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一个小麦芒长基因的初步定位及候选基因预测 被引量:1
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作者 杨晓雨 马指挥 +4 位作者 魏青 牛志鹏 陈安琪 胡正冲 王林生 《浙江农业学报》 北大核心 2025年第1期14-23,共10页
小麦芒作为影响产量和抗逆性的重要农艺性状引起了许多小麦遗传改良工作者的广泛关注。本文以藁优2018(全芒)与科大102(顶芒)及其构建的F2分离群体为试验材料,在小麦抽穗期对其主要农艺性状进行统计分析,并利用SSR分子标记对小麦芒长基... 小麦芒作为影响产量和抗逆性的重要农艺性状引起了许多小麦遗传改良工作者的广泛关注。本文以藁优2018(全芒)与科大102(顶芒)及其构建的F2分离群体为试验材料,在小麦抽穗期对其主要农艺性状进行统计分析,并利用SSR分子标记对小麦芒长基因进行初步定位。结果表明,小麦顶芒对全芒为显性单基因遗传,符合孟德尔分离规律。采用Joinmap4.0软件对芒长基因进行遗传连锁图谱的构建,最终目的基因被初步定位在5A染色体长臂末端的yzu443936和yzu454712两个标记之间。将这两个标记的引物序列与中国春V2.1基因组进行比对,得到两个标记间的物理距离为6.74 Mb(668.45~675.19 Mb)。通过IWGSC网站在该区间内共筛选到86个基因,其中有17个基因可能为调控芒长的候选基因。本研究结果可以为小麦芒长基因的精细定位及基因克隆提供理论基础。 展开更多
关键词 普通小麦 芒长 遗传分析 候选基因
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普通小麦大赖草易位系T3AS·3AL-7Lr#1S的分子细胞遗传学鉴定 被引量:3
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作者 张雅莉 王林生 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第4期519-524,共6页
大赖草对赤霉病具有较好的抗性,将大赖草赤霉病抗性基因转入普通小麦,对拓宽小麦赤霉病抗性基础有重要意义。本研究在获得抗赤霉病普通小麦-大赖草异附加系基础上,采用1 200 R ^(60)Co-γ射线处理小麦-大赖草二体附加系DA7Lr花粉,授予... 大赖草对赤霉病具有较好的抗性,将大赖草赤霉病抗性基因转入普通小麦,对拓宽小麦赤霉病抗性基础有重要意义。本研究在获得抗赤霉病普通小麦-大赖草异附加系基础上,采用1 200 R ^(60)Co-γ射线处理小麦-大赖草二体附加系DA7Lr花粉,授予已去雄的普通小麦中国春,对其后代(M_1)种子根尖细胞有丝分裂中期染色体进行GISH分析,获得了1株具有1条普通小麦-大赖草易位染色体的植株,让其自交,对自交后代中具有2条易位染色体植株的花粉母细胞减数分裂中期Ⅰ进行观察,发现2条易位染色体形成了稳定的环状二价体,表明该植株为纯合体。利用顺序GISH-双色FISH分析,结合C-分带、小麦D基因组专化探针Oligo-pAs1-2和B基因组专化探针Oligo-pSc119.2-2,进一步鉴定出该普通小麦-大赖草易位系为T3AS·3AL-7Lr#1S,且筛选出了可追踪该易位系的3个EST-STS分子标记BE591127、BQ168298和BE591737。该易位系的育成为小麦赤霉病遗传改良提供了新种质。 展开更多
关键词 普通小麦 大赖草 易位系 分子细胞遗传学
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普通小麦–大赖草易位系T5AS-7LrL·7LrS分子细胞遗传学鉴定 被引量:3
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作者 王林生 张雅莉 南广慧 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期1442-1447,共6页
大赖草对赤霉病具有较好的抗性,将大赖草赤霉病抗性基因转入普通小麦,对拓宽小麦赤霉病抗性基础有重要意义。本研究在获得抗赤霉病普通小麦–大赖草异附加系基础上,采用^(60)Co-γ射线(1200Rad,剂量率100Rad min^(-1))处理小麦–大赖草... 大赖草对赤霉病具有较好的抗性,将大赖草赤霉病抗性基因转入普通小麦,对拓宽小麦赤霉病抗性基础有重要意义。本研究在获得抗赤霉病普通小麦–大赖草异附加系基础上,采用^(60)Co-γ射线(1200Rad,剂量率100Rad min^(-1))处理小麦–大赖草二体附加系DA7Lr,并用处理后的花粉授给去雄的普通小麦中国春,对其M_1代种子根尖细胞有丝分裂中期染色体进行GISH分析,获得1株具有一条普通小麦–大赖草易位染色体的植株,对其自交后代中具有2条易位染色体植株的花粉母细胞减数分裂中期I观察发现,2条易位染色体形成了稳定的环状二价体,表明该植株为纯合体。利用顺序GISH–双色FISH分析,结合C-分带、小麦D组专化探针Oligo-pAs1-2和B组专化探针Oligo-pSc119.2-2,进一步鉴定出该易位系为T5AS-7LrL·7LrS,同时筛选出可追踪该易位系的3个EST-STS分子标记,即BE591127、BQ168298和BE591737。该易位系的育成也为小麦赤霉病遗改良提供了新种质。 展开更多
