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贵州仡佬族和苗族人群24个常染色体STR基因座的遗传多态性及遗传关系分析
被引量：
6
1
作者
刘亚举
李瑾
+2 位作者
岳俊涛
李学博
石美森
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第8期682-689,共8页
目的调查贵州仡佬族和苗族人群24个常染色体短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性,探讨其群体遗传关系。方法应用SureID■PanGlobal试剂盒对贵州399名仡佬族和333名苗族无关个体进行DNA扩增,采用3500XL遗传分析仪进行电泳分析,GeneMap...
目的调查贵州仡佬族和苗族人群24个常染色体短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性,探讨其群体遗传关系。方法应用SureID■PanGlobal试剂盒对贵州399名仡佬族和333名苗族无关个体进行DNA扩增,采用3500XL遗传分析仪进行电泳分析,GeneMapperID-Xv1.5软件分析等位基因片段大小。统计分析24个STR基因座的频率数据和法医遗传学参数,并与其他地区已有人群数据进行比较。结果贵州仡佬族和苗族各基因座个体识别率(DP)值分别为0.7833~0.9909和0.8010~0.9909,多态信息含量(PIC)值分别为0.5608~0.9385和0.5677~0.9414。累积个体识别率(TDP)分别为1-7.6036×10^-30和1-6.8630×10^-30,累积非父排除率(CPE)分别为1-1.9608×10^-11和1-1.9738×10^-11。Nei'sDA遗传距离矩阵分析发现,贵州仡佬族与湖北汉族遗传距离最小(0.0205),与云南苗族的遗传距离最大(0.0449);贵州苗族与湖南汉族的遗传距离最小(0.0033),与云南苗族的遗传距离最大(0.0363)。结论24个STR基因座在贵州仡佬族和苗族人群中具有丰富的遗传多态性。研究不同民族群体的遗传多样性对了解其起源、迁移以及相互关系有重要意义。
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关键词
常染色体短串联重复序列
遗传多态性
Neighbor-Joining系统发育树
遗传关系
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职称材料
潮汕汉族群体27个Y-STR基因座的单倍型及遗传关系分析
2
作者
田庆花
王俊方
+2 位作者
张晶
刘亚举
石美森
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期217-223,共7页
目的调查Yfiler~?Plus试剂盒中所包含的27个Y-STR基因座在潮汕汉族男性群体中的单倍型数据,探讨其群体遗传关系及法医学应用价值。方法应用Yfiler~?Plus试剂盒对795名广东潮汕汉族无关男性个体外周血样进行27个Y-STR基因座分型检测,统...
目的调查Yfiler~?Plus试剂盒中所包含的27个Y-STR基因座在潮汕汉族男性群体中的单倍型数据,探讨其群体遗传关系及法医学应用价值。方法应用Yfiler~?Plus试剂盒对795名广东潮汕汉族无关男性个体外周血样进行27个Y-STR基因座分型检测,统计分析各基因座的等位基因频率及单倍型多样性,并结合目前国内外已公开发表的其他13个群体相同基因座的单倍型资料,分析潮汕汉族群体的遗传距离和聚类关系。结果 795名无关男性个体中共观察到787种单倍型,其中779种单倍型为唯一单倍型,8种单倍型分别出现两次。单倍型多样性(HD)为0.999975,系统识别能力(DC)达到98.99%。27个Y-STR基因座基因多态性(GD)范围为0.3637(DYS391)~0.9559(DYS385a/b);遗传距离Rst矩阵分析发现,潮汕汉族与广东汉族之间的遗传距离最近(0.0036),与甘肃藏族(0.0935)之间的遗传距离相对较远;基于遗传距离所构建的多维尺度分析MDS图与聚类分析结果基本相符。结论 Yfiler~?Plus试剂盒中包含的27个Y-STR基因座在潮汕汉族群体中具有丰富的遗传多态性,对建立Y染色体数据库,研究群体遗传学和进行法医学应用有重要意义。
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关键词
Y染色体短串联重复序列
单倍型
多维尺度分析
汉族
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职称材料
题名
贵州仡佬族和苗族人群24个常染色体STR基因座的遗传多态性及遗传关系分析
被引量：
6
1
作者
刘亚举
李瑾
岳俊涛
李学博
石美森
机构
河南许昌市公安局刑事科学技术研究所
山东省高校证据鉴识重点实验室
中国政法大学
刑事
司法学院侦查学
研究所
出处
