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陆地棉低磷胁迫应答基因GhGDPD1的克隆与表达分析
被引量：
5
1
作者
孟超敏
耿翡翡
+3 位作者
卿桂霞
张富厚
李雪林
刘逢举
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期723-730,共8页
【目的】基于前期陆地棉‘新陆早19’Gossypium hirsutum‘Xinluzao 19’根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。【方法】克隆陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因并进行基因组DNA与cDNA测序分...
【目的】基于前期陆地棉‘新陆早19’Gossypium hirsutum‘Xinluzao 19’根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。【方法】克隆陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhGDPD1的基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与实时荧光定量PCR (RT-qPCR)的方法检测该基因于根、茎、叶、花等4个组织的基因表达量的变化以及低磷胁迫下的表达模式。【结果】成功克隆GhGDPD1基因,开放阅读框序列长度为1 149 bp,共编码382个氨基酸,属于GDPD家族,其中存在一个保守结构域,名为GDPD_GDE5_like_1_plant。半定量RT-PCR和RT-qPCR试验结果均显示:GhGDPD1基因主要表达于根,中量表达于花和茎,微量表达于叶。该基因在受到低磷胁迫的刺激后,立即会对低磷胁迫做出应答,胁迫4 h相对表达量达到最高值。【结论】首次成功克隆到陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因,获得了GhGDPD1基因的组织表达以及低磷胁迫下的表达模式,为深入解析棉花GhGDPD1基因的生物学功能以及培育棉花磷高效利用新种质提供科学参考。
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关键词
陆地棉
低磷胁迫
基因克隆
生物信息学分析
表达分析
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职称材料
陆地棉磷高效基因GhMGD3的克隆与表达分析
被引量：
2
2
作者
孟超敏
耿翡翡
+3 位作者
卿桂霞
周佳敏
张富厚
刘逢举
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1203-1211,共9页
【目的】基于前期陆地棉Gossypium hirsutum根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。【方法】克隆GhMGD3基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhMGD3的基因结构和进...
【目的】基于前期陆地棉Gossypium hirsutum根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。【方法】克隆GhMGD3基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhMGD3的基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与实时荧光定量PCR (RT-qPCR)的方法检测该基因在根、茎、叶、花4个组织中的基因表达量的变化以及低磷胁迫下的表达模式。【结果】成功克隆了陆地棉GhMGD3基因。GhMGD3基因的编码序列全长为681 bp,共编码226个氨基酸,存在3个内含子,分子量是26 610.54 Da,等电点为8.74,是稳定的亲水碱性蛋白。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。该蛋白不存在信号肽、跨膜结构域、N-糖基化位点,但含有多个磷酸化位点。亚细胞定位结果显示:该基因编码的蛋白定位于叶绿体。GhMGD3蛋白与木槿Hibiscus syriacus氨基酸序列相似性较高,其亲缘关系最近。半定量RT-PCR和RT-qPCR试验结果均表示:GhMGD3基因主要表达于根,中量表达于茎,微量表达于叶和花,在低磷胁迫72 h时其相对表达量达到最高值。【结论】首次成功克隆到了陆地棉GhMGD3基因,获得了GhMGD3基因的组织表达以及低磷胁迫下的表达模式,GhMGD3基因在棉花磷高效利用信号调控中具有重要作用。图7表1参27。
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关键词
陆地棉
低磷胁迫
基因克隆
表达分析
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职称材料
国审高产优质强筋小麦新品种科大1026
被引量：
2
3
作者
王林生
王新天
+6 位作者
张雅莉
马指挥
王世雨
郭媛
杨晓雨
魏青
韩睿
《中国种业》
2022年第8期156-157,共2页
科大1026是以半冬性优质多穗型小麦品种豫麦46为母本、半冬性优质强筋小麦品种郑麦9405为父本,采用常规育种与分子标记辅助选择相结合,经多年选育而成的半冬性、半矮秆、高产、优质、强筋小麦新品种,2021年通过国家农作物品种审定委员...
