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皮肤恶性黑色素瘤自噬相关lncRNA预后模型的建立与应用
1
作者
胡巾帼
沈榕
+1 位作者
沈一杰
叶佳莉
《临床皮肤科杂志》
北大核心
2025年第2期78-86,共9页
目的:基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析皮肤恶性黑色素瘤(cutaneous malignant melanoma,CMM)患者转录组数据,构建CMM患者自噬相关长链非编码RNA(lncRNA)的预后模型。方法:从TCGA数据库中提取CMM患者的转录组数据和临床信息,从人类...
目的:基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析皮肤恶性黑色素瘤(cutaneous malignant melanoma,CMM)患者转录组数据,构建CMM患者自噬相关长链非编码RNA(lncRNA)的预后模型。方法:从TCGA数据库中提取CMM患者的转录组数据和临床信息,从人类自噬相关数据库(HADb)中获取自噬相关基因,根据Pearson相关系数筛选自噬相关lncRNA。采用单因素Cox和多因素Cox回归分析,确定与CMM预后相关的自噬相关lncRNA并构建CMM患者的预后模型和列线图。通过CMM转录组数据,进行功能和通路富集分析。最后通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测自噬相关lncRNA在正常细胞和肿瘤细胞中的表达情况。结果:多因素Cox回归分析结果显示10个自噬相关lncRNA具有独立的预后价值(P值均<0.001),其中9种lncRNA(AC012236.1、LINC00324、HCP5、THCAT158、LINC01943、AC242842.1、AC083799.1、HLA-DQB1-AS1和AL133371.2)属于保护性lncRNA,与CMM患者较好的预后有关,PCED1B-AS1属于风险性lncRNA,与较差的预后有关。生存分析结果显示,高风险组CMM患者总体生存率低。列线图结果显示,基于自噬相关lncRNA的风险评分是CMM的独立预后因素。此外,qRT-PCR结果提示自噬相关lncRNA AC012236.1、LINC00324、HCP5、AC242842.1、AC083799.1、HLA-DQB1-AS1、AL133371.2和PCED1B-AS1在人永生化角质形成细胞(HaCaT)细胞系和人恶性黑色素瘤细胞(A375)细胞系的表达差异有统计学意义(P<0.05)。结论:自噬相关lncRNA可能与CMM预后有关,这些lncRNA为CMM患者预后生物标志物和治疗靶点的研究提供了线索,为CMM的临床治疗提供新的视角。
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关键词
恶性黑色素瘤
皮肤
自噬相关lncRNA
预后
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职称材料
“杜仲-当归”调控NLPR3炎症小体对骨关节炎大鼠改善作用的研究
被引量：
9
2
作者
王鑫昱
陈亦鹏
+1 位作者
马永力
何君妃
《中国临床药理学与治疗学》
CAS
CSCD
2023年第7期751-757,共7页
目的:探究药对“杜仲-当归”对骨关节炎(osteoarthritis,OA)大鼠膝组织的改善效果及对NLPR3炎症小体的调控。方法:24只雄性SD大鼠随机挑选18只采用前交叉韧带切断术(ACLT)进行OA造模,随后将大鼠分为正常组、OA模型组、杜仲-当归组和阳...