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第8期682-689,共8页
基金
国家自然科学基金(81671874)
中国博士后科学基金(2017M612701)
山东省自然科学基金(ZR2014HQ018)~~
文摘
目的调查贵州仡佬族和苗族人群24个常染色体短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性,探讨其群体遗传关系。方法应用SureID■PanGlobal试剂盒对贵州399名仡佬族和333名苗族无关个体进行DNA扩增,采用3500XL遗传分析仪进行电泳分析,GeneMapperID-Xv1.5软件分析等位基因片段大小。统计分析24个STR基因座的频率数据和法医遗传学参数,并与其他地区已有人群数据进行比较。结果贵州仡佬族和苗族各基因座个体识别率(DP)值分别为0.7833~0.9909和0.8010~0.9909,多态信息含量(PIC)值分别为0.5608~0.9385和0.5677~0.9414。累积个体识别率(TDP)分别为1-7.6036×10^-30和1-6.8630×10^-30,累积非父排除率(CPE)分别为1-1.9608×10^-11和1-1.9738×10^-11。Nei'sDA遗传距离矩阵分析发现,贵州仡佬族与湖北汉族遗传距离最小(0.0205),与云南苗族的遗传距离最大(0.0449);贵州苗族与湖南汉族的遗传距离最小(0.0033),与云南苗族的遗传距离最大(0.0363)。结论24个STR基因座在贵州仡佬族和苗族人群中具有丰富的遗传多态性。研究不同民族群体的遗传多样性对了解其起源、迁移以及相互关系有重要意义。
关键词
常染色体短串联重复序列
遗传多态性
Neighbor-Joining系统发育树
遗传关系
Keywords
autosomal short tandem repeats
genetic polymorphism
Neighbor-Joining tree
genetic relationships
分类号
R349.69 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
潮汕汉族群体27个Y-STR基因座的单倍型及遗传关系分析
2
作者
田庆花
王俊方
张晶
刘亚举
石美森
机构
中国政法大学证据
科学
教育部重点实验室
出处
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期217-223,共7页
基金
国家自然科学基金(81671874)
中国政法大学研究生创新实践项目(2015SSCX160)~~
文摘
目的调查Yfiler~?Plus试剂盒中所包含的27个Y-STR基因座在潮汕汉族男性群体中的单倍型数据,探讨其群体遗传关系及法医学应用价值。方法应用Yfiler~?Plus试剂盒对795名广东潮汕汉族无关男性个体外周血样进行27个Y-STR基因座分型检测,统计分析各基因座的等位基因频率及单倍型多样性,并结合目前国内外已公开发表的其他13个群体相同基因座的单倍型资料,分析潮汕汉族群体的遗传距离和聚类关系。结果 795名无关男性个体中共观察到787种单倍型,其中779种单倍型为唯一单倍型,8种单倍型分别出现两次。单倍型多样性(HD)为0.999975,系统识别能力(DC)达到98.99%。27个Y-STR基因座基因多态性(GD)范围为0.3637(DYS391)~0.9559(DYS385a/b);遗传距离Rst矩阵分析发现,潮汕汉族与广东汉族之间的遗传距离最近(0.0036),与甘肃藏族(0.0935)之间的遗传距离相对较远;基于遗传距离所构建的多维尺度分析MDS图与聚类分析结果基本相符。结论 Yfiler~?Plus试剂盒中包含的27个Y-STR基因座在潮汕汉族群体中具有丰富的遗传多态性,对建立Y染色体数据库,研究群体遗传学和进行法医学应用有重要意义。
关键词
Y染色体短串联重复序列
单倍型
多维尺度分析
汉族
Keywords
Y-chromosomal short tandem repeats（Y-STR）
haplotype
multi-dimensional scaling
Han nationality
分类号
R349.69 [医药卫生]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
贵州仡佬族和苗族人群24个常染色体STR基因座的遗传多态性及遗传关系分析
刘亚举
李瑾
岳俊涛
李学博
石美森
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019
6
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下载PDF
职称材料
2
潮汕汉族群体27个Y-STR基因座的单倍型及遗传关系分析
田庆花
王俊方
张晶
刘亚举
石美森
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017
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