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毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定
被引量：
1
1
作者
蒋政勤
周明兵
+2 位作者
郑浩
季航
徐芷馨
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期917-927,共11页
长末端重复序列(LTR)反转录转座子广泛存在于植物基因组中,本质是一段可移动的脱氧核糖核酸(DNA)序列。大多数LTR反转录转座子在外界环境变化下能够被激活转录,对环境变化做出响应。为研究毛竹基因组中的LTR反转录转座子的转录活性及在...
长末端重复序列(LTR)反转录转座子广泛存在于植物基因组中,本质是一段可移动的脱氧核糖核酸(DNA)序列。大多数LTR反转录转座子在外界环境变化下能够被激活转录,对环境变化做出响应。为研究毛竹基因组中的LTR反转录转座子的转录活性及在非生物环境胁迫下表达量的具体变化,克隆和鉴定了1个毛竹Phyllostachys edulis反转录转座子PHRE7。该转座子全长为6 073 bp,属于Ty1-copia家族中的Tork分支,LTR序列相似性为96.7%,插入时间为126.923万a前。对毛竹实生苗分别进行辐照(30,50,70 Gy),甲基化抑制剂(50,100,150μmol·L^-1),高温(42℃),低温(4℃),高盐(0.1,0.2,0.3 mol·L^-1)等5种不同胁迫处理,通过定量荧光聚合酶链式反应(PCR)检测,PHRE7在INT,RT和RH等3个结构域中的表达量仅在辐照及0.2~0.3 mol·L^-1高盐处理下随处理强度的上升而下降,其余所有处理(甲基化抑制剂、高温、低温、高盐0.1~0.2 mol·L^-1)的表达量都随处理强度呈上升趋势。这些结果表明:PHRE7转座子是一个具有转录活性的LTR反转录转座子,且外界非生物环境胁迫对其表达模式有较大影响,表明PHRE7转座子能够响应外界环境变化。
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关键词
植物学
毛竹
LTR反转录转座子
生物信息学
逆境胁迫
转录活性
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职称材料
营林措施对森林土壤N_2O排放影响的研究进展
被引量：
9
2
作者
王会来
刘娟
+3 位作者
姜培坤
周国模
李永夫
吴家森
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期18-30,共13页
森林土壤是大气N_2O重要的排放源。施肥、采伐、火烧、林下植被管理等营林措施和土地利用变化改变了土壤理化性质和土壤微气候,显著影响森林土壤N_2O的产生与排放。综述了森林土壤N_2O排放对不同营林措施的响应,探讨了营林措施影响土壤N...
森林土壤是大气N_2O重要的排放源。施肥、采伐、火烧、林下植被管理等营林措施和土地利用变化改变了土壤理化性质和土壤微气候,显著影响森林土壤N_2O的产生与排放。综述了森林土壤N_2O排放对不同营林措施的响应,探讨了营林措施影响土壤N_2O排放的主要机理,并提出目前研究的不足和未来研究的重点。总体而言,森林转变为农田、草地后增加了土壤N_2O排放,而农田和草地恢复成人工林后减弱了土壤N_2O排放;天然林转换为人工林或次生林后土壤N_2O排放没有明确结论;森林生态系统"氮饱和"程度使得森林土壤N_2O排放对施肥呈非线性响应,即初期无明显响应、中期缓慢增加和后期急剧增加;火烧一般增加土壤N_2O排放;采伐改变土壤温度、含水量、有机碳的分解和利用等,从而增强森林土壤N_2O排放能力;剔除林下植被提高土壤温度,加快了表层土壤有机碳的分解矿化,促进土壤N_2O排放;种植固氮植物增加了土壤有机碳和土壤氮含量,土壤N_2O排放增强。今后的研究应更多地关注多种因素和气候变化对林地土壤N_2O排放影响的内在机理以及氨氧化细菌、硝化细菌和反硝化细菌等微生物对各种干扰因素的响应机制。
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关键词
土壤N2O排放
营林措施
土地利用变化
施肥
采伐
火烧
林下植被管理
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职称材料
题名
毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定
被引量：
1
1
作者
蒋政勤
周明兵
郑浩
季航
徐芷馨
机构
浙江
农林大学
省部共建亚热带森林培育国家重点实验室
浙江农林大学浙江省竹资源与高效利用协同中心
出处
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期917-927,共11页