关键词 普通小麦–大赖草易位系 分子细胞遗传学 赤霉病抗性 60Co-γ射线
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普通小麦的芒研究进展 被引量:1
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作者 杨晓雨 马指挥 +4 位作者 魏青 牛志鹏 陈安琪 胡正冲 王林生 《耕作与栽培》 2024年第5期73-76,81,共5页
小麦芒作为影响产量和抗逆性的重要农艺性状引起了许多小麦遗传改良工作者的广泛关注。本文总结了芒的结构,介绍了小麦芒长与产量、抗逆性等农业性状之间的关系,并阐述了SNP基因芯片技术的全基因组关联分析(GWAS,Genome-wide associatio... 小麦芒作为影响产量和抗逆性的重要农艺性状引起了许多小麦遗传改良工作者的广泛关注。本文总结了芒的结构,介绍了小麦芒长与产量、抗逆性等农业性状之间的关系,并阐述了SNP基因芯片技术的全基因组关联分析(GWAS,Genome-wide association study)和集群分离分析法(BSA,Bulked segregant analysis)在小麦芒长基因研究中的应用,最后介绍了小麦芒基因的研究进展,以期为小麦遗传改良提供一定的理论参考。 展开更多
关键词 普通小麦 遗传改良
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陆地棉低磷胁迫应答基因GhGDPD1的克隆与表达分析 被引量:5
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作者 孟超敏 耿翡翡 +3 位作者 卿桂霞 张富厚 李雪林 刘逢举 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期723-730,共8页
【目的】基于前期陆地棉‘新陆早19’Gossypium hirsutum‘Xinluzao 19’根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。【方法】克隆陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因并进行基因组DNA与cDNA测序分... 【目的】基于前期陆地棉‘新陆早19’Gossypium hirsutum‘Xinluzao 19’根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。【方法】克隆陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhGDPD1的基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与实时荧光定量PCR (RT-qPCR)的方法检测该基因于根、茎、叶、花等4个组织的基因表达量的变化以及低磷胁迫下的表达模式。【结果】成功克隆GhGDPD1基因,开放阅读框序列长度为1 149 bp,共编码382个氨基酸,属于GDPD家族,其中存在一个保守结构域,名为GDPD_GDE5_like_1_plant。半定量RT-PCR和RT-qPCR试验结果均显示:GhGDPD1基因主要表达于根,中量表达于花和茎,微量表达于叶。该基因在受到低磷胁迫的刺激后,立即会对低磷胁迫做出应答,胁迫4 h相对表达量达到最高值。【结论】首次成功克隆到陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因,获得了GhGDPD1基因的组织表达以及低磷胁迫下的表达模式,为深入解析棉花GhGDPD1基因的生物学功能以及培育棉花磷高效利用新种质提供科学参考。 展开更多
关键词 陆地棉 低磷胁迫 基因克隆 生物信息学分析 表达分析
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陆地棉低磷胁迫应答基因GhERF5的克隆与表达分析 被引量:3
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作者 孟超敏 耿翡翡 +3 位作者 卿桂霞 李雪林 张富厚 刘逢举 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期382-388,共7页
