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嫁接嵌合体红肉胡柚实生后代四倍体发掘与形态特征评价
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作者 姜楠 王刚 +3 位作者 张小琴 陈翔 张敏 张迟 《果树学报》 北大核心 2025年第5期969-978,共10页
[目的]从周缘嵌合体红肉胡柚(Citrusunshiu+C.aurantium)实生后代中发掘多倍体,对四倍体单株性状进行评价,为柑橘周缘嵌合体实生后代用于育种奠定基础。[方法]采用实生播种和流式细胞术,筛选红肉胡柚多倍体后代;利用分布于柑橘9条染色体... [目的]从周缘嵌合体红肉胡柚(Citrusunshiu+C.aurantium)实生后代中发掘多倍体,对四倍体单株性状进行评价,为柑橘周缘嵌合体实生后代用于育种奠定基础。[方法]采用实生播种和流式细胞术,筛选红肉胡柚多倍体后代;利用分布于柑橘9条染色体的28对SSR引物对多倍体单株进行遗传鉴定,并对多倍体单株进行形态学、解剖学评价和叶片色素含量测定。[结果]红肉胡柚种子42%为单胚型,58%为多胚型,每粒种子1~4个胚。从红肉胡柚120株实生后代中获得1株四倍体,该四倍体与红肉胡柚L2细胞层供体常山胡柚的SSR分子标记带型一致。与同龄的实生二倍体后代相比,四倍体单株叶片气孔密度显著减少,叶片宽度、厚度、表皮层、栅栏组织和海绵组织均显著增厚,保卫细胞长度和宽度均显著增大,叶长、节间距和叶形指数显著减小,叶肉细胞内脂肪球密度显著增加,淀粉粒密度显著减少。叶片叶绿素含量和类胡萝卜素含量显著升高。[结论]从周缘嵌合体红肉胡柚实生后代中发掘到四倍体单株,为柑橘周缘嵌合体实生后代用于育种提供了种质资源。 展开更多
关键词 红肉胡柚 周缘嫁接嵌合体 四倍体 SSR
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黄瓜R2R3-MYB亚家族鉴定及生物信息学分析 被引量:3
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作者 郭玉婷 杜长霞 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期286-296,共11页
【目的】深入研究黄瓜Cucumis sativus R2R3-MYB亚家族成员的相关功能。【方法】利用生物信息学手段分析黄瓜全基因组,鉴定R2R3-MYB亚家族成员,对其系统进化关系、蛋白理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋白质... 【目的】深入研究黄瓜Cucumis sativus R2R3-MYB亚家族成员的相关功能。【方法】利用生物信息学手段分析黄瓜全基因组,鉴定R2R3-MYB亚家族成员,对其系统进化关系、蛋白理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋白质互作进行分析。【结果】黄瓜全基因组中含99个具有典型结构域的R2R3-MYB转录因子,蛋白序列含195~552个氨基酸,有保守基序及氨基酸位点;基因在染色体上分布不均匀;大部分亚家族成员蛋白质的不稳定指数大于40,属于不稳定蛋白。顺式作用调控元件分析发现:大部分基因启动子区所含元件与激素调节、MYB结合位点、胁迫密切相关。【结论】通过黄瓜全基因组鉴定,获得黄瓜基因组99个R2R3-MYB家族成员,分为30个亚组,映射于7条染色体上,该家族成员的上游启动子区含逆境相关作用元件。 展开更多
关键词 黄瓜 R2R3-MYB 转录因子 全基因组鉴定
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黄瓜HAK基因家族的鉴定与生物信息学分析
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作者 卢朝辉 樊怀福 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期38-47,共10页
为了深入研究黄瓜K^(+)转运蛋白基因家族KUP/HAK/KT的相关功能,本研究通过全基因组分析技术等生物信息学手段鉴定CsHAK家族成员,分析其进化关系、基因结构,蛋白质三级结构、顺式作用元件及共线性关系。结果发现,黄瓜基因组共有15个CsHA... 为了深入研究黄瓜K^(+)转运蛋白基因家族KUP/HAK/KT的相关功能,本研究通过全基因组分析技术等生物信息学手段鉴定CsHAK家族成员,分析其进化关系、基因结构,蛋白质三级结构、顺式作用元件及共线性关系。结果发现,黄瓜基因组共有15个CsHAK基因,不均匀分布在黄瓜染色体chr1、chr3、chr4、chr5、chr7上,亚细胞定位预测发现CsHAK基因位于细胞质膜;CsHAK基因家族可分为3个亚家族,大部分家族成员包含12个保守基序和K_trans保守功能结构域,基因启动子区所含元件与激素调节、光响应、胁迫密切相关;CsHAK家族成员之间发生2个串联重复事件,Ks/Ka值均小于1,表明其进化受纯化选择作用。研究结果为进一步深入挖掘CsHAKs在黄瓜生长发育及逆境胁迫响应中的功能及作用机制提供了理论基础。 展开更多
关键词 黄瓜 高亲和K^(+)转运蛋白 基因家族 全基因组鉴定
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