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2022年济南市3株输入性新型冠状病毒奥密克戎BQ.1全基因组特征分析
被引量：
1
1
作者
白飒
刘保华
+4 位作者
闫荣军
赵辉
孙连波
张涛
韩焕美
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期1060-1064,共5页
目的从病毒基因组水平上了解3株济南市同一时期不同来源的输入性新冠病毒(SARS-CoV-2)的全基因组特征和变异情况,为进一步完善口岸新冠肺炎疫情防控工作提供科学依据。方法选取济南市3例输入性新冠病毒感染者的鼻咽拭子样本,采用二代测...
目的从病毒基因组水平上了解3株济南市同一时期不同来源的输入性新冠病毒(SARS-CoV-2)的全基因组特征和变异情况,为进一步完善口岸新冠肺炎疫情防控工作提供科学依据。方法选取济南市3例输入性新冠病毒感染者的鼻咽拭子样本,采用二代测序技术进行全基因组测序,通过生物学信息软件进行变异位点和同源性分析。结果成功从3例无症状感染病例样本中获得SARS-CoV-2全基因组序列,全长在29835 bp~29844 bp。Pangolin分型结果显示,3例样本基因型依次为OmicronBQ.1,BQ.1.1,BQ.1.12,与原始毒株相比,分别产生了77、80、78个碱基位点的突变,涉及60~63处非同义突变,主要集中在S和ORF1ab基因上。结论OmicronBQ.1及其分支为济南口岸首次检出的输入性新冠病毒基因型,为口岸新冠病毒的溯源及防控提供理论依据。
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关键词
新型冠状病毒
境外输入
奥密克戎变异株
全基因组测序
进化分析
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职称材料
题名
2022年济南市3株输入性新型冠状病毒奥密克戎BQ.1全基因组特征分析
被引量：
1
1
作者
白飒
刘保华
闫荣军
赵辉
孙连波
张涛
韩焕美
机构
济南
国际旅行卫生保健中心
济南海关动植物检疫处
青岛国际旅行卫生保健中心
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期1060-1064,共5页
基金
山东省科技厅科研项目(No.2021CXGC 011306)
海关总署科研项目(No.2021HK139)
济南海关科研项目(No.2020JK003)。
文摘
目的从病毒基因组水平上了解3株济南市同一时期不同来源的输入性新冠病毒(SARS-CoV-2)的全基因组特征和变异情况,为进一步完善口岸新冠肺炎疫情防控工作提供科学依据。方法选取济南市3例输入性新冠病毒感染者的鼻咽拭子样本,采用二代测序技术进行全基因组测序,通过生物学信息软件进行变异位点和同源性分析。结果成功从3例无症状感染病例样本中获得SARS-CoV-2全基因组序列,全长在29835 bp~29844 bp。Pangolin分型结果显示,3例样本基因型依次为OmicronBQ.1,BQ.1.1,BQ.1.12,与原始毒株相比,分别产生了77、80、78个碱基位点的突变,涉及60~63处非同义突变,主要集中在S和ORF1ab基因上。结论OmicronBQ.1及其分支为济南口岸首次检出的输入性新冠病毒基因型,为口岸新冠病毒的溯源及防控提供理论依据。
关键词
新型冠状病毒
境外输入
奥密克戎变异株
全基因组测序
进化分析
Keywords
SARS-CoV-2
overseas imported
Omicron variant
whole genome sequencing
evolutionary analysis
分类号
R373.1 [医药卫生—病原生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2022年济南市3株输入性新型冠状病毒奥密克戎BQ.1全基因组特征分析
白飒
刘保华
闫荣军
赵辉
孙连波
张涛
韩焕美
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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