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基于全基因组重测序评估郏县红牛保种群遗传多样性与群体结构 被引量:4
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作者 张岩 魏稚彤 +10 位作者 虎业浩 张花菊 张曼 付彤 刘贤 李志钢 祁兴磊 王二耀 张子敬 梁栋 高腾云 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期2933-2942,共10页
【目的】了解郏县红牛保种群的群体结构和遗传多样性,从而更好地保护和利用郏县红牛遗传资源。【方法】基于全基因组重测序技术,对30头郏县红牛的全基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)进行检测,并通过分析群体... 【目的】了解郏县红牛保种群的群体结构和遗传多样性,从而更好地保护和利用郏县红牛遗传资源。【方法】基于全基因组重测序技术,对30头郏县红牛的全基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)进行检测,并通过分析群体遗传多样性、群体结构、连续纯合片段(runs of homozygosity,ROH)分布特征和亲缘关系,对郏县红牛保种群的保种效果进行综合评估。【结果】在30头郏县红牛个体中共检测到41215797个高质量SNPs位点;郏县红牛群体遗传多样性丰富,最小等位基因频率为0.13±0.13,多态性标记比例为0.58±0.33,期望杂合度为0.192±0.152,观测杂合度为0.191±0.158,核苷酸多样性为0.003±0.001。郏县红牛群体的有效群体含量呈逐代下降趋势,在1000代前有效群体含量为2716头,在20代前为143头;郏县红牛个体间的遗传距离介于0.80~0.89之间,平均遗传距离为0.83±0.02。聚类分析显示,30头郏县红牛共分为7个家系,15头公牛可分为5个家系;30头郏县红牛个体中共检测到5947个ROH,总长度为2.8 Gb,长度为0~0.5 Mb的ROH占比最多(73.08%),2~4 Mb的ROH占比最少(0.40%),基于ROH的平均近交系数为0.19±0.07,15头公牛的平均近交系数为0.15±0.05。【结论】郏县红牛保种群遗传多样性丰富,群体结构没有出现明显分层,整体上保持了较高水平的近交,出现了一定的近交风险,需加强选种选配工作,以确保郏县红牛遗传资源的可持续发展。 展开更多
关键词 郏县红牛 全基因组重测序 遗传多样性 群体结构
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基于重测序数据评估南阳牛保种效果 被引量:1
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作者 刘思宇 张曼 +6 位作者 张岩 魏稚彤 祁兴磊 高腾云 刘贤 梁栋 付彤 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期3876-3886,共11页
旨在通过遗传多样性和群体结构分析,评估南阳牛的保种效果。本研究基于30头健康南阳牛的全基因组重测序数据,通过变异检测获得单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)信息,综合分析群体遗传多样性、群体结构、亲缘关系以... 旨在通过遗传多样性和群体结构分析,评估南阳牛的保种效果。本研究基于30头健康南阳牛的全基因组重测序数据,通过变异检测获得单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)信息,综合分析群体遗传多样性、群体结构、亲缘关系以及连续纯和片段(ROH)分布特征,对南阳牛保种群的保种效果进行全面评估。结果显示:1)共检测到高质量SNPs位点数目是25929389个;2)保种群遗传多样性丰富,核苷酸多样性为0.0029,多态性标记比例为0.8887,最小等位基因频率为0.1861,期望杂合度为0.2749,观测杂合度为0.2557;3)世代有效群体含量在1000代前为2834头,在20代前为149头,呈逐年下降趋势;4)主成分分析结果显示南阳牛保种群没有明显分层;5)个体间的遗传距离介于0.80~0.89,平均遗传距离为0.83±0.02;6)30头南阳牛个体共分为7个家系,公牛可分为5个家系;7)共检测到ROH片段数目是4992个,平均每头南阳牛的ROH片段长度为约74.41 Mb,总长度为2.18 Gb,基于ROH的平均近交系数为0.031,0.5 Mb以下的ROH片段占比最多为75.72%,2~4 Mb的ROH片段占比最少为0.16%。综上所述,南阳牛保种群体遗传多样性丰富,没有出现明显分层,近交水平较低,但仍有个别个体近交较高。因此,未来的保种工作应加强选种和选配管理,以促进群体的可持续发展。 展开更多
