BLAST序列比对与生物医学文献检索 被引量：9

1

作者 丁六松 张宇伟 《情报杂志》 CSSCI 北大核心 2003年第4期74-75,共2页

生物信息学的急速发展及其数据库的急剧增长给文献检索提出了新课题。利用生物信息相关数据库需要结合生物信息学知识。本研究从新基因的名词与序列入手 ,介绍NCBI的ENTREZ、BLAST检索 ,阐明与基因相关的文献检索的方法与技巧 ,着重介绍... 生物信息学的急速发展及其数据库的急剧增长给文献检索提出了新课题。利用生物信息相关数据库需要结合生物信息学知识。本研究从新基因的名词与序列入手 ,介绍NCBI的ENTREZ、BLAST检索 ,阐明与基因相关的文献检索的方法与技巧 ,着重介绍了BLAST序列比对在信息检索中的步骤和作用。 展开更多

关键词 BLAST序列比对 生物医学文献检索 生物信息学 数据库 基因

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大鼠早期心肌缺血CX43免疫组化研究 被引量：2

2

作者 金利方 陈明方 +3 位作者 郑强 许敬尧 沈永浩 朱有法 《法医学杂志》 CAS CSCD 2006年第6期411-412,416,F0003,共4页

目的探讨早期心肌缺血的法医病理学诊断依据。方法通过建立大鼠心肌缺血模型,用免疫组化染色方法检测大鼠心肌缺血15、30、60、120、180min以及正常对照组心肌CX43的表达情况。结果在各组早期心肌缺血区内,见CX43阳性着色的分布与正常... 目的探讨早期心肌缺血的法医病理学诊断依据。方法通过建立大鼠心肌缺血模型,用免疫组化染色方法检测大鼠心肌缺血15、30、60、120、180min以及正常对照组心肌CX43的表达情况。结果在各组早期心肌缺血区内,见CX43阳性着色的分布与正常组相比,表现为部位的不同及数量上的差异。结论CX43的免疫组化染色对诊断早期心肌缺血有一定的价值,但尚需进一步研究证实。 展开更多

关键词 心肌缺血 免疫组化 CX43

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广泛软组织损伤肾肌红蛋白免疫组化研究 被引量：4

3

作者 刘迎春 朱有法 王立新 《法医学杂志》 CAS CSCD 2005年第4期241-243,共3页

目的探讨肌红蛋白对挤压综合征肾功能损害的病理形态学改变及法医病理学诊断价值。方法应用EnVision(两步法)免疫组化方法和LSAB免疫组化方法,对22例生前有较广泛肌肉软组织损伤的人尸体肾脏组织(损伤组)进行肌红蛋白检测,12例无上述病... 目的探讨肌红蛋白对挤压综合征肾功能损害的病理形态学改变及法医病理学诊断价值。方法应用EnVision(两步法)免疫组化方法和LSAB免疫组化方法,对22例生前有较广泛肌肉软组织损伤的人尸体肾脏组织(损伤组)进行肌红蛋白检测,12例无上述病史的人尸体肾脏组织作对照(对照组)。结果损伤组有8例肾远曲小管及集合管管腔管型染色呈阳性或强阳性,均见于伤后36h至10d死亡者;有7例近曲小管、远曲小管和集合管上皮腔缘附近的胞浆及腔面肌红蛋白阳性或强阳性,最早见于伤后8h死亡者,伤后24h至48h死亡者最为显著;余9例未见上述改变。对照组12例上述部位均为阴性。结论肌红蛋白管型堵塞肾小管和肌红蛋白对肾小管上皮的直接损害是挤压综合征肾功能衰竭的重要病理形态学基础,两者对挤压综合征的法医病理诊断均具有重要价值。 展开更多

关键词 挤压综合征 肌红蛋白 免疫组化 肾

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再生基因家族的研究 被引量：1

4

作者 张宇伟 丁六松 来茂德 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期601-606,共6页

再生基因家族自1988年被发现以来,其在糖尿病、炎症创伤与肿瘤尤其在消化系统肿瘤中的作用日渐被重视。越来越多的该家族成员被发现,并已开始考虑在临床治疗中应用。这些研究开始显示再生基因家族的潜在应用价值。

关键词 再生基因家族 糖尿病 肿瘤 临床治疗 应用价值

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T细胞非霍奇金淋巴瘤6号染色体长臂杂合性缺失的研究 被引量：1

