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新立河水域撅嘴鲢与鲫鱼肠道微生物群落结构特征分析
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作者 崔庆华 李建霞 +3 位作者 梁照东 张兴安 张海峰 张一博 《绿色科技》 2024年第22期80-85,共6页
利用高通量测序技术,分析了位于滨州市新立河水域中的撅嘴鲢与鲫鱼肠道菌群结构特征,及其与生活环境中微生物群落之间的关系。研究发现3种样品共鉴定出215个共有OTUs,撅嘴鲢、鲫鱼和水体样中特有的OTUs数目分别为843、1120和1168。撅嘴... 利用高通量测序技术,分析了位于滨州市新立河水域中的撅嘴鲢与鲫鱼肠道菌群结构特征,及其与生活环境中微生物群落之间的关系。研究发现3种样品共鉴定出215个共有OTUs,撅嘴鲢、鲫鱼和水体样中特有的OTUs数目分别为843、1120和1168。撅嘴鲢和鲫鱼样本肠道菌群多样性和结构与周围水体存在显著差异,水体中的细菌丰富度和均匀度更高,细菌类型也更稳定。在门水平上,撅嘴鲢以变形菌门、厚壁菌门和梭杆菌门为优势菌门,鲫鱼以变形菌门、厚壁菌门和蓝菌门占优势,水体样本则以变形菌门、放线菌门和拟杆菌门为主;在目水平上,撅嘴鲢优势菌目为气单胞菌目、肠杆菌目和梭杆菌目,鲫鱼优势菌目为弧菌目、根瘤菌目和气单胞菌目,而水体中放线菌目、黄杆菌目和红杆菌目则为优势菌目。研究结果可为深入了解2种鱼类的肠道微生物群落结构组成,及其与外部环境之间的关系奠定了基础。 展开更多
关键词 鱼类 新立河 16SrRNA 肠道微生物
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爬行动物TET基因家族生信分析
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作者 崔庆华 李建霞 梁照东 《绿色科技》 2024年第18期51-56,66,共7页
TET基因家族在哺乳动物生命活动中具有重要的功能,参与动物的发育、DNA修复、基因表达调控等过程。关于TET基因家族的研究多集中于哺乳动物,而在爬行动物中知之甚少。本研究选择18种爬行动物作为研究对象,采用生物信息学手段开展研究。... TET基因家族在哺乳动物生命活动中具有重要的功能,参与动物的发育、DNA修复、基因表达调控等过程。关于TET基因家族的研究多集中于哺乳动物,而在爬行动物中知之甚少。本研究选择18种爬行动物作为研究对象,采用生物信息学手段开展研究。本研究筛选获得54个TET基因家族数据,TET基因家族的系统发育分析发现,三类TET1-3基因分支结构模型分别为蛇形目、龟鳖目、鳄目、蜥蜴目。结果可为研究爬行动物适应机制的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 爬行动物 基因家族 生信分析
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