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牙龈卟啉单胞菌诱导线粒体转录因子A高表达在食管鳞癌中的临床意义 被引量:4
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作者 刘怡文 周福有 +3 位作者 杨海军 李军扩 代宁涛 高社干 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期453-466,共14页
目的:分析食管鳞癌(ESCC)中牙龈卟啉单胞菌(Pg)对线粒体转录因子A(TFAM)的诱导效应,并探讨其潜在机制及临床意义。方法:采用Western blot、qRT-PCR及线粒体压力测试检测Pg感染不同时间(24 h及48 h)ESCC细胞KYSE450及KYSE150中TFAM蛋白与... 目的:分析食管鳞癌(ESCC)中牙龈卟啉单胞菌(Pg)对线粒体转录因子A(TFAM)的诱导效应,并探讨其潜在机制及临床意义。方法:采用Western blot、qRT-PCR及线粒体压力测试检测Pg感染不同时间(24 h及48 h)ESCC细胞KYSE450及KYSE150中TFAM蛋白与mRNA表达量及线粒体氧化磷酸化水平的变化。建立TFAM敲降的稳定细胞系KYSE150-T,分别用Pg感染KYSE150及KYSE150-T,将细胞分为4组:KYSE150组、KYSE150-T组、KYSE150+Pg组及KYSE150-T+Pg组。通过Western blot、qRT-PCR、线粒体压力测试、CCK-8、平板克隆及Transwell法检测各组细胞的TFAM蛋白与mRNA表达量、线粒体氧化磷酸化功能及体外增殖与侵袭能力差异。采用免疫组化法检测384例ESCC患者癌组织及相应癌旁组织中Pg感染及TFAM蛋白的表达情况。利用卡方检验分析二者与ESCC患者临床病理特征之间的相关性。采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,通过Log-rank分析Pg感染及TFAM高表达与患者生存时间的相关性。结果:Pg感染可诱导KYSE450及KYSE150中TFAM蛋白与mRNA表达量增加,线粒体氧化磷酸化功能增强,且具有时间依赖性(P<0.05)。与KYSE150组相比,KYSE150+Pg组细胞的TFAM蛋白与mRNA表达量均显著增加(P<0.05),线粒体氧化磷酸化功能、体外增殖及侵袭能力均显著增强(P<0.05),而KYSE150-T组上述各指标则显著减少、降低(P<0.05);与KYSE150+Pg组相比,KYSE150-T+Pg组细胞的上述各指标均显著减少、降低(P<0.05)。ESCC组织中Pg感染率及TFAM阳性率分别为41.15%及43.23%,二者具有显著一致性(P<0.05)。Pg感染及TFAM高表达的患者多为有吸烟、饮酒史的男性患者,且肿瘤分化程度低、浸润程度深、淋巴结转移率高、临床分期多为Ⅲ/Ⅳ期(P<0.05)。Pg感染及TFAM高表达阳性的患者5年生存期均会缩短,且二者共阳性的患者5年生存期缩短更为显著(P<0.05)。结论:Pg可通过诱导TFAM高表达,增强ESCC细胞线粒体氧化磷酸化功能,促进ESCC恶性进展。有效清除Pg并抑制其对TFAM的诱导作用,对改善ESCC患者预后至关重要。 展开更多
关键词 食管鳞癌 牙龈卟啉单胞菌 线粒体转录因子A 增殖 侵袭 预后
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牙龈卟啉单胞菌感染在肺癌中的临床意义及预后价值 被引量:3
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作者 刘怡文 原翔 +2 位作者 孙蔚 孔金玉 高社干 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期260-267,共8页