该研究基于前期陆地棉根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析及基因组数据库,从陆地棉‘新陆早19’中克隆AP2/ERF基因(GhERF5),并对其基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析其基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR... 该研究基于前期陆地棉根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析及基因组数据库,从陆地棉‘新陆早19’中克隆AP2/ERF基因(GhERF5),并对其基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析其基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测该基因于根、茎、叶、花等组织的表达变化以及低磷胁迫不同时间的相对表达。结果表明:(1)成功克隆获得一个AP2/ERF基因,命名为GhERF5;GhERF5基因开放阅读框序列长度963 bp,共编码320个氨基酸;该基因在177~241处存在一个AP2保守结构域,属于AP2家族。(2)多序列比对发现,GhERF5与亚洲棉GaERF5、雷蒙德氏GoraiERF5L相似性达到95%;系统进化树分析显示,陆地棉GhERF5蛋白序列与陆地棉GhERF5L(NP_001386305)的相似性最高,推测GhERF5基因是位于D亚基因组的基因。(3)半定量RT-PCR和qRT-PCR检测发现,GhERF5基因在陆地棉根、茎、叶和花中均有表达,但主要在叶中表达,其次为根和茎,花中的表达量最低;低磷处理0~72 h过程中,GhERF5基因在根部组织中的表达量呈先下降后上升再下降的变化趋势,且在低磷处理72 h时GhERF5的表达量仅为适磷处理的33%。研究表明,GhERF5基因属于低磷胁迫响应基因,可能参与陆地棉低磷胁迫下的应答反应。 展开更多
关键词 陆地棉 低磷胁迫 基因克隆 表达分析
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陆地棉磷高效基因GhMGD3的克隆与表达分析 被引量:2
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作者 孟超敏 耿翡翡 +3 位作者 卿桂霞 周佳敏 张富厚 刘逢举 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1203-1211,共9页
【目的】基于前期陆地棉Gossypium hirsutum根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。【方法】克隆GhMGD3基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhMGD3的基因结构和进... 【目的】基于前期陆地棉Gossypium hirsutum根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。【方法】克隆GhMGD3基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhMGD3的基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与实时荧光定量PCR (RT-qPCR)的方法检测该基因在根、茎、叶、花4个组织中的基因表达量的变化以及低磷胁迫下的表达模式。【结果】成功克隆了陆地棉GhMGD3基因。GhMGD3基因的编码序列全长为681 bp,共编码226个氨基酸,存在3个内含子,分子量是26 610.54 Da,等电点为8.74,是稳定的亲水碱性蛋白。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。该蛋白不存在信号肽、跨膜结构域、N-糖基化位点,但含有多个磷酸化位点。亚细胞定位结果显示:该基因编码的蛋白定位于叶绿体。GhMGD3蛋白与木槿Hibiscus syriacus氨基酸序列相似性较高,其亲缘关系最近。半定量RT-PCR和RT-qPCR试验结果均表示:GhMGD3基因主要表达于根,中量表达于茎,微量表达于叶和花,在低磷胁迫72 h时其相对表达量达到最高值。【结论】首次成功克隆到了陆地棉GhMGD3基因,获得了GhMGD3基因的组织表达以及低磷胁迫下的表达模式,GhMGD3基因在棉花磷高效利用信号调控中具有重要作用。图7表1参27。 展开更多
关键词 陆地棉 低磷胁迫 基因克隆 表达分析
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国审高产优质强筋小麦新品种科大1026 被引量:2
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作者 王林生 王新天 +6 位作者 张雅莉 马指挥 王世雨 郭媛 杨晓雨 魏青 韩睿 《中国种业》 2022年第8期156-157,共2页
