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肝硬化患者胆囊结石发生率及其影响因素分析被引量：14: 1; 作者刘晓敏王萍 +4 位作者王宏运张腊梅周新许锦锦张英剑《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2016年第19期3212-3215,共4页; 目的:了解肝硬化患者胆囊结石的发生率,同时分析其影响因素及临床意义。方法:选择2014年10月至2015年8月在河南科技大学第一附属医院诊治的128例肝硬化患者为肝硬化组,并以同期门诊行体检者140例为健康对照组;其中肝硬化组根据肝功能Chi... 展开更多; 关键词肝硬化胆囊结石胆囊收缩素腹水肝功能分级; 在线阅读下载PDF 职称材料

志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列的检测及同源性分析被引量：4: 2; 作者王鹏飞王颖芳 +5 位作者段广才王琳琳郭向娇薛泽润郗园林杨海燕《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期261-268,I0003,共9页; 目的:检测志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR),并与GenBank全基因组中志贺菌重复序列和间隔序列对比,分析其结构特征及同源性。方法:利用PCR法扩增获得志贺菌CRISPR,采用生物信息学方法对重复序列及间隔序列进行同源性分析;运... 展开更多; 关键词志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列重复序列间隔序列同源性; 在线阅读下载PDF 职称材料

志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列与毒力基因和耐药基因的关系被引量：3: 3; 作者王颖芳王鹏飞 +3 位作者詹煜慧张晓萌段广才郗园林《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期71-75,共5页; 目的探索志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)与毒力基因和耐药基因的关系。方法从GenBank数据库中获得志贺菌的基因组、毒力基因和耐药基因的序列,通过多序列比... 展开更多; 关键词志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列毒力基因耐药基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列的特点及其关联性分析被引量：1: 4; 作者王颖芳王鹏飞 +3 位作者段广才郗园林张晓萌詹煜慧《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1131-1137,共7页; 目的:利用数据库和临床分离的志贺菌菌株分析志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR)的特点,探讨CRISPR-Q1的特性及CRISPR间的关联性。方法:根据志贺菌基因组数据库利用引物序列和PCR扩增获得志贺菌的CRISPR序列信息,采用多序列... 展开更多; 关键词志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列间隔序列基因外重复序列; 在线阅读下载PDF 职称材料

O157∶H7型大肠埃希菌CRISPR/Cas系统结构的生物信息学分析: 5; 作者王鹏飞王颖芳 +4 位作者段广才詹煜慧陈帅印郗园林徐亚珂《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第2期363-371,共9页; 为了解O157∶H7型大肠埃希菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)分布和结构特征及cas基因分布情况,本试验通过GenBank数据库和CRISPRdb database获得92株O157∶H7型大... 展开更多; 关键词 O157∶H7型大肠埃希菌 CRISPR CAS; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名肝硬化患者胆囊结石发生率及其影响因素分析被引量：14: 1; 作者刘晓敏王萍王宏运张腊梅周新许锦锦张英剑; 机构河南科技大学临床医学院河南科技大学医学院公共卫生教研室; 出处《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2016年第19期3212-3215,共4页; 基金二〇一五年度河南省医学科技攻关计划项目(编号:201504039); 文摘目的:了解肝硬化患者胆囊结石的发生率,同时分析其影响因素及临床意义。方法:选择2014年10月至2015年8月在河南科技大学第一附属医院诊治的128例肝硬化患者为肝硬化组,并以同期门诊行体检者140例为健康对照组;其中肝硬化组根据肝功能Child-Pugh分级标准分为肝功A级(A组)、肝功B级(B组)、肝功C级(C组)。对所有研究对象进行空腹血清ALB、空腹血清CCK水平的测定。分析肝硬化胆囊结石的发生与性别、肝功能Child-Pugh分级、腹腔积液、血清ALB及CCK的关系。结果:(1)单因素分析结果显示:肝硬化组胆囊结石的发生率明显高于健康对照组(35.2%vs 8.6%,P<0.05);且随着肝功能损害程度加重,胆囊结石的发生率随之升高,即B组和C组患者的胆囊结石发生率显著高于A组患者(A组22.9%vs B组35.0%vs C组50.0%,P<0.05)。肝硬化并发腹腔积液患者的胆囊结石发生率较无腹腔积液、健康对照组明显升高(38.6%vs 22.2%vs 8.6%,P<0.05)。肝硬化组血清ALB水平较健康对照组降低(P<0.05),且随着肝功能损害程度加重而变化;而肝硬化组血清CCK水平明显高于健康对照组(P<0.05),同样随着肝功能损害程度加重而变化。肝硬化患者胆囊结石发生率无性别差异(P>0.05)。