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王不留行药用植物麦蓝菜叶片转录组测序分析
1
作者
张超强
尉明杰
+5 位作者
张家银
杨彬
任培荣
景小强
张勇
王恩军
《中兽医医药杂志》
2025年第2期1-7,共7页
为获得王不留行的部分转录组信息特征,本研究基于Illumina 6000平台,对麦蓝菜叶片进行高通量测序,并组装了所有的转录本,原始数据上传NCBI数据库,登录号:PRJNA1149650。去冗余后得到99766条unigenes,在七大数据库中获得功能注释65079条...
为获得王不留行的部分转录组信息特征,本研究基于Illumina 6000平台,对麦蓝菜叶片进行高通量测序,并组装了所有的转录本,原始数据上传NCBI数据库,登录号:PRJNA1149650。去冗余后得到99766条unigenes,在七大数据库中获得功能注释65079条,其中NR数据库60784条(占比93.40%)、SwissProt数据库46761条(占比71.85%)、EggNOG数据库57269条(占比87.99%)、KEGG数据库20073条(占比30.84%)、COG/KOG数据库57269条(占比87.99%)、Pfam数据库55514条(占比85.30%)、GO数据库33791条(占比51.92%)。bHLH、bZIP和MYB等转录因子可能与王不留行黄酮类次生代谢产物合成有关,同时,还从99766条unigenes中检测出26243个位点。转录组数据的获得丰富了麦蓝菜基因数据库,为麦蓝菜遗传图谱构建、SSR标记开发、品种选育及解析王不留行黄酮类化合物次生代谢途径和调控机制研究提供了基础数据。
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关键词
王不留行
麦蓝菜
转录组
UNIGENE
转录因子
SSR标记
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职称材料
部分瑞香科植物韧皮部化学组分与纤维形态研究
被引量:
5
2
作者
张超强
赵灿星
+3 位作者
郝冰蕊
雷玉明
张文驹
童国林
《中国造纸学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期86-91,共6页
为评价几种瑞香科植物的纤维品质,分析了不同地区北江荛花、了哥王、多毛荛花、细轴荛花和狼毒2~3年生枝条韧皮或根皮纤维化学组分、纤维形态和细胞壁超微结构。结果表明,①不同地区北江荛花(64.25%~72.31%)、肇庆细轴荛花(71.33%)、多...
为评价几种瑞香科植物的纤维品质,分析了不同地区北江荛花、了哥王、多毛荛花、细轴荛花和狼毒2~3年生枝条韧皮或根皮纤维化学组分、纤维形态和细胞壁超微结构。结果表明,①不同地区北江荛花(64.25%~72.31%)、肇庆细轴荛花(71.33%)、多毛荛花(65.6%)和狼毒(59.04%)综纤维素含量均高于或接近优质传统手工纸原料檀皮(61.43%)和构皮(67.50%),而木质素含量均低于檀皮和构皮;②融水北江荛花纤维最长(5.51 mm),其次为遂昌北江荛花、肇庆北江荛花和狼毒,分别为5.40、5.09和5.05 mm,而茂名北江荛花纤维最短,仅为3.09 mm。融水北江荛花、肇庆北江荛花纤维长宽比较大,分别为565.2、538.4;③超微结构显示,城步北江荛花、融水北江荛花、遂昌北江荛花、肇庆北江荛花以及多毛荛花韧皮纤维细胞壁较薄,而茂名北江荛花、肇庆细轴荛花、狼毒和肇庆了哥王韧皮纤维细胞壁较厚。
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关键词
瑞香科
北江荛花
手工纸
纤维形态
化学组分
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职称材料
题名
王不留行药用植物麦蓝菜叶片转录组测序分析
1
作者
张超强
尉明杰
张家银
杨彬
任培荣
景小强
张勇
王恩军
机构
河西
学院生命科学与工程学院
河西走廊优势生物质资源转化与利用技术中心
复旦大学
生物
多样性与生态工程教育部重点实验室
生物
多样性研究所
甘肃省民乐县中医医院中医内科
河西
学院农业与生态工程学院
出处
《中兽医医药杂志》
2025年第2期1-7,共7页
基金
甘肃省自然科学基金(22JR11RG225)
河西学院博士科研启动金(KYQD2022013)
+3 种基金
甘肃省科技计划项目(23CXNG0006)