科大1026是以半冬性优质多穗型小麦品种豫麦46为母本、半冬性优质强筋小麦品种郑麦9405为父本,采用常规育种与分子标记辅助选择相结合,经多年选育而成的半冬性、半矮秆、高产、优质、强筋小麦新品种,2021年通过国家农作物品种审定委员... 科大1026是以半冬性优质多穗型小麦品种豫麦46为母本、半冬性优质强筋小麦品种郑麦9405为父本,采用常规育种与分子标记辅助选择相结合,经多年选育而成的半冬性、半矮秆、高产、优质、强筋小麦新品种,2021年通过国家农作物品种审定委员会审定(国审麦20210044),已被列为河南省优质专用小麦种植指导性计划主导品种。 展开更多
关键词 小麦 优质强筋 新品种 科大1026
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豫西丘陵地区谷子品种主要农艺性状与产量的相关性 被引量:9
9
作者 周佳敏 梁颖颖 +3 位作者 李思源 张富厚 赵俊杰 孟超敏 《贵州农业科学》 CAS 2020年第11期19-22,共4页
为豫西丘陵地区谷子的种植推广提供参考,运用方差分析、相关性分析等方法对30个谷子品种的农艺性状与产量的相关性进行分析。结果表明:谷子产量与单位面积穗数、单穗重之间呈极显著正相关;单位面积穗数与穗长呈显著负相关;株高与穗粗呈... 为豫西丘陵地区谷子的种植推广提供参考,运用方差分析、相关性分析等方法对30个谷子品种的农艺性状与产量的相关性进行分析。结果表明:谷子产量与单位面积穗数、单穗重之间呈极显著正相关;单位面积穗数与穗长呈显著负相关;株高与穗粗呈极显著负相关;单穗重与穗粗呈极显著正相关。经试验对比,在30个参试品种中,冀谷41、豫谷18、冀谷39、豫谷34及济谷19产量较高,可在豫西丘陵地区进行推广种植。 展开更多
关键词 谷子 丘陵旱地 产量 相关性分析 农艺性状 豫西 河南
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陆地棉GhCSN 6 A基因克隆及低磷胁迫下的表达 被引量:2
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作者 卿桂霞 耿翡翡 +3 位作者 梁颖颖 周俊江 张富厚 孟超敏 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期29-36,共8页
该研究基于陆地棉根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列结果及基因组数据库,对表达差异序列ES816317进行克隆,利用生物信息学分析其核苷酸及蛋白序列,并通过qRT-PCR技术检测其组织表达模式和在低磷胁迫下的相对表达特征,为解析棉花Gh... 该研究基于陆地棉根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列结果及基因组数据库,对表达差异序列ES816317进行克隆,利用生物信息学分析其核苷酸及蛋白序列,并通过qRT-PCR技术检测其组织表达模式和在低磷胁迫下的相对表达特征,为解析棉花GhCSN 6 A的生物学功能奠定基础,并为棉花磷高效基因工程育种提供基因资源。结果表明:(1)成功获得陆地棉GhCSN6A基因,该基因的开放阅读框全长为948 bp,编码315个氨基酸;GhCSN6A蛋白为COP9信号小体复合亚基6a,属于MOV34蛋白超家族,具有MPN_CSN6结构域,定位于细胞核。(2)序列比对和进化分析显示,陆地棉GhCSN6A与木槿HsCSN6A、拟南芥AtCSN6A的相似性分别为95.87%和84.54%。(3)qRT-PCR分析表明,GhCSN 6 A基因在陆地棉的根、茎、叶、花中均有表达,且在叶中表达水平最高,但叶与根中的表达无显著差异;GhCSN 6 A基因在低磷处理24 h时根中相对表达量最低,但低磷处理72 h时根中的相对表达量最高达到了适磷(对照)处理的2倍。研究推测,陆地棉GhCSN 6 A基因在棉花响应低磷胁迫过程中具有重要作用。 展开更多
关键词 陆地棉 基因克隆 低磷胁迫 表达分析
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小麦科大116×科大101 F_(2)群体穗长主效QTL定位及候选基因预测 被引量:1
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作者 郭媛 马指挥 +5 位作者 王世雨 牛志鹏 杨晓雨 魏青 陈安琪 王林生 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第5期84-93,共10页