5

作者 赵静 周韧 《实用医学杂志》 CAS 2007年第19期2975-2978,共4页

目的:检测48例T细胞非霍奇金淋巴瘤(T-NHL)6q14-26上12个高度多态性微卫星标记物的杂合性缺失(LOH)情况,确定与T-NHL相关的6q上的最小缺失区(RMDs),为寻找与T-NHL发病相关的抑癌基因提供有意义的信息。方法:选取6q14-26区段上12个多态... 目的:检测48例T细胞非霍奇金淋巴瘤(T-NHL)6q14-26上12个高度多态性微卫星标记物的杂合性缺失(LOH)情况,确定与T-NHL相关的6q上的最小缺失区(RMDs),为寻找与T-NHL发病相关的抑癌基因提供有意义的信息。方法:选取6q14-26区段上12个多态性微卫星标记,行聚合酶链式反应-单链长度多态性分析,检测LOH,确定发生LOH的最小重叠区段,并分析6qLOH与肿瘤样本临床病理特征的关系。结果:48例肿瘤样本中8例(17%)至少有一个位点出现LOH,12个标记物LOH的频率从8%到50%不等,RMD位于6q21-22,另发现一个发生LOH频率较高的部位位于6q25。6qLOH在低度恶性与高度恶性T-NHL患者之间差异有显著性(P=0.044)。结论:6qLOH与T-NHL的恶性程度有统计学相关性。6q21-22和6q25区段可能存在一个或多个候选肿瘤抑制基因,这些抑癌基因的失活可能在T-NHL的发病机制中发挥重要作用。 展开更多

关键词 淋巴瘤 非霍奇金 淋巴瘤 T细胞 肿瘤抑制基因 杂合性缺失 6号染色体长臂

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慢性淋巴细胞性白血病预后相关分子标记的研究进展 被引量：2

6

作者 毛洁 毛峥嵘 周韧 《浙江大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期250-256,共7页

慢性淋巴细胞性白血病(CLL)是成人白血病中最常见的一种。IGVH基因的突变状态是CLL患者最重要的预后标记,而Zeta链相关蛋白激酶(ZAP-70)可作为IGVH突变状态的替代标记。CD38是一种促使B细胞活化和增殖的Ⅱ类跨膜糖蛋白,能提高CLL细胞的... 慢性淋巴细胞性白血病(CLL)是成人白血病中最常见的一种。IGVH基因的突变状态是CLL患者最重要的预后标记,而Zeta链相关蛋白激酶(ZAP-70)可作为IGVH突变状态的替代标记。CD38是一种促使B细胞活化和增殖的Ⅱ类跨膜糖蛋白,能提高CLL细胞的生存率,促进其增殖,也可作为CLL的独立预后指标。另外,超过80%的CLL患者存在染色体畸变,最常见的异常是染色体的丢失,其中13q14缺失最为常见(35%);而最常见的染色体增加为12q的三体性(23%)。人类白细胞抗原G(HLA-G)表达增高预示CLL的恶性进展及其生存期的缩短。Toll样受体是天然免疫的重要组成部分,TLR激动剂与放化疗、单克隆抗体,以及肿瘤疫苗联合应用将给CLL的治疗带来重大突破。 展开更多

关键词 白血病 淋巴细胞 慢性 蛋白质酪氨酸激酶 染色体畸变 免疫球蛋白可变区 受体 细胞表面 预后

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星形胶质细胞对神经元作用的研究进展 被引量：5

7

作者 王建彪(综述) 竺可青(综述) 《浙江大学学报（医学版）》 CAS CSCD 2008年第5期531-536,共6页

星形胶质细胞能够释放多种胶质细胞源性递质,调节突触信号的传递;释放的雌激素、凝血栓蛋白、IL-1β和IL-6能够诱导突触的形成和神经干细胞的神经发生。此外,星形胶质细胞还能为神经元提供重要的营养和保护作用。星形胶质细胞可能是治... 星形胶质细胞能够释放多种胶质细胞源性递质,调节突触信号的传递;释放的雌激素、凝血栓蛋白、IL-1β和IL-6能够诱导突触的形成和神经干细胞的神经发生。此外,星形胶质细胞还能为神经元提供重要的营养和保护作用。星形胶质细胞可能是治疗某些神经系统疾病的新靶点。 展开更多