科大1026是以半冬性优质多穗型小麦品种豫麦46为母本、半冬性优质强筋小麦品种郑麦9405为父本,采用常规育种与分子标记辅助选择相结合,经多年选育而成的半冬性、半矮秆、高产、优质、强筋小麦新品种,2021年通过国家农作物品种审定委员会审定(国审麦20210044),已被列为河南省优质专用小麦种植指导性计划主导品种。
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关键词
小麦
优质强筋
新品种
科大1026
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题名
陆地棉低磷胁迫应答基因GhGDPD1的克隆与表达分析
被引量：
5
1
作者
孟超敏
耿翡翡
卿桂霞
张富厚
李雪林
刘逢举
机构
河南科技大学
农学院
河南科技大学洛阳市作物遗传改良与种质创新重点实验室
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家
重点
实验室
出处
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期723-730,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(31101184)。
文摘
【目的】基于前期陆地棉‘新陆早19’Gossypium hirsutum‘Xinluzao 19’根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。【方法】克隆陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhGDPD1的基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与实时荧光定量PCR (RT-qPCR)的方法检测该基因于根、茎、叶、花等4个组织的基因表达量的变化以及低磷胁迫下的表达模式。【结果】成功克隆GhGDPD1基因,开放阅读框序列长度为1 149 bp,共编码382个氨基酸,属于GDPD家族,其中存在一个保守结构域,名为GDPD_GDE5_like_1_plant。半定量RT-PCR和RT-qPCR试验结果均显示:GhGDPD1基因主要表达于根,中量表达于花和茎,微量表达于叶。该基因在受到低磷胁迫的刺激后,立即会对低磷胁迫做出应答,胁迫4 h相对表达量达到最高值。【结论】首次成功克隆到陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因,获得了GhGDPD1基因的组织表达以及低磷胁迫下的表达模式,为深入解析棉花GhGDPD1基因的生物学功能以及培育棉花磷高效利用新种质提供科学参考。
关键词
陆地棉
低磷胁迫
基因克隆
生物信息学分析
表达分析
Keywords
Gossypium hirsutum
low phosphorus stress
gene cloning
bioinformatics analysis
expression analysis
分类号
S330 [农业科学—作物遗传育种]
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
陆地棉磷高效基因GhMGD3的克隆与表达分析
被引量：
2
2
作者
孟超敏
耿翡翡
卿桂霞
周佳敏
张富厚
刘逢举
机构
河南科技大学
农学院
河南科技大学洛阳市作物遗传改良与种质创新重点实验室
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家
重点
实验室
出处
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1203-1211,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(31101184)。
文摘
【目的】基于前期陆地棉Gossypium hirsutum根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。【方法】克隆GhMGD3基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhMGD3的基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与实时荧光定量PCR (RT-qPCR)的方法检测该基因在根、茎、叶、花4个组织中的基因表达量的变化以及低磷胁迫下的表达模式。【结果】成功克隆了陆地棉GhMGD3基因。GhMGD3基因的编码序列全长为681 bp,共编码226个氨基酸,存在3个内含子,分子量是26 610.54 Da,等电点为8.74,是稳定的亲水碱性蛋白。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。该蛋白不存在信号肽、跨膜结构域、N-糖基化位点,但含有多个磷酸化位点。亚细胞定位结果显示:该基因编码的蛋白定位于叶绿体。GhMGD3蛋白与木槿Hibiscus syriacus氨基酸序列相似性较高,其亲缘关系最近。半定量RT-PCR和RT-qPCR试验结果均表示:GhMGD3基因主要表达于根,中量表达于茎,微量表达于叶和花,在低磷胁迫72 h时其相对表达量达到最高值。【结论】首次成功克隆到了陆地棉GhMGD3基因,获得了GhMGD3基因的组织表达以及低磷胁迫下的表达模式,GhMGD3基因在棉花磷高效利用信号调控中具有重要作用。图7表1参27。
关键词
陆地棉
低磷胁迫
基因克隆
表达分析
Keywords
Gossypium hirsutum
low phosphorus stress
gene cloning
expression analysis
分类号
S33 [农业科学—作物遗传育种]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
国审高产优质强筋小麦新品种科大1026
被引量：
2
3
作者
王林生
王新天
张雅莉
马指挥
王世雨
郭媛
杨晓雨
魏青
韩睿
机构
河南科技大学
/
洛阳市
作物
遗传
改良与
种质
创新
重点
实验室
河南
大学
河南
神麦种业
科技
有限公司
出处
《中国种业》
2022年第8期156-157,共2页
基金
河南省科技攻关项目(182102110207)。
文摘
科大1026是以半冬性优质多穗型小麦品种豫麦46为母本、半冬性优质强筋小麦品种郑麦9405为父本,采用常规育种与分子标记辅助选择相结合,经多年选育而成的半冬性、半矮秆、高产、优质、强筋小麦新品种,2021年通过国家农作物品种审定委员会审定(国审麦20210044),已被列为河南省优质专用小麦种植指导性计划主导品种。
关键词
小麦
优质强筋
新品种
科大1026
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
陆地棉低磷胁迫应答基因GhGDPD1的克隆与表达分析
孟超敏
耿翡翡
卿桂霞
张富厚
李雪林
刘逢举
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
5
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职称材料
2
陆地棉磷高效基因GhMGD3的克隆与表达分析
孟超敏
耿翡翡
卿桂霞
周佳敏
张富厚
刘逢举
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
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职称材料
3
国审高产优质强筋小麦新品种科大1026
王林生
王新天
张雅莉
马指挥
王世雨
郭媛
杨晓雨
魏青
韩睿
《中国种业》
2022
2
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