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共表达网络鉴定食管鳞癌与腺癌关键差异表达分子
被引量：
1
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作者
李孟祥
刘轲
+3 位作者
阮豪杰
高社干
齐义军
冯笑山
《暨南大学学报（自然科学与医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期138-145,共8页
目的:探究食管鳞癌与食管腺癌关键差异表达分子,为临床个体化治疗和靶向治疗提供依据.方法:应用食管鳞癌和食管腺癌的mRNA转录组数据确定其差异表达基因;根据无标度网络理论及差异表达基因构建加权基因共表达网络;通过相关性分析确定与...
目的:探究食管鳞癌与食管腺癌关键差异表达分子,为临床个体化治疗和靶向治疗提供依据.方法:应用食管鳞癌和食管腺癌的mRNA转录组数据确定其差异表达基因;根据无标度网络理论及差异表达基因构建加权基因共表达网络;通过相关性分析确定与食管腺、鳞癌分组特征相关性最强的网络模块及模块内节点基因.结果:通过共表达网络构建出19个基因模块,其中Blue和Turquoise模块与食管腺癌、鳞癌相关性最强,相关系数分别为-0.95和0.89;EPS8L3和SOX15分别为Blue和Turquoise模块的代表性节点基因;在TCGA食管癌数据集、GSE26886数据集、癌细胞数据库中,EPS8L3和SOX15基因是食管腺癌和食管鳞癌的关键差异基因,能够鉴别诊断食管鳞癌和食管腺癌.结论:EPS8L3和SOX15可作为食管腺癌和鳞癌关键差异表达分子,为食管癌精准治疗提供理论基础.
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关键词
基因共表达网络
食管鳞癌
食管腺癌
数据挖掘
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题名
共表达网络鉴定食管鳞癌与腺癌关键差异表达分子
被引量：
1
1
作者
李孟祥
刘轲
阮豪杰
高社干
齐义军
冯笑山
机构
河南科技大学
信息工程
学院
河南科技大学临床医学院/第一附属医院/河南省肿瘤表观遗传重点实验室
出处
《暨南大学学报（自然科学与医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期138-145,共8页
基金
国家自然科学基金(U1604191)。
文摘
目的:探究食管鳞癌与食管腺癌关键差异表达分子,为临床个体化治疗和靶向治疗提供依据.方法:应用食管鳞癌和食管腺癌的mRNA转录组数据确定其差异表达基因;根据无标度网络理论及差异表达基因构建加权基因共表达网络;通过相关性分析确定与食管腺、鳞癌分组特征相关性最强的网络模块及模块内节点基因.结果:通过共表达网络构建出19个基因模块,其中Blue和Turquoise模块与食管腺癌、鳞癌相关性最强,相关系数分别为-0.95和0.89;EPS8L3和SOX15分别为Blue和Turquoise模块的代表性节点基因;在TCGA食管癌数据集、GSE26886数据集、癌细胞数据库中,EPS8L3和SOX15基因是食管腺癌和食管鳞癌的关键差异基因,能够鉴别诊断食管鳞癌和食管腺癌.结论:EPS8L3和SOX15可作为食管腺癌和鳞癌关键差异表达分子,为食管癌精准治疗提供理论基础.
关键词
基因共表达网络
食管鳞癌
食管腺癌
数据挖掘
Keywords
weighted gene co-expression network analysis
esophageal squamous cell carcinoma
esophageal adenocarcinoma
data mining
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
共表达网络鉴定食管鳞癌与腺癌关键差异表达分子
李孟祥
刘轲
阮豪杰
高社干
齐义军
冯笑山
《暨南大学学报（自然科学与医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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