目的:探究药对“杜仲-当归”对骨关节炎(osteoarthritis,OA)大鼠膝组织的改善效果及对NLPR3炎症小体的调控。方法:24只雄性SD大鼠随机挑选18只采用前交叉韧带切断术(ACLT)进行OA造模,随后将大鼠分为正常组、OA模型组、杜仲-当归组和阳性药物组,每组6只,后两组分别给与“杜仲-当归”或西乐葆和奥泰灵混合液治疗8周。收集大鼠外周血,ELISA测定IL-1β、IL-6、IL-18、TNF-α水平;另取大鼠膝关节软骨组织,HE染色观察病理改变,番红-固绿染色观察软骨钙化情况并行OARSI评分,免疫组化和TUNEL染色分别检测膝关节软骨组织Caspase1、CollagenⅡ表达和软骨细胞凋亡情况,Western blot检测基质金属蛋白酶-13(MMP-13)、基质金属蛋白酶抑制剂-1(TIMP-1)、p53、p21、NLPR3、凋亡相关斑点样蛋白(ASC)、Pro-Caspase-1蛋白表达。结果:与正常组相比,OA模型组大鼠血清IL-1β、IL-6、IL-18、TNF-α水平均显著上升(P<0.01),膝关节损伤明显,OARSI评分显著升高(P<0.01),软骨细胞凋亡显著增加(P<0.01),组织Caspase1含量、MMP-13、p53、p21、NLPR3、ASC、Pro-Caspase-1蛋白表达均显著升高(P<0.01),而CollagenⅡ含量和TIMP-1蛋白表达显著降低(P<0.01)。与OA模型组相比,杜仲-当归组和阳性药物组大鼠血清IL-1β、IL-6、IL-18、TNF-α水平显著下降(P<0.05),膝关节损伤改善,OARSI评分降低(P<0.01),软骨细胞凋亡显著减少(P<0.01),组织Caspase1含量,MMP-13、p53、NLPR3、Pro-Caspase-1蛋白表达显著降低(P<0.05)、CollagenⅡ含量和TIMP-1蛋白表达显著增加(P<0.05),杜仲-当归组大鼠p21、ASC蛋白表达显著降低(P<0.01)。结论:“杜仲-当归”可改善OA大鼠软骨病变,其作用可能与介导NLPR3/ASC/Pro-Caspase-1炎性体通路,下调IL-1β及相关炎性因子水平、抑制软骨细胞凋亡有关。
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关键词
骨关节炎
杜仲-当归
前交叉韧带切断术
NLPR3/ASC/Pro-Caspase-1炎症小体通路
IL-1Β
p53/p21蛋白
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职称材料
题名
皮肤恶性黑色素瘤自噬相关lncRNA预后模型的建立与应用
1
作者
胡巾帼
沈榕
沈一杰
叶佳莉
机构
浙江中医药大学附属杭州市中医院药剂科
出处
《临床皮肤科杂志》
北大核心
2025年第2期78-86,共9页
文摘
目的:基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析皮肤恶性黑色素瘤(cutaneous malignant melanoma,CMM)患者转录组数据,构建CMM患者自噬相关长链非编码RNA(lncRNA)的预后模型。方法:从TCGA数据库中提取CMM患者的转录组数据和临床信息,从人类自噬相关数据库(HADb)中获取自噬相关基因,根据Pearson相关系数筛选自噬相关lncRNA。采用单因素Cox和多因素Cox回归分析,确定与CMM预后相关的自噬相关lncRNA并构建CMM患者的预后模型和列线图。通过CMM转录组数据,进行功能和通路富集分析。最后通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测自噬相关lncRNA在正常细胞和肿瘤细胞中的表达情况。结果:多因素Cox回归分析结果显示10个自噬相关lncRNA具有独立的预后价值(P值均<0.001),其中9种lncRNA(AC012236.1、LINC00324、HCP5、THCAT158、LINC01943、AC242842.1、AC083799.1、HLA-DQB1-AS1和AL133371.2)属于保护性lncRNA,与CMM患者较好的预后有关,PCED1B-AS1属于风险性lncRNA,与较差的预后有关。生存分析结果显示,高风险组CMM患者总体生存率低。列线图结果显示,基于自噬相关lncRNA的风险评分是CMM的独立预后因素。此外,qRT-PCR结果提示自噬相关lncRNA AC012236.1、LINC00324、HCP5、AC242842.1、AC083799.1、HLA-DQB1-AS1、AL133371.2和PCED1B-AS1在人永生化角质形成细胞(HaCaT)细胞系和人恶性黑色素瘤细胞(A375)细胞系的表达差异有统计学意义(P<0.05)。结论:自噬相关lncRNA可能与CMM预后有关,这些lncRNA为CMM患者预后生物标志物和治疗靶点的研究提供了线索,为CMM的临床治疗提供新的视角。