关键词 南阳牛 全基因组重测序 遗传多样性 群体结构 保种
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胚胎移植前供体牛与受体牛血浆外泌体miRNA差异表达分析 被引量:1
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作者 翟亚莹 施巧婷 +7 位作者 楚秋霞 朱肖亭 滑留帅 张子敬 陈付英 祁兴磊 王二耀 吕世杰 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第2期641-649,共9页
【目的】探索胚胎移植前供体牛与受体牛血浆外泌体miRNA的表达差异,以明确血浆外泌体miRNA在牛早期妊娠中的作用及其调控机制。【方法】以3~6岁、体重480~600 kg的夏南牛作为研究对象,选取10头供体牛进行同期发情、超数排卵和人工授精,2... 【目的】探索胚胎移植前供体牛与受体牛血浆外泌体miRNA的表达差异,以明确血浆外泌体miRNA在牛早期妊娠中的作用及其调控机制。【方法】以3~6岁、体重480~600 kg的夏南牛作为研究对象,选取10头供体牛进行同期发情、超数排卵和人工授精,23头受体牛只做同期发情处理。在人工授精后第7天,冲洗供体牛子宫以获取囊胚,选取3头囊胚数相近的供体牛及3头与供体牛体重和年龄均相近的受体牛,颈静脉采血,进行血浆外泌体的分离与鉴定;然后提取血浆外泌体miRNA,并检测其表达量;采用R语言中的DESeq差异算法计算P值,并筛选出P<0.05的miRNA,对差异表达的miRNA进行靶基因预测、GO功能富集分析和KEGG信号通路分析。【结果】6个样本的囊泡粒径均在135 nm左右,符合外泌体的特征。与供体牛相比,受体牛中有9个miRNAs表达显著上调(P<0.05),13个miRNAs显著下调(P<0.05);22个差异表达的miRNAs中,有15个miRNAs预测出无重复的靶基因2990个。GO功能富集分析和KEGG信号通路分析的结果表明,这些靶基因主要富集在与生物黏附(biological adhesion)、定位(localization)、细胞连接(cell junction)功能有关的通路上,显著富集的信号通路与黏着斑(focal adhesion)、黏着连接(adherens junction)有关,提示血浆外泌体miRNA可能参与调控胚胎着床。【结论】研究结果可为筛选和探究影响胚胎着床的血浆外泌体miRNA提供参考,并为进一步阐明血浆外泌体miRNA在母牛早期妊娠调控中的作用提供依据。 展开更多
关键词 外泌体 MIRNA 差异表达 妊娠
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肉鹅常见疾病的治疗分析 被引量:3
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作者 孙炳燕 《家禽科学》 2021年第4期54-55,共2页
肉鹅作为当前较受养殖户喜爱的家禽品种,具有养殖周期短、经济收益高的优势。随着肉鹅养殖规模的不断扩大,肉鹅疾病的种类也变得越来越多,如果不及时进行控制,将会给养殖户造成严重的经济损失。因此,防治肉鹅的常见疾病是当前养殖工作... 肉鹅作为当前较受养殖户喜爱的家禽品种,具有养殖周期短、经济收益高的优势。随着肉鹅养殖规模的不断扩大,肉鹅疾病的种类也变得越来越多,如果不及时进行控制,将会给养殖户造成严重的经济损失。因此,防治肉鹅的常见疾病是当前养殖工作中的重点。为此,本文详细介绍了五种肉鹅常见的疾病,并分析了相应的治疗对策,进而为养殖户有效地防治肉鹅疾病提供可行性的建议。 展开更多
关键词 家禽品种 肉鹅 养殖户 治疗对策 常见疾病 经济收益 防治 经济损失
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无角夏南牛屠宰性能分析 被引量:4
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作者 祁兴磊 赵连甫 +4 位作者 祁兴山 高攀 王世根 屈卫东 林凤鹏 《中国牛业科学》 2022年第6期18-22,34,共6页
