Differentially expressed genes
分类号
S941 [农业科学—水产养殖]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大口黑鲈幼鱼肝脏抗大口黑鲈弹状病毒应答的转录组分析
乔娣
雷宁
朱俊杰
张超楠
王艳超
周玲
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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