张掖市科技计划项目(ZY2022KY01)
河西学院校长基金创新团队项目(CXTD2022011)
大学生创新创业训练计划项目(202210740073,S202410740028)。
文摘
为获得王不留行的部分转录组信息特征,本研究基于Illumina 6000平台,对麦蓝菜叶片进行高通量测序,并组装了所有的转录本,原始数据上传NCBI数据库,登录号:PRJNA1149650。去冗余后得到99766条unigenes,在七大数据库中获得功能注释65079条,其中NR数据库60784条(占比93.40%)、SwissProt数据库46761条(占比71.85%)、EggNOG数据库57269条(占比87.99%)、KEGG数据库20073条(占比30.84%)、COG/KOG数据库57269条(占比87.99%)、Pfam数据库55514条(占比85.30%)、GO数据库33791条(占比51.92%)。bHLH、bZIP和MYB等转录因子可能与王不留行黄酮类次生代谢产物合成有关,同时,还从99766条unigenes中检测出26243个位点。转录组数据的获得丰富了麦蓝菜基因数据库,为麦蓝菜遗传图谱构建、SSR标记开发、品种选育及解析王不留行黄酮类化合物次生代谢途径和调控机制研究提供了基础数据。
关键词
王不留行
麦蓝菜
转录组
UNIGENE
转录因子
SSR标记
Keywords
Semen Vaccariae
Gypsophila vaccaria Sm.
transcriptome
unigene
transcription factor
SSR marker
分类号
S853.7 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
部分瑞香科植物韧皮部化学组分与纤维形态研究
被引量:
5
2
作者
张超强
赵灿星
郝冰蕊
雷玉明
张文驹
童国林
机构
河西
学院生命科学与工程学院
四川省原子能研究院
复旦大学
生物
多样性与生态工程教育部重点实验室
南京林业大学轻工与食品学院
河西走廊优势生物质资源转化与利用技术中心
河西
学院农业与生态工程学院
出处
《中国造纸学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期86-91,共6页
基金
甘肃省高等学校青年博士基金(2022QB-153)
甘肃省科技重点研发计划项目“河西走廊中药材病虫害绿色防控关键技术研究”(18YF1NG086)。
文摘
为评价几种瑞香科植物的纤维品质,分析了不同地区北江荛花、了哥王、多毛荛花、细轴荛花和狼毒2~3年生枝条韧皮或根皮纤维化学组分、纤维形态和细胞壁超微结构。结果表明,①不同地区北江荛花(64.25%~72.31%)、肇庆细轴荛花(71.33%)、多毛荛花(65.6%)和狼毒(59.04%)综纤维素含量均高于或接近优质传统手工纸原料檀皮(61.43%)和构皮(67.50%),而木质素含量均低于檀皮和构皮;②融水北江荛花纤维最长(5.51 mm),其次为遂昌北江荛花、肇庆北江荛花和狼毒,分别为5.40、5.09和5.05 mm,而茂名北江荛花纤维最短,仅为3.09 mm。融水北江荛花、肇庆北江荛花纤维长宽比较大,分别为565.2、538.4;③超微结构显示,城步北江荛花、融水北江荛花、遂昌北江荛花、肇庆北江荛花以及多毛荛花韧皮纤维细胞壁较薄,而茂名北江荛花、肇庆细轴荛花、狼毒和肇庆了哥王韧皮纤维细胞壁较厚。
关键词
瑞香科
北江荛花
手工纸
纤维形态
化学组分
Keywords
Thymelaeaceae
Wikstroemia monnula
handmade paper
fiber morphology
chemical component
分类号
TS721 [轻工技术与工程—制浆造纸工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
王不留行药用植物麦蓝菜叶片转录组测序分析
张超强
尉明杰
张家银
杨彬
任培荣
景小强
张勇
王恩军
《中兽医医药杂志》
2025
0
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职称材料
2
部分瑞香科植物韧皮部化学组分与纤维形态研究
张超强
赵灿星
郝冰蕊
雷玉明
张文驹
童国林
《中国造纸学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
5
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