目的:分析牙龈卟啉单胞菌(Pg)感染与肺癌患者临床病理特征及5年生存期的相关性,并探讨其临床意义及预后价值.方法:选择肺癌患者手术切除的癌组织及相应癌旁肺组织石蜡包埋标本为研究对象,其中小细胞肺癌83例,肺腺癌103例,肺鳞癌84例.采... 目的:分析牙龈卟啉单胞菌(Pg)感染与肺癌患者临床病理特征及5年生存期的相关性,并探讨其临床意义及预后价值.方法:选择肺癌患者手术切除的癌组织及相应癌旁肺组织石蜡包埋标本为研究对象,其中小细胞肺癌83例,肺腺癌103例,肺鳞癌84例.采用免疫组织化学方法检测其Pg感染情况,并分析Pg感染与肺癌患者临床病理特征的相关性;采用Kaplan-Meier生存分析法绘制生存曲线并利用Log-rank检验方法分析Pg感染与生存时间之间相关性.结果:小细胞肺癌组织(31.33%)及肺鳞癌组织(36.90%)中Pg感染阳性率高于肺腺癌组织(28.16%),且三者免疫组化评分均显著高于相应癌旁肺组织(P<0.05);肺癌(小细胞肺癌、肺腺癌及肺鳞癌)患者中Pg感染与吸烟、饮酒、淋巴结转移和临床分期有关(P<0.05),同时Pg感染阳性组5年生存率及中位生存时间均明显低于阴性组(P<0.05),且三种病理类型中,肺鳞癌患者Pg感染阴性组与阳性组中位生存时间之差显著高于肺腺癌与小细胞肺癌患者.结论:长期吸烟、饮酒会导致恶劣的口腔环境,Pg更容易在这种环境下感染并定植,从而促进肺癌的恶性进展,有效清除Pg可能延长肺癌(特别是肺鳞癌)患者的生存期,为肺癌治疗提供了新的思路和有效治疗手段. 展开更多
关键词 肺癌 牙龈卟啉单胞菌 预后
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食管鳞癌淋巴结转移关键基因鉴定及预后分析 被引量:1
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作者 李孟祥 程维刚 +3 位作者 陈攀 冯笑山 高社干 齐义军 《湖南师范大学自然科学学报》 CAS 北大核心 2021年第6期92-100,共9页
目的:应用食管鳞癌淋巴结转移的关键mRNA分子构建最佳淋巴结转移预测模型。方法:获取GSE53624和GSE53622中食管鳞癌转录组数据,XGBoost算法gain值确定食管鳞癌淋巴结转移关键mRNA分子,构建基于XGBoost,LR及SVM的淋巴结转移预测模型并评... 目的:应用食管鳞癌淋巴结转移的关键mRNA分子构建最佳淋巴结转移预测模型。方法:获取GSE53624和GSE53622中食管鳞癌转录组数据,XGBoost算法gain值确定食管鳞癌淋巴结转移关键mRNA分子,构建基于XGBoost,LR及SVM的淋巴结转移预测模型并评价其效能(AUC和K-S法),生存分析和GO富集分析关键mRNA分子的预后意义及生物学功能。结果:159个食管鳞癌差异表达mRNA分子中关键mRNA分子有18个;3种淋巴结转移预测模型中,XGB-18 mRNA模型的AUC和K-S值最优,并且其预测值是食管鳞癌预后的独立危险因素;18个mRNA分子中的4个低表达分子富集于上皮细胞角质化过程,在淋巴结转移阳性食管鳞癌中表达进一步降低。结论:XGB-18 mRNA模型诊断食管鳞癌淋巴结转移的效能最优,并且是食管鳞癌独立预后危险因素之一。 展开更多
关键词 食管鳞癌 淋巴结转移 mRNA转录组 机器学习 XGBoost
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共表达网络鉴定食管鳞癌与腺癌关键差异表达分子 被引量:1
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作者 李孟祥 刘轲 +3 位作者 阮豪杰 高社干 齐义军 冯笑山 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期138-145,共8页
目的:探究食管鳞癌与食管腺癌关键差异表达分子,为临床个体化治疗和靶向治疗提供依据.方法:应用食管鳞癌和食管腺癌的mRNA转录组数据确定其差异表达基因;根据无标度网络理论及差异表达基因构建加权基因共表达网络;通过相关性分析确定与... 目的:探究食管鳞癌与食管腺癌关键差异表达分子,为临床个体化治疗和靶向治疗提供依据.方法:应用食管鳞癌和食管腺癌的mRNA转录组数据确定其差异表达基因;根据无标度网络理论及差异表达基因构建加权基因共表达网络;通过相关性分析确定与食管腺、鳞癌分组特征相关性最强的网络模块及模块内节点基因.结果:通过共表达网络构建出19个基因模块,其中Blue和Turquoise模块与食管腺癌、鳞癌相关性最强,相关系数分别为-0.95和0.89;EPS8L3和SOX15分别为Blue和Turquoise模块的代表性节点基因;在TCGA食管癌数据集、GSE26886数据集、癌细胞数据库中,EPS8L3和SOX15基因是食管腺癌和食管鳞癌的关键差异基因,能够鉴别诊断食管鳞癌和食管腺癌.结论:EPS8L3和SOX15可作为食管腺癌和鳞癌关键差异表达分子,为食管癌精准治疗提供理论基础. 展开更多
关键词 基因共表达网络 食管鳞癌 食管腺癌 数据挖掘
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