关键词 星形细胞/生理学 神经元/生理学 中枢神经系统/生理学

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中国人群中C6orf37第二外显子VNTR多态性的研究

8

作者 崔晶 王炜 +5 位作者 王敏 林洁 马裕 阮文静 徐静 来茂德 《浙江大学学报（医学版）》 CAS CSCD 2006年第4期354-359,共6页

目的:证实C 6orf 37编码区VNTR位点,检测其多态性在中国人群中的分布特点,并寻找VNTR多态性检测的理想方法。方法:用RT-PCR及测序证实C 6orf 37编码区的VNTR位点,并用SSLP和DHPLC两种方法对166例中国人进行VNTR基因分型。结果:C 6orf 3... 目的:证实C 6orf 37编码区VNTR位点,检测其多态性在中国人群中的分布特点,并寻找VNTR多态性检测的理想方法。方法:用RT-PCR及测序证实C 6orf 37编码区的VNTR位点,并用SSLP和DHPLC两种方法对166例中国人进行VNTR基因分型。结果:C 6orf 37基因的第二外显子区存在一个新的VNTR多态性位点,其核心序列为GGCGGCGACTTCGGC,编码5个氨基酸(G-G-D-F-G),重复3到5次。该位点存在3种等位基因:a(3次重复),b(4次重复),c(5次重复),6种基因型:a/a,b/b,c/c,a/b,a/c,b/c。在中国人群中的a、b、c等位基因频率分别为0.145,0.304,0.551。杂和度为0.583,多态信息含量为0.510。DHPLC与SSLP检测VNTR多态性的结果一致,但DHPLC具有快速、经济、高通量的特点。结论:C 6orf 37编码区存在一个高度多态性VNTR位点,DHPLC是大规模筛选VNTR多态性的理想方法。 展开更多

关键词 等位基因 多态现象 遗传 变性高压液相色谱 VNTR C6orf37 聚合酶链反应-单链长度多态性 中国人群

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胃癌中骨桥蛋白与OCT2的表达及意义 被引量：7

9

作者 张巧英 姚根有 +3 位作者 傅燕萍 赵仲生 张布衣 付琼 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期563-567,共5页

目的探讨骨桥蛋白(osteopontin,OPN)及转录因子OCT2在胃癌中的表达及其与临床病理参数及预后的关系。方法应用组织微阵列技术和免疫组化SP法检测99例胃癌组织中OPN蛋白与OCT2蛋白的表达情况。结果99例胃癌中OPN蛋白及OCT2蛋白的阳性表... 目的探讨骨桥蛋白(osteopontin,OPN)及转录因子OCT2在胃癌中的表达及其与临床病理参数及预后的关系。方法应用组织微阵列技术和免疫组化SP法检测99例胃癌组织中OPN蛋白与OCT2蛋白的表达情况。结果99例胃癌中OPN蛋白及OCT2蛋白的阳性表达率分别为60·61%、54·55%;OPN蛋白表达与肿瘤大小、浸润深度、脉管侵犯、淋巴结转移及远处转移呈正相关;OCT2蛋白表达也与肿瘤大小、浸润深度、脉管侵犯、淋巴结转移及远处转移呈正相关;OPN蛋白表达与OCT2蛋白表达呈正相关;OPN及OCT2蛋白阳性表达病例的平均生存时间和5年生存率均明显低于阴性表达的病例。结论OPN及OCT2蛋白表达可预测胃癌浸润和转移,是指导临床治疗及评估预后的有价指标。 展开更多

关键词 胃肿瘤 组织阵列分析 骨桥蛋白 OCT2 免疫组织化学

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接种卡介苗后发生全身播散性结核病致死1例 被引量：4

10

作者 毛峥嵘 徐英含 董复明 《法医学杂志》 CAS CSCD 2010年第2期143-144,共2页

案情及病史：某男婴，6个月，某年5月10日无明显诱因下发热，体温波动于39℃左右。次日入住某医院小儿科，予抗感染对症治疗，体温不降。5月19日胸部CT示“右上肺实变。两下肺感染”。5月20日起出现阵发性干咳。5月23日至28日到某大学... 案情及病史：某男婴，6个月，某年5月10日无明显诱因下发热，体温波动于39℃左右。次日入住某医院小儿科，予抗感染对症治疗，体温不降。5月19日胸部CT示“右上肺实变。两下肺感染”。5月20日起出现阵发性干咳。5月23日至28日到某大学附属医院抗感染治疗。5月27日“左腋下淋巴结”穿刺物病理检验示“干酪样坏死物及少量皮肤脂肪组织”。 展开更多

关键词 法医病理学 卡介苗 接种 血行播散性结核

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COX-2与结直肠癌早期发病的关系 被引量：7

11

作者 陈俭 来茂德 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 2004年第4期470-473,共4页

