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猪链球菌rpoE基因克隆及生物信息学分析
1
作者
杜炎斌
张港琛
+4 位作者
王瑜欣
刘宝宝
宫胜龙
东笑
汪洋
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第7期1149-1154,共6页
本研究旨在克隆猪链球菌rpoE基因,并通过生物信息学软件预测分析猪链球菌rpoE基因编码蛋白功能及其调节机制。以猪链球菌基因组为模板扩增rpoE基因,成功测序后通过生物信息学软件预测该基因编码蛋白的理化性质、抗原表位等。结果表明,...
本研究旨在克隆猪链球菌rpoE基因,并通过生物信息学软件预测分析猪链球菌rpoE基因编码蛋白功能及其调节机制。以猪链球菌基因组为模板扩增rpoE基因,成功测序后通过生物信息学软件预测该基因编码蛋白的理化性质、抗原表位等。结果表明,成功克隆的猪链球菌rpoE基因全长582 bp,编码一种富含谷氨酸、天冬氨酸及丝氨酸的亲水性胞质蛋白;二级结构分析显示,RpoE蛋白主要结构元件为α-螺旋和无规则卷曲,分别占52.3%和36.3%。综合分析认为,RpoE蛋白上存在5个优势抗原表位。
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关键词
猪链球菌
RpoE
克隆
生物信息学
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题名
猪链球菌rpoE基因克隆及生物信息学分析
1
作者
杜炎斌
张港琛
王瑜欣
刘宝宝
宫胜龙
东笑
汪洋
机构
河南科技大学动物科技学院洛阳市畜禽分子病原与免疫学重点实验室
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第7期1149-1154,共6页
基金
国家自然科学基金(31772761)
河南省自然科学基金(182300410047)。
文摘
本研究旨在克隆猪链球菌rpoE基因,并通过生物信息学软件预测分析猪链球菌rpoE基因编码蛋白功能及其调节机制。以猪链球菌基因组为模板扩增rpoE基因,成功测序后通过生物信息学软件预测该基因编码蛋白的理化性质、抗原表位等。结果表明,成功克隆的猪链球菌rpoE基因全长582 bp,编码一种富含谷氨酸、天冬氨酸及丝氨酸的亲水性胞质蛋白;二级结构分析显示,RpoE蛋白主要结构元件为α-螺旋和无规则卷曲,分别占52.3%和36.3%。综合分析认为,RpoE蛋白上存在5个优势抗原表位。
关键词
猪链球菌
RpoE
克隆
生物信息学
Keywords
Streptococcus suis
RpoE
clone
bioinformatic analysis
分类号
S855.1 [农业科学—临床兽医学]
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作者
出处
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1
猪链球菌rpoE基因克隆及生物信息学分析
杜炎斌
张港琛
王瑜欣
刘宝宝
宫胜龙
东笑
汪洋
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2020
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