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题名毛竹甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因的克隆与序列分析
被引量：10
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作者
杨洋
张智俊
罗淑萍
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机构
浙江农林大学亚热带森林培育技术国家重点实验室培育基地
新疆农业大学
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出处
《经济林研究》
2010年第3期7-13,24,共8页
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基金
浙江省自然科学基金项目"竹笋快速纤维化的分子机理"(Y307469)
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文摘
为了分离毛竹抗逆相关基因,利用RT-PCR和RACE技术,从毛竹叶片中克隆出甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因PeGAPDH的全长cDNA序列(GenBank登录号GU356597)。该序列全长1368bp,完整阅读框1013bp,编码一个具有337个氨基酸残基的蛋白。利用生物信息学软件对PeGAPDH蛋白进行了分析,结果表明:PeGAPDH蛋白分子量为36.643kDa,等电点为6.33;该蛋白含有2个保守区,即N端的NAD+结合区和靠近C端的催化功能区。PeGAPDH是一种亲水性、非分泌型蛋白,定位于膜的表面,属于氧化还原酶系,主要在中间产物代谢和能量代谢中起作用。蛋白质进化树的构建结果表明:PeGAPDH与水稻等禾本科植物来自细胞质中的GAPDH蛋白的亲缘关系很近,同双子叶植物的GAPDH则相差较远。
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关键词
生物信息学
毛竹
甘油醛-3-磷酸脱氢酶
基因克隆
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Keywords
bioinformatics
Phyllostachys edulis
glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase（GAPDH）
gene clone
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分类号
Q943.2
[生物学—植物学]
S795.7
[农业科学—林木遗传育种]
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