关键词 COX-2 结直肠癌 早期发病 环氧合酶 前列腺素

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生物信息学中的虚拟实验 被引量：4

12

作者 丁六松 张宇伟 《情报杂志》 CSSCI 北大核心 2003年第7期63-64,共2页

网络上出现的虚拟实验室可通过网络工具为科学家提供一个专门的环境 ,使他们更有效地利用现有资源 ,经济有效地加速科研进程。虚拟生物信息学实验的内容包括电子Northern、电子克隆、数字化差异显示、SAGE分析、电子原位杂交、电子PCR... 网络上出现的虚拟实验室可通过网络工具为科学家提供一个专门的环境 ,使他们更有效地利用现有资源 ,经济有效地加速科研进程。虚拟生物信息学实验的内容包括电子Northern、电子克隆、数字化差异显示、SAGE分析、电子原位杂交、电子PCR等。在此作介绍并简要举例分析。 展开更多

关键词 生物信息学 虚拟实验 SAGE分析 电子Northern 电子克隆 数字化差异显示 电子PCR

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非同位素反向Northern筛选法 被引量：4

13

作者 张宇伟 来茂德 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期353-355,共3页

此文介绍了一种非同位素简单快速的反向Northern筛选方法。采用非同位素法标记探针,操作简便,不涉及污染环境。在杂交过程中采用三次校正,结果可靠,重复性好。该方法能有效地,高通量地验证差异表达基因。

关键词 非同位素 反向 NORTHERN 抑制性差减杂交(SSH)

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GSH减少可加强MNNG对P38 MAPK磷酸化

14

作者 竺可青 朱建伟 章锁江 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期1495-1497,共3页

目的:了解低浓度N-甲基-N’-硝基-N-亚硝基胍(MNNG)对P38 MAPK的影响,以及谷胱甘肽(GSH)在该信号通路中的调节作用。方法:用L-丁硫氨酸-S,R-磺基(L-buthionine-S,R-sulfoximine)减少细胞谷胱甘肽含量后,采用Western印迹法比较MNNG处理... 目的:了解低浓度N-甲基-N’-硝基-N-亚硝基胍(MNNG)对P38 MAPK的影响,以及谷胱甘肽(GSH)在该信号通路中的调节作用。方法:用L-丁硫氨酸-S,R-磺基(L-buthionine-S,R-sulfoximine)减少细胞谷胱甘肽含量后,采用Western印迹法比较MNNG处理组和对照组P38MAPK磷酸化状态,观察MNNG对P38磷酸化状态的影响。用光密度扫描仪测定各蛋白质条带吸光值。“P”为磷酸化P38MAPK的吸收值,“T”为总P38MAPK吸收值。在各时点以对照组磷酸化率P/T为1·0,计算MNNG组的相对磷酸化率。结果:BSO预处理24h后,MNNG处理2·5h的相对磷酸化率为0·84,2·5h处理后换DMEM全培养基3h的相对磷酸化率2·19。结论:细胞内GSH含量降低可促进P38MAPK的活性。 展开更多

关键词 P38MAP激酶 谷胱甘肽 N-甲基-N’-硝基-N-亚硝基胍

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IGFBP-rP1与癌变:抑癌基因抑或癌基因蛋白?

15

作者 邵丽娜 来茂德 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 2002年第6期637-640,共4页

关键词 IGFBP-rP1 癌基因蛋白质类 基因 抑制 肿瘤

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分泌型溶酶体与疾病 被引量：1

16

作者 王俊伟 周逸蒋 竺可青 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期130-134,共5页

传统意义的溶酶体被认为是细胞内消化途径的终点站,是含有多种水解酶和脂肪酶的细胞器,可以消化蛋白以及膜结构等.某些特殊类型的细胞中存在分泌型溶酶体,它既有胞内消化的功能,又有调节分泌功能.在调节溶酶体胞吐的蛋白质中,Rab27a蛋... 传统意义的溶酶体被认为是细胞内消化途径的终点站,是含有多种水解酶和脂肪酶的细胞器,可以消化蛋白以及膜结构等.某些特殊类型的细胞中存在分泌型溶酶体,它既有胞内消化的功能,又有调节分泌功能.在调节溶酶体胞吐的蛋白质中,Rab27a蛋白起到了核心作用.相关基因特别是控制胞吐的基因突变,可造成各种免疫缺陷综合症.星型胶质细胞溶酶体胞吐释放ATP,在神经元和胶质细胞之间传递信息.分泌型溶酶体还参与了肿瘤细胞浸润、转移的过程. 展开更多

关键词 分泌型溶酶体 胞吐 Rab27a

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