(2)多因素Logistic回归结果显示:血清ALB含量是影响肝硬化患者胆囊结石发生的重要影响因素,结果有统计学意义(P<0.05),其他影响因素无统计学意义(P>0.05)。结论 :肝硬化患者易发生胆囊结石,其发生与性别无关,而与肝功能损害程度、腹腔积液、血清ALB及CCK水平等有关,其中ALB是肝硬化患者伴胆囊结石的重要影响因素。; 关键词肝硬化胆囊结石胆囊收缩素腹水肝功能分级; Keywords Liver cirrhosis Cholecystolithiasis Cholecystokinin Ascites Liver function score; 分类号 R657.42 [医药卫生—外科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列的检测及同源性分析被引量：4: 2; 作者王鹏飞王颖芳段广才王琳琳郭向娇薛泽润郗园林杨海燕; 机构郑州大学公共卫生学院流行病学教研室河南科技大学医学院公共卫生教研室新乡医学院分子诊断与医学检验技术河南省协同创新中心; 出处《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期261-268,I0003,共9页; 基金国家科技重大专项基金资助课题(2013ZX10004607); 文摘目的:检测志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR),并与GenBank全基因组中志贺菌重复序列和间隔序列对比,分析其结构特征及同源性。方法:利用PCR法扩增获得志贺菌CRISPR,采用生物信息学方法对重复序列及间隔序列进行同源性分析;运用多序列比对分析间隔序列特点及其与侧翼序列间的联系;BLAST分析间隔序列与质粒和噬菌体的同源性;weblogo分析重复序列碱基频率及RNAfold预测其RNA二级结构;重复序列的同源聚类分析并用BLAST分析重复序列与其他细菌的同源性。结果:被测3株临床志贺菌及9株全基因组志贺菌中均含有不同数量CRISPR;同一个CRISPR中,间隔序列有的相似、有的完全不同,某些CRISPR间隔序列的部分序列与CRISPR侧翼序列存在同源性,某些间隔序列可能是信息基因和操纵基因的拼接重组;重复序列保守性不一致,可能与细菌进化存在一定的联系,重复序列碱基的差异影响茎的长度,从而影响二级结构的稳定性及CRISPR的功能。重复序列与个别远缘菌种具有较高的同源性。结论:志贺菌存在多样的CRISPR结构,不同CRISPR的重复序列保守性不同。某些间隔序列部分与CRISPR侧翼序列同源,某些间隔序列是多基因拼接而成。; 关键词志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列重复序列间隔序列同源性; Keywords Shigella clustered regularly interspaced short palindromic repeats repeats spacers homology; 分类号 Q93 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列与毒力基因和耐药基因的关系被引量：3: 3; 作者王颖芳王鹏飞詹煜慧张晓萌段广才郗园林; 机构河南科技大学医学院公共卫生教研室河南科技大学医院河南科技大学医学院郑州大学公共卫生学院流行病学教研室; 出处《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期71-75,共5页; 基金国家科技重大专项资助项目(No.2013ZX10004607 No.2018ZX10301407)~~; 文摘目的探索志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)与毒力基因和耐药基因的关系。方法从GenBank数据库中获得志贺菌的基因组、毒力基因和耐药基因的序列,通过多序列比对等方法获得志贺菌中CRISPR1、CRISPR2和CRISPR-Q1的分布情况、重复序列和间隔序列信息,通过BLAST方法获得毒力基因和耐药基因在志贺菌中的分布情况,SPSS 21.0软件分析CRISPR与毒力基因和耐药基因的关系。结果志贺菌中的CRISPR1和CRISPR2在不同菌株中的间隔序列差别较大,CRISPRQ1分布更为广泛(超过99%)。毒力基因在志贺菌中分布比较广泛(均超过56%),耐药基因中的blaOXA-1、camr、Sul2、tetB分布也比较广(超过50%)。CRISPR1/CRISPR2与是否携带9种毒力基因、4种耐药基因有关(P<0.05),CRISPR-Q1与是否携带3种毒力基因、4种耐药基因有关(P<0.05)。CRISPR1/CRISPR2和CRISPR-Q1均与志贺菌中存在的毒力基因和耐药基因的个数间有统计学关联(P<0.05)。CRISPR1/CRISPR2与CRISPR-Q1的间隔序列数目之间存在统计学关联(χ2=61.6,P<0.001)。结论志贺菌中不同CRISPR的分布差异比较大,存在的间隔序列数目不等;志贺菌CRISPR与部分毒力基因和耐药基因之间存在负相关;CRISPR1/CRISPR2与CRISPR-Q1的间隔序列数目存在正相关。; 关键词志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列毒力基因耐药基因; Keywords Shigella clustered regularly interspaced short palindromic repeats resistance gene virulence gene; 分类号 Q93 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列的特点及其关联性分析被引量：1: 4; 作者王颖芳王鹏飞段广才郗园林张晓萌詹煜慧; 机构河南科技大学医学院公共卫生教研室郑州大学公共卫生学院流行病学教研室河南科技大学医院河南科技大学医学院; 出处《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1131-1137,共7页; 基金国家科技部重大专项资助课题(2013ZX10004607 2018ZX10301407); 文摘目的:利用数据库和临床分离的志贺菌菌株分析志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR)的特点,探讨CRISPR-Q1的特性及CRISPR间的关联性。