基金
国家自然科学基金资助项目（31870656,31470615）
浙江省大学生科技创新活动计划暨新苗人才计划资助项目(2018R412004)
文摘
长末端重复序列(LTR)反转录转座子广泛存在于植物基因组中,本质是一段可移动的脱氧核糖核酸(DNA)序列。大多数LTR反转录转座子在外界环境变化下能够被激活转录,对环境变化做出响应。为研究毛竹基因组中的LTR反转录转座子的转录活性及在非生物环境胁迫下表达量的具体变化,克隆和鉴定了1个毛竹Phyllostachys edulis反转录转座子PHRE7。该转座子全长为6 073 bp,属于Ty1-copia家族中的Tork分支,LTR序列相似性为96.7%,插入时间为126.923万a前。对毛竹实生苗分别进行辐照(30,50,70 Gy),甲基化抑制剂(50,100,150μmol·L^-1),高温(42℃),低温(4℃),高盐(0.1,0.2,0.3 mol·L^-1)等5种不同胁迫处理,通过定量荧光聚合酶链式反应(PCR)检测,PHRE7在INT,RT和RH等3个结构域中的表达量仅在辐照及0.2~0.3 mol·L^-1高盐处理下随处理强度的上升而下降,其余所有处理(甲基化抑制剂、高温、低温、高盐0.1~0.2 mol·L^-1)的表达量都随处理强度呈上升趋势。这些结果表明:PHRE7转座子是一个具有转录活性的LTR反转录转座子,且外界非生物环境胁迫对其表达模式有较大影响,表明PHRE7转座子能够响应外界环境变化。
关键词
植物学
毛竹
LTR反转录转座子
生物信息学
逆境胁迫
转录活性
Keywords
botany
Phyllostachys edulis
LTR retrotransposon
bioinformatics analysis
abiotic environmental stress
transcriptional activity
分类号
S718.3 [农业科学—林学]
S795.72 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
营林措施对森林土壤N_2O排放影响的研究进展
被引量：
9
2
作者
王会来
刘娟
姜培坤
周国模
李永夫
吴家森
机构
浙江
农林大学
亚热带森林培育国家重点实验室
浙江
农林大学
浙江省
森林生态系统碳循环与固碳减排重点实验室
浙江农林大学浙江省竹资源与高效利用协同中心
出处
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期18-30,共13页
基金
国家自然科学基金项目(31700540)
浙江省自然科学基金项目(LY15C160004)资助~~
文摘
森林土壤是大气N_2O重要的排放源。施肥、采伐、火烧、林下植被管理等营林措施和土地利用变化改变了土壤理化性质和土壤微气候,显著影响森林土壤N_2O的产生与排放。综述了森林土壤N_2O排放对不同营林措施的响应,探讨了营林措施影响土壤N_2O排放的主要机理,并提出目前研究的不足和未来研究的重点。总体而言,森林转变为农田、草地后增加了土壤N_2O排放,而农田和草地恢复成人工林后减弱了土壤N_2O排放;天然林转换为人工林或次生林后土壤N_2O排放没有明确结论;森林生态系统"氮饱和"程度使得森林土壤N_2O排放对施肥呈非线性响应,即初期无明显响应、中期缓慢增加和后期急剧增加;火烧一般增加土壤N_2O排放;采伐改变土壤温度、含水量、有机碳的分解和利用等,从而增强森林土壤N_2O排放能力;剔除林下植被提高土壤温度,加快了表层土壤有机碳的分解矿化,促进土壤N_2O排放;种植固氮植物增加了土壤有机碳和土壤氮含量,土壤N_2O排放增强。今后的研究应更多地关注多种因素和气候变化对林地土壤N_2O排放影响的内在机理以及氨氧化细菌、硝化细菌和反硝化细菌等微生物对各种干扰因素的响应机制。
关键词
土壤N2O排放
营林措施
土地利用变化
施肥
采伐
火烧
林下植被管理
Keywords
Soil N2O emission
Forest management
Land-use change
Fertilization
Felling
Burning
Understory management
分类号
S718.5 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定
蒋政勤
周明兵
郑浩
季航
徐芷馨
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
营林措施对森林土壤N_2O排放影响的研究进展
王会来
刘娟
姜培坤
周国模
李永夫
吴家森
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
9
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