穗长是小麦重要的农艺性状,与产量构成因素密切相关。旨在研究小麦穗长遗传基因,筛选与穗长基因连锁的分子标记,为小麦分子标记辅助育种提供分子支撑。以科大116和科大101为亲本构建的F_(2)群体为试验材料,通过SSR分子标记,构建覆盖小... 穗长是小麦重要的农艺性状,与产量构成因素密切相关。旨在研究小麦穗长遗传基因,筛选与穗长基因连锁的分子标记,为小麦分子标记辅助育种提供分子支撑。以科大116和科大101为亲本构建的F_(2)群体为试验材料,通过SSR分子标记,构建覆盖小麦基因组的遗传图谱,并结合完备复合区间作图法对穗长进行QTL定位。采用3234对引物,共筛选出434对在双亲间具有多态性的引物,多态性引物的检出率为13.42%。通过BSA混池分析,共筛选出28个可能与穗长连锁的分子标记,其中16个标记通过262株群体验证与目标基因紧密连锁。通过QTL-IciMapping软件构建小麦染色体组的遗传图谱,标记间的平均遗传距离为38.66 cM,共检测出7个与穗长相关的QTL位点,分别位于3B、4A、4B和6B染色体上,其加性效应值均为正值,对表型性状遗传变异的贡献率在4.01%~23.16%。在4B染色体上定位出2个主效QTL位点,贡献率为17.59%~23.16%。其中,Qsl4B-2距离其最近的分子标记只有3.5 cM,为连锁最紧密的一个QTL位点,分析发现其可能为新的主效QTL位点。因此,4B染色体上可能存在与穗长相关的基因。通过分析预测,在4B染色体的yzu397456~yzu404917和yzu409422~yzu405167标记区间内,可能存在7个调控小麦穗长的候选基因,在穗中持续高表达。 展开更多
关键词 小麦 F_(2)群体 穗长 QTL 候选基因
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大豆荚粒空间分布特性及其与产量的相关性 被引量:3
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作者 张富厚 董普辉 +2 位作者 韩赞平 孟超敏 李雪林 《贵州农业科学》 CAS 2017年第11期23-26,共4页
为高产大豆育种提供依据,以69个夏大豆品系为材料,通过田间试验调查其性状,研究大豆冠层荚粒空间分布特性及其与产量的关系。结果表明:1)大豆冠层各部分荚粒数量分布不均等、变异幅度存在差异。2)顶部荚数、顶部粒数、上部荚数、上部粒... 为高产大豆育种提供依据,以69个夏大豆品系为材料,通过田间试验调查其性状,研究大豆冠层荚粒空间分布特性及其与产量的关系。结果表明:1)大豆冠层各部分荚粒数量分布不均等、变异幅度存在差异。2)顶部荚数、顶部粒数、上部荚数、上部粒数与大豆产量呈显著或极显著相关,且其变异系数均较大,分别为34.1%、35.1%、20.3%和22.4%,在大豆育种中应选择植株顶部荚(粒)数、上部荚(粒)数较多的品系为材料。 展开更多
关键词 大豆 荚粒 空间分布 产量
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陆地棉磷高效基因GhMYB4的克隆与表达分析
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作者 耿翡翡 孟超敏 +3 位作者 卿桂霞 周佳敏 张富厚 刘逢举 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1406-1412,共7页
【目的】基于陆地棉根部低磷胁迫基因谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,分析其克隆与表达,为研究棉花GhMYB4基因的生物学功能以及培育棉花磷高效利用新种质提供科学参考。【方法】克隆GhMYB4基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析... 【目的】基于陆地棉根部低磷胁迫基因谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,分析其克隆与表达,为研究棉花GhMYB4基因的生物学功能以及培育棉花磷高效利用新种质提供科学参考。【方法】克隆GhMYB4基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,运用生物信息学方法分析GhMYB4的基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与荧光定量PCR(qRT-PCR)的方法检测该基因于根、茎、叶、花四个组织的基因表达量的变化。【结果】GhMYB4基因,开放阅读框序列长度774 bp,共编码257个氨基酸,属于MYB家族。半定量RT-PCR和qRT-PCR试验结果均表示,GhMYB4基因主要表达于根,中量表达于茎和叶,微量表达于花。【结论】获得GhMYB4基因及表达特性,该基因在棉花根中的表达量是最大的,在花中表达相对较小,中量表达于茎和叶。 展开更多
关键词 陆地棉 低磷胁迫 基因克隆 表达分析 生信分析
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