方法:根据志贺菌基因组数据库利用引物序列和PCR扩增获得志贺菌的CRISPR序列信息,采用多序列比对等方法获得每个菌株中CRISPR的分布、间隔序列数及序列特点;利用BLAST分析CRISPR-Q1中重复序列和间隔序列,检测重复序列和间隔序列在菌株中的分布特点以及CRISPR-Q1在菌株中的位置及特征;分析数据库和实验室中志贺菌CRISPR-Q1中间隔序列数与CRISPR1或CRISPR2的关系。结果:在数据库107株志贺菌中,106株志贺菌含有CRISPR1或CRISPR2,8株志贺菌的CRISPR1或CRISPR2含有多个间隔序列;106株志贺菌含有CRISPR-Q1,其中有13株志贺菌的CRISPR-Q1中有多个间隔序列。在实验室12株志贺菌中,有6株含有CRISPR1或CRISPR2,12株均含有CRISPR-Q1;CRISPR-Q1间隔序列中的一部分(约35bp)在同一个菌株的染色体基因组上分布广泛,重复序列同样如此,CRISPR-Q1中还存在基因外重复序列(REP)元素。数据库志贺菌中的CRISPR-Q1间隔序列数与CRISPR1和CRISPR2有关联(χ~2=61.6,P<0.01),实验室志贺菌中的CRISPR-Q1间隔序列数与CRISPR1和CRISPR2有关联(P=0.015)。结论:CRISPR-Q1在志贺菌中广泛分布,其序列中存在REP元素;志贺菌的CRISPR1和CRISPR2与CRISPR-Q1有关联。; 关键词志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列间隔序列基因外重复序列; Keywords Shigella clustered regularly interspaced short palindromic repeats spacer repetitive extragenic palindromic; 分类号 Q93 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名O157∶H7型大肠埃希菌CRISPR/Cas系统结构的生物信息学分析: 5; 作者王鹏飞王颖芳段广才詹煜慧陈帅印郗园林徐亚珂; 机构河南科技大学医院河南科技大学医学院郑州大学公共卫生学院; 出处《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第2期363-371,共9页; 基金国家科技部重大专项资助课题(2013ZX10004607、2018ZX10301407); 文摘为了解O157∶H7型大肠埃希菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)分布和结构特征及cas基因分布情况,本试验通过GenBank数据库和CRISPRdb database获得92株O157∶H7型大肠埃希菌全基因组序列、CRISPR位点位置、CRISPR的侧翼序列及cas基因簇的序列范围,利用多序列比对、启动子预测和RNA二级结构预测等方法分析细菌中CRISPR系统的特点。结果显示,O157∶H7型大肠埃希菌的基因组存在3个CRISPR位点(CRISPR1、CRISPR2和CRISPR3),每个CRISPR位点上的序列一致;CRISPR1和CRISPR2的重复序列可形成茎环状结构,环上的碱基易发生变化;CRISPR2中存在一段长451 bp的序列(命名为序列X),该序列X将CRISPR2分为2个部分CRISPR2a和CRISPR2b,其碱基A和T比例为74%,在91株O157∶H7型大肠埃希菌中均存在该序列,在该序列中可预测出至少有1个启动子和9个转录因子结合位点;侧翼序列中的疑似前导序列位于CRISPR2下游,序列长340 bp,其碱基A和T比例为69%,在92株O157∶H7型细菌中均存在该序列,其可预测出至少有1个启动子和3个转录因子结合位点;在20株O157∶H7型大肠埃希菌的全基因组序列中,有15株具有完整的cas基因簇,有5株缺乏cas 3基因。本试验结果表明,O157∶H7型大肠埃希菌的CRISPR系统结构稳定,序列具有较高保守性,cas基因簇也相对保守。CRISPR2的结构与其他类型大肠埃希菌有较大差别。本研究发现的序列X在O157∶H7型大肠埃希菌分布广泛且序列保守,可作为鉴定O157∶H7型大肠埃希菌的潜在分子靶标。; 关键词 O157∶H7型大肠埃希菌 CRISPR CAS; Keywords Escherichia coli O157∶H7 CRISPR cas; 分类号 S852.61 [农业科学—基础兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	肝硬化患者胆囊结石发生率及其影响因素分析	刘晓敏王萍王宏运张腊梅周新许锦锦张英剑	《实用医学杂志》 CAS 北大核心	2016	14	在线阅读下载PDF 职称材料
2	志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列的检测及同源性分析	王鹏飞王颖芳段广才王琳琳郭向娇薛泽润郗园林杨海燕	《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2015	4	在线阅读下载PDF 职称材料
3	志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列与毒力基因和耐药基因的关系	王颖芳王鹏飞詹煜慧张晓萌段广才郗园林	《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2019	3	在线阅读下载PDF 职称材料
4	志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列的特点及其关联性分析	王颖芳王鹏飞段广才郗园林张晓萌詹煜慧	《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2018	1	在线阅读下载PDF 职称材料
5	O157∶H7型大肠埃希菌CRISPR/Cas系统结构的生物信息学分析	王鹏飞王颖芳段广才詹煜慧陈帅印郗园林徐亚珂	《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心	2020	0	在线阅读下载PDF 职称材料