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医学科学研究中的生物信息学应用 被引量:8
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作者 来茂德 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 2004年第2期91-94,共4页
生物信息学是研究生物信息处理 (采集、管理和分析应用 ) ,并从中提取生物学新知识的一门科学 ,它连接生物数据和医学科学研究。生物信息学在基因组学研究中发挥了不可替代的作用 ,并为解决生物系统的复杂问题提供了可能。对生物信息学... 生物信息学是研究生物信息处理 (采集、管理和分析应用 ) ,并从中提取生物学新知识的一门科学 ,它连接生物数据和医学科学研究。生物信息学在基因组学研究中发挥了不可替代的作用 ,并为解决生物系统的复杂问题提供了可能。对生物信息学的基本概念 ,同源性和相似性的区别作了介绍 ,并且对生物信息学在新基因发现、蛋白鉴定和生物芯片结果分析中的应用作了概述。 展开更多
关键词 信息科学 生物学 专业 医学 生物信息学 同源性 相似性 基因组学 蛋白质组学 生物芯片
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临床病理因素在结肠癌和直肠癌预后中的不同作用 被引量:11
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作者 徐芳英 翟美娟 +4 位作者 董健康 汪芬娟 金以森 朱益民 来茂德 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 2006年第3期303-310,共8页
目的:研究各临床病理因素对结肠癌和直肠癌预后影响的区别,并分析根治术后直肠癌患者的预后因素。方法:运用单因素及多因素COX比例风险模型分别对101例结肠癌、219例直肠癌及137例根治术后的直肠癌患者进行生存分析。结果:经单因素分析... 目的:研究各临床病理因素对结肠癌和直肠癌预后影响的区别,并分析根治术后直肠癌患者的预后因素。方法:运用单因素及多因素COX比例风险模型分别对101例结肠癌、219例直肠癌及137例根治术后的直肠癌患者进行生存分析。结果:经单因素分析显示,发生淋巴结转移、远处转移是结肠癌和直肠癌预后共同的不利因素,吸烟、浸润达浆膜外、未化疗和血清白蛋白含量低是结肠癌的可疑不利因素,印戒细胞癌、肿块大于6 cm、浸润达浆膜外、未行根治性手术和TNM分期高则是直肠癌的不利因素。根治术后的直肠癌病例,浸润深度深、发生淋巴结转移、脉管侵犯、肿瘤间质淋巴细胞浸润少、无C rohn样反应、肿瘤芽多、TNM分期高和尿糖阳性是不利因素。多因素分析显示,与结肠癌有关的独立预后因素为吸烟、淋巴结转移和血清白蛋白含量;直肠癌的独立预后因素包括远处转移、TNM分期和手术方案;根治术后的直肠癌患者独立预后因素包括脉管侵犯、淋巴结转移与尿糖。结论:吸烟、淋巴结转移和血清白蛋白含量是结肠癌的独立预后因素;远处转移、TNM分期和手术方案是直肠癌的独立预后因素。对于根治术后的直肠癌患者,脉管侵犯、淋巴结转移和尿糖是独立的预后因素。 展开更多
关键词 结肠肿瘤/病理学 直肠肿瘤/病理学 预后 比例危险度模型 存活率分析
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结肠正常黏膜和腺癌中差异表达基因的生物信息学分析 被引量:7
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作者 谷雪梅 张昊 来茂德 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 2004年第2期95-101,124,共8页
目的 :系统地分析由 SSH方法获得的结肠正常黏膜和腺癌的差异表达基因。方法 :构建基于 L inux的核酸自动分析平台 ,对用 SSH方法获得的 3个文库之一的 T- N差减文库进行分析。用半定量 RT- PCR对部分结果进行验证。结果 :成功构建了基... 目的 :系统地分析由 SSH方法获得的结肠正常黏膜和腺癌的差异表达基因。方法 :构建基于 L inux的核酸自动分析平台 ,对用 SSH方法获得的 3个文库之一的 T- N差减文库进行分析。用半定量 RT- PCR对部分结果进行验证。结果 :成功构建了基于 Linux的核酸自动分析平台 ,得到了 15个 contigs,其中与已知基因相匹配的有 13个(T- N) ,未与已知基因匹配或者意义未明的有 2个 ;部分基因的半定量 RT- PCR发现 ,人胸腺素 β4 (H omo Sapiensthymosin beta4 ,THY)和人乙型肝炎病毒 x抗原反式活化蛋白 2 (H omo Sapiens H bx Ag transactivated protein2 ,XTP)的表达从正常黏膜 -腺癌有逐步增高的趋势。结论 :构建基于 L inux的核酸自动分析平台是系统分析核酸序列的有效方法 ,根据对 3个文库的系统分析结果 ,为进一步阐明结肠肿瘤分子机制提供了许多有价值的信息。 展开更多
关键词 肠黏膜/病理学 腺癌/病理学 结肠肿瘤/病理学 基因表达 结肠腺癌 生物信息学 Linux
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β-catenin在结直肠肿瘤中的异常表达及其意义 被引量:9
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作者 黄琼 朱益民 +1 位作者 邢晓明 来茂德 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 2004年第2期121-124,共4页
目的 :研究 β- catenin在结直肠肿瘤中异常表达的意义。方法 :应用免疫组织化学 SP法 ,检测 β- catenin在腺癌患者正常黏膜、癌旁黏膜、腺癌组织中及其在腺瘤组织中的表达情况。结果 :在正常黏膜和癌旁黏膜中 ,β- catenin主要定位于... 目的 :研究 β- catenin在结直肠肿瘤中异常表达的意义。方法 :应用免疫组织化学 SP法 ,检测 β- catenin在腺癌患者正常黏膜、癌旁黏膜、腺癌组织中及其在腺瘤组织中的表达情况。结果 :在正常黏膜和癌旁黏膜中 ,β- catenin主要定位于细胞膜 (胞膜阳性率分别为 94 .6 %和 86 .5 % ) ,并有部分在胞浆中表达 (胞浆阳性率分别为 38.7%和5 5 .0 % ) ,胞核均为阴性 ;在腺瘤与腺癌中 ,其阳性染色主要定位于细胞浆 (胞浆阳性率分别为 85 .1%和 93.7% ) ,并有部分细胞核阳性 (分别为 12 .8%和 2 3.4 % ) ,胞膜阳性表达程度显著低于正常和癌旁黏膜 (P<0 .0 5 ) ,胞浆、胞核的表达高于正常和癌旁黏膜 (P<0 .0 5 ) ;而高、中分化腺癌在细胞浆的阳性表达率显著高于低分化腺癌 (分别为 10 0 %、95 .5 %、6 8.8% ,P<0 .0 5 ) ;在腺癌组织中β- catenin的胞浆阳性表达程度与腺癌的 Dukes分期相关 ,A期表达程度显著低于 B/C期。结论 :β- catenin在结直肠腺瘤、腺癌中胞浆的表达高于正常黏膜及癌旁黏膜 ;其表达与结直肠癌的分化程度及 Dukes分期相关 ,因此 ,β- catenin表达检测可以作为预后判断的参考指标之一。 展开更多
关键词 结肠直肠肿瘤/病理学 Β-CATENIN 免疫组织化学 预后
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