[目的]通过屠宰测定分析,了解无角夏南牛的屠宰性能和肉质品质,为下一步无角夏南牛的选育提供资料。[方法]通过对20头24月龄无角夏南牛育肥公牛进行屠宰测定和肉质分析。[结果]20头无角夏南牛的屠宰率、净肉率、眼肌面积、肉骨比、高档... [目的]通过屠宰测定分析,了解无角夏南牛的屠宰性能和肉质品质,为下一步无角夏南牛的选育提供资料。[方法]通过对20头24月龄无角夏南牛育肥公牛进行屠宰测定和肉质分析。[结果]20头无角夏南牛的屠宰率、净肉率、眼肌面积、肉骨比、高档优质肉块比率、高档肉块率分别为:62.62%、52.8%、111.17 cm2、5.82:1、49.69%和28.36%;肩肉、大黄瓜条、外脊3个部位的蛋白质含量分别为:23.602%±0.192%、20.852%±1.212%、21.522%±1.282%;脂肪含量分别为4.262%±1.612%、3.122%±1.052%、2.802%±2.492%;肌肉剪切力分别为:4.60 kg±1.92 kg、3.59 kg±1.58 kg、4.49 kg±1.44 kg。[结论]无角夏南牛的品种培育、改良效果显著,生产高档部位肉块的能力强、肉质好。 展开更多
关键词 无角夏南牛 屠宰试验 肉用性能
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浅析犬大肠杆菌病的诊断及防治措施 被引量:1
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作者 刘保华 《河南畜牧兽医》 2022年第6期47-47,共1页
1犬大肠杆菌病的诊断分析l.i流行病学犬大肠杆菌病一年四季均有发生概率,无季节差异,且任何犬龄、任何性别的犬均有概率患有大肠杆菌病,但因幼犬抵抗力相对较弱,其断奶后缺乏母乳抗体保护,极易患大肠杆菌病。犬大肠杆菌病具有传染性,传... 1犬大肠杆菌病的诊断分析l.i流行病学犬大肠杆菌病一年四季均有发生概率,无季节差异,且任何犬龄、任何性别的犬均有概率患有大肠杆菌病,但因幼犬抵抗力相对较弱,其断奶后缺乏母乳抗体保护,极易患大肠杆菌病。犬大肠杆菌病具有传染性,传染源为带菌犬及患病犬,主要经消化道、呼吸道途径进行传播,此外,若母犬患有大肠杆菌病,在哺乳幼犬时,可通过乳头将大肠杆菌病传播给幼犬。 展开更多
关键词 大肠杆菌病 流行病学 母犬 幼犬 传染源 诊断分析 季节差异 抵抗力
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泌阳驴特征、特性及保种情况概述
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作者 屈卫东 《中国畜牧业》 2022年第12期63-63,共1页
泌阳驴是我国优良的地方驴种之一,因其中心产地位于豫西南部的泌阳县而得名。但泌阳驴除泌阳县饲养外,与泌阳相邻的遂平县、舞阳县、方城县、社旗县、唐河县、桐柏县均有饲养,主要分布在以泌阳县为中心方圆150千米范围内。一、特征特性... 泌阳驴是我国优良的地方驴种之一,因其中心产地位于豫西南部的泌阳县而得名。但泌阳驴除泌阳县饲养外,与泌阳相邻的遂平县、舞阳县、方城县、社旗县、唐河县、桐柏县均有饲养,主要分布在以泌阳县为中心方圆150千米范围内。一、特征特性泌阳驴被毛细密,黑色似锦缎,嘴头周围、眼圈及下腹部为粉白色,且黑白界限分明,具有“三白一黑”明显的外貌特征,又称“三白驴”。泌阳驴具有耐粗饲、抗病力、适应性强、遗传性能稳定等优良特性。 展开更多
关键词 外貌特征 豫西南 遗传性能 下腹部 情况概述 粉白色 遂平县 社旗县
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泌阳:肉牛全产业链式发展的典范
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作者 丁涵 节拴成 屈卫东 《河南畜牧兽医》 2023年第8期3-4,共2页
随着经济的发展和人们生活水平的不断提高,人们对优质畜产品日益增长的需求呼唤畜牧业生产出更多的优质畜产品,这无疑会加剧人畜争粮的矛盾,而大力发展草食畜牧业则是缓解这一矛盾的有效途径。2022年中央一号文件提出要“加快扩大牛羊... 随着经济的发展和人们生活水平的不断提高,人们对优质畜产品日益增长的需求呼唤畜牧业生产出更多的优质畜产品,这无疑会加剧人畜争粮的矛盾,而大力发展草食畜牧业则是缓解这一矛盾的有效途径。2022年中央一号文件提出要“加快扩大牛羊肉和奶业生产”;2022年6月,财政部、农业农村部发布2022年重点强农惠农政策,在草食畜牧业健康发展方面,提出支持奶业振兴行动、粮改饲、肉牛肉羊增量提质行动等举措。河南省是肉牛传统养殖大省和新兴奶业大省,推进草食畜牧业发展有着秸秆资源、种质资源、屠宰加工、地理位置等优势。河南省委、省政府高度重视肉牛奶牛产业发展和羊产业发展,先后出台了《河南省肉牛奶牛产业发展行动计划》《河南省人民政府办公厅关于推进羊产业高质量发展的意见》等一系列文件,并且加大对肉牛奶牛产业、羊产业的资金投入和支持力度,为推动河南省草食畜牧业发展打出了政策“组合拳”2023年是全面贯彻落实党的二十大精神的开局之年,是实施“十四五”规划承上启下的关键之年。 展开更多
关键词 草食畜牧业 中央一号文件 优质畜产品 畜牧业生产 河南省委 屠宰加工 奶业生产 奶牛产业
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