【目的】为开发假眼小绿叶蝉Empoasca vitis分子标记,采用高通量测序技术对假眼小绿叶蝉DNA进行了测序与分析。【方法】本研究基于Illumina Hi Seq测序技术,构建了PE文库(~400bp),对获得的测序数据利用生物信息学分析手段完成全基因...【目的】为开发假眼小绿叶蝉Empoasca vitis分子标记,采用高通量测序技术对假眼小绿叶蝉DNA进行了测序与分析。【方法】本研究基于Illumina Hi Seq测序技术,构建了PE文库(~400bp),对获得的测序数据利用生物信息学分析手段完成全基因组扫描,并进一步使用MISA分析鉴定基因组序列中出现的微卫星序列(SSR)。针对微卫星序列共设计10对引物,并使用3步法进行引物多态性筛选。【结果】共计检测Scaffold数量为183 194条,其中包含SSR的Scaffold共计1 545条,共计筛选出1 569个SSR位点。在假眼小绿叶蝉的微卫星中,共包括87种重复基元类型,二核苷酸与三核苷酸重复序列为主要重复类型,分别占SSRs总数的70.26%和27.84%;二核苷酸重复基元CA/TG和三核苷酸重复基元AAT/ATT是优势重复基元,分别占SSRs总数的33.96%和5.86%。在设计的10对引物中,5对具有多态性,在8个假眼小绿叶蝉个体中共发现16个等位基因。【结论】结果说明假眼小绿叶蝉SSR位点在多态性方面具有极大的可开发性,具有多态性的SSR位点可对假眼小绿叶蝉种群间的分化,种群间的扩散机理和途径及影响因素等问题提供分子视角。展开更多
为明确金属元素在白背飞虱Sogatella furcifera(Horváth)体内的分布及其含量动态,将白背飞虱长翅成虫在实验室中用超纯水分别饲养0,24,48,96h后测量其体重变化;并用电感耦合等离子体质谱(inductively coupledplasma mass spectrome...为明确金属元素在白背飞虱Sogatella furcifera(Horváth)体内的分布及其含量动态,将白背飞虱长翅成虫在实验室中用超纯水分别饲养0,24,48,96h后测量其体重变化;并用电感耦合等离子体质谱(inductively coupledplasma mass spectrometry,ICP-MS)检测各个处理虫体内12种金属元素(Cu,Zn,Cd,Mn,Ca,Fe,Na,As,U,Mg,K和Pb)的含量。以白背飞虱整个体重(W)、有机体组织重量(O)、体内可排泄内容物重量(E)及可排泄内容物排出体外的速率(r)为参数,构建其体重变化的修正指数模型Wt=O+E(1-r)t。基于白背飞虱体内金属元素总含量(WCt)为有机体组织内含量(OC)和可排泄内容物中含量(EC)按两者百分率(OPt和EPt)加权之和,即WCt=OC·OPt+EC·EPt,分别估计白背飞虱体内组织和可排泄内容物中金属元素含量。模拟分析结果表明:Cu,Zn,Cd,Mn和Ca这5种元素在白背飞虱组织内的含量显著高于其可排泄内容物中的含量(P<0.05),表明这些金属元素可被昆虫有机体组织吸收、积累,并稳定地存在于昆虫的有机体组织之中。Fe,Na,As,U,Mg,K和Pb这7种元素在白背飞虱有机体组织内的含量与其可排泄内容物中的含量接近,其在有机体组织中和可排泄内容物中的分布差异不显著(P>0.05),以相对平衡状态存在于白背飞虱有机体组织和可排泄内容物中。该分析方法可能为其他小型和微型昆虫体内金属元素的分布、积累、排泄的研究提供借鉴。展开更多
文摘为明确金属元素在白背飞虱Sogatella furcifera(Horváth)体内的分布及其含量动态,将白背飞虱长翅成虫在实验室中用超纯水分别饲养0,24,48,96h后测量其体重变化;并用电感耦合等离子体质谱(inductively coupledplasma mass spectrometry,ICP-MS)检测各个处理虫体内12种金属元素(Cu,Zn,Cd,Mn,Ca,Fe,Na,As,U,Mg,K和Pb)的含量。以白背飞虱整个体重(W)、有机体组织重量(O)、体内可排泄内容物重量(E)及可排泄内容物排出体外的速率(r)为参数,构建其体重变化的修正指数模型Wt=O+E(1-r)t。基于白背飞虱体内金属元素总含量(WCt)为有机体组织内含量(OC)和可排泄内容物中含量(EC)按两者百分率(OPt和EPt)加权之和,即WCt=OC·OPt+EC·EPt,分别估计白背飞虱体内组织和可排泄内容物中金属元素含量。模拟分析结果表明:Cu,Zn,Cd,Mn和Ca这5种元素在白背飞虱组织内的含量显著高于其可排泄内容物中的含量(P<0.05),表明这些金属元素可被昆虫有机体组织吸收、积累,并稳定地存在于昆虫的有机体组织之中。Fe,Na,As,U,Mg,K和Pb这7种元素在白背飞虱有机体组织内的含量与其可排泄内容物中的含量接近,其在有机体组织中和可排泄内容物中的分布差异不显著(P>0.05),以相对平衡状态存在于白背飞虱有机体组织和可排泄内容物中。该分析方法可能为其他小型和微型昆虫体内金属元素的分布、积累、排泄的研究提供借鉴。