关键词
恶性黑色素瘤
皮肤
自噬相关lncRNA
预后
Keywords
malignant melanoma,cutaneous
autophagy-related lncRNA
prognosis
分类号
R739.5 [医药卫生—肿瘤]
R195.1 [医药卫生—卫生统计学]
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职称材料
题名
“杜仲-当归”调控NLPR3炎症小体对骨关节炎大鼠改善作用的研究
被引量：
9
2
作者
王鑫昱
陈亦鹏
马永力
何君妃
机构
浙江中医药大学附属杭州市中医院药剂科
浙江
中医药大学
附属
杭州市中医院
骨伤
科
出处
《中国临床药理学与治疗学》
CAS
CSCD
2023年第7期751-757,共7页
基金
杭州市科技发展计划项目(20201203B221)。
文摘
目的:探究药对“杜仲-当归”对骨关节炎(osteoarthritis,OA)大鼠膝组织的改善效果及对NLPR3炎症小体的调控。方法:24只雄性SD大鼠随机挑选18只采用前交叉韧带切断术(ACLT)进行OA造模,随后将大鼠分为正常组、OA模型组、杜仲-当归组和阳性药物组,每组6只,后两组分别给与“杜仲-当归”或西乐葆和奥泰灵混合液治疗8周。收集大鼠外周血,ELISA测定IL-1β、IL-6、IL-18、TNF-α水平;另取大鼠膝关节软骨组织,HE染色观察病理改变,番红-固绿染色观察软骨钙化情况并行OARSI评分,免疫组化和TUNEL染色分别检测膝关节软骨组织Caspase1、CollagenⅡ表达和软骨细胞凋亡情况,Western blot检测基质金属蛋白酶-13(MMP-13)、基质金属蛋白酶抑制剂-1(TIMP-1)、p53、p21、NLPR3、凋亡相关斑点样蛋白(ASC)、Pro-Caspase-1蛋白表达。结果:与正常组相比,OA模型组大鼠血清IL-1β、IL-6、IL-18、TNF-α水平均显著上升(P<0.01),膝关节损伤明显,OARSI评分显著升高(P<0.01),软骨细胞凋亡显著增加(P<0.01),组织Caspase1含量、MMP-13、p53、p21、NLPR3、ASC、Pro-Caspase-1蛋白表达均显著升高(P<0.01),而CollagenⅡ含量和TIMP-1蛋白表达显著降低(P<0.01)。与OA模型组相比,杜仲-当归组和阳性药物组大鼠血清IL-1β、IL-6、IL-18、TNF-α水平显著下降(P<0.05),膝关节损伤改善,OARSI评分降低(P<0.01),软骨细胞凋亡显著减少(P<0.01),组织Caspase1含量,MMP-13、p53、NLPR3、Pro-Caspase-1蛋白表达显著降低(P<0.05)、CollagenⅡ含量和TIMP-1蛋白表达显著增加(P<0.05),杜仲-当归组大鼠p21、ASC蛋白表达显著降低(P<0.01)。结论:“杜仲-当归”可改善OA大鼠软骨病变,其作用可能与介导NLPR3/ASC/Pro-Caspase-1炎性体通路,下调IL-1β及相关炎性因子水平、抑制软骨细胞凋亡有关。
关键词
骨关节炎
杜仲-当归
前交叉韧带切断术
NLPR3/ASC/Pro-Caspase-1炎症小体通路
IL-1Β
p53/p21蛋白
Keywords
osteoarthritis
DuZhong-DangGui
anterior cruciate ligament amputation
NLPR3/ASC/Pro-Caspase-1 inflammasome pathway
IL-1β
p53/p21 protein
分类号
R965.2 [医药卫生—药理学]
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作者
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被引量
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1
皮肤恶性黑色素瘤自噬相关lncRNA预后模型的建立与应用
胡巾帼
沈榕
沈一杰
叶佳莉
《临床皮肤科杂志》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
“杜仲-当归”调控NLPR3炎症小体对骨关节炎大鼠改善作用的研究
王鑫昱
陈亦鹏
马永力
何君妃
《中国临床药理学与治疗学》
CAS
CSCD
2023
9
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