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2009～2012年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA与NA基因的进化分析
被引量：
6
1
作者
吴英萍
崔大伟
+6 位作者
秦志梅
谢国良
杨先知
郑书发
余斐
范剑
陈瑜
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期272-275,共4页
目的研究杭州地区2009年至2012年甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)与神经氨酸酶(NA)的基因进化特征,分析该病毒的遗传变异和抗原的分子水平转变。方法用RT-PCR分别扩增甲型H1N1流感病毒HA基因和NA基因片段并进行测序,用DNAMAN和MEGA 4.0生物...
目的研究杭州地区2009年至2012年甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)与神经氨酸酶(NA)的基因进化特征,分析该病毒的遗传变异和抗原的分子水平转变。方法用RT-PCR分别扩增甲型H1N1流感病毒HA基因和NA基因片段并进行测序,用DNAMAN和MEGA 4.0生物信息学软件对HA和NA基因序列进行进化分析。结果建立的RT-PCR可成功检测HA(C)、HA(D)和NA基因,遗传进化分析结果表明,杭州地区甲型H1N1流感病毒的HA与NA氨基酸序列的亲缘系数与WHO推荐的病毒株及国内代表株的同源性均为98.9%～100%;三维构象结果表明,HA编码的蛋白质有5个位点发生改变,而NA编码的蛋白质仅发生2个位点改变。结论 2009年至2011年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA和NA基因序列与世界范围内流行的病毒参考株具有高度同源性,但HA与NA蛋白质表位存在某些氨基酸位点的改变。
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关键词
甲型H1N1流感病毒
血凝素
神经氨酸酶
建模
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职称材料
题名
2009～2012年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA与NA基因的进化分析
被引量：
6
1
作者
吴英萍
崔大伟
秦志梅
谢国良
杨先知
郑书发
余斐
范剑
陈瑜
机构
浙江大学医学院附属义乌医院检验科
浙江大学
医学院
附属
第一
医院
检验
科
出处
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期272-275,共4页
基金
"十二五"国家科技重大专项(No:2012ZX10004-210)
浙江省教育厅(N20110467)
文摘
目的研究杭州地区2009年至2012年甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)与神经氨酸酶(NA)的基因进化特征,分析该病毒的遗传变异和抗原的分子水平转变。方法用RT-PCR分别扩增甲型H1N1流感病毒HA基因和NA基因片段并进行测序,用DNAMAN和MEGA 4.0生物信息学软件对HA和NA基因序列进行进化分析。结果建立的RT-PCR可成功检测HA(C)、HA(D)和NA基因,遗传进化分析结果表明,杭州地区甲型H1N1流感病毒的HA与NA氨基酸序列的亲缘系数与WHO推荐的病毒株及国内代表株的同源性均为98.9%～100%;三维构象结果表明,HA编码的蛋白质有5个位点发生改变,而NA编码的蛋白质仅发生2个位点改变。结论 2009年至2011年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA和NA基因序列与世界范围内流行的病毒参考株具有高度同源性,但HA与NA蛋白质表位存在某些氨基酸位点的改变。
关键词
甲型H1N1流感病毒
血凝素
神经氨酸酶
建模
Keywords
influenza A （ H1 N1 ） virus
hemagglutinin
neuraminidase
modeling
分类号
R373.14 [医药卫生—病原生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2009～2012年杭州地区甲型H1N1流感病毒HA与NA基因的进化分析
吴英萍
崔大伟
秦志梅
谢国良
杨先知
郑书发
余斐
范剑
陈瑜
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013
6
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