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豹蛙抗瘤酶与维生素C协同促进大鼠肝癌RH-35细胞凋亡 被引量:3
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作者 王泽 郗玲玲 +2 位作者 齐剑英 梁新月 杨刚刚 《河南科技大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2020年第2期89-93,98,M0008,共7页
为了研究豹蛙抗瘤酶(ONC)与维生素C(VC)对肿瘤细胞的协同促凋亡作用,对大鼠肝癌RH-35细胞进行单药组和联合用药组处理。采用磺酰罗丹明B法测定细胞增殖抑制率,Hoechst染色检测细胞核变化。采用联合指数和等效线图解法评价联合用药效果,... 为了研究豹蛙抗瘤酶(ONC)与维生素C(VC)对肿瘤细胞的协同促凋亡作用,对大鼠肝癌RH-35细胞进行单药组和联合用药组处理。采用磺酰罗丹明B法测定细胞增殖抑制率,Hoechst染色检测细胞核变化。采用联合指数和等效线图解法评价联合用药效果,流式细胞法检测细胞的凋亡情况。试验结果表明:ONC单药组和VC单药组对RH-35细胞增殖的抑制作用均显著(P<0.01),联合用药组的促凋亡作用优于单药组(P<0.001)。VC协同ONC促进了RH-35细胞凋亡。 展开更多
关键词 豹蛙抗瘤酶 维生素C RH-35 协同促进 细胞凋亡
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基于IPA分析自噬对大鼠肝再生中树突状细胞的调节作用 被引量:4
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作者 王棋文 靳伟 +1 位作者 常翠芳 徐存拴 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期276-282,共7页
为探讨自噬对大鼠肝再生中树突状细胞(Dendritic cells,DCs)的调节作用,文章通过Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选分离大鼠DCs,Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠肝再生中自噬相关基因表达变化,利用IPA等软件分析自噬在DCs中的生理活... 为探讨自噬对大鼠肝再生中树突状细胞(Dendritic cells,DCs)的调节作用,文章通过Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选分离大鼠DCs,Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠肝再生中自噬相关基因表达变化,利用IPA等软件分析自噬在DCs中的生理活动。结果表明,LC3、BECN1、ATG7和SQSTM1等关键基因在部分肝切除后不同恢复时间段有明显表达变化;芯片中对应的自噬相关基因为593个,其中210个基因发生了有意义的变化。比较分析自噬生理活动情况,发现自噬在再生早期和晚期阶段增强,增殖期减弱。与自噬相关的生理活动主要有RNA表达、RNA转录细胞分化和增殖,其中涉及的信号通路主要有PPARα/RXRα激活、急性期反应、TREM1信号通路、IL-6信号通路、IL-8信号通路和IL-1信号通路等,它们在肝再生阶段发生了不同程度的上调或下调。Cluster分析还发现,P53和AMPK信号参与调控DCs的自噬活动,在肝再生早期主要是AMPK信号,在肝再生末期P53和AMPK信号共同参与自噬的调节。以上研究结果说明DCs自噬可能在肝再生早期激活细胞免疫反应和后期清除DCs等方面发挥着重要作用。 展开更多
关键词 肝再生 自噬 树突状细胞 Rat Genome 230 2.0芯片 IPA
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骨桥蛋白对细胞生存的多重作用 被引量:2
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作者 王改平 赵聪聪 徐存拴 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期886-891,共6页
骨桥蛋白(osteopontin,OPN)作为一种分泌性蛋白质广泛存在于多种组织细胞中,不仅调控肿瘤细胞的转移、侵袭和增殖,也在炎症反应、血管再生等生理过程中发挥作用。OPN通过与受体结合直接或间接地激活细胞内信号途径,介导细胞与细胞、细... 骨桥蛋白(osteopontin,OPN)作为一种分泌性蛋白质广泛存在于多种组织细胞中,不仅调控肿瘤细胞的转移、侵袭和增殖,也在炎症反应、血管再生等生理过程中发挥作用。OPN通过与受体结合直接或间接地激活细胞内信号途径,介导细胞与细胞、细胞与细胞外基质之间的相互作用,从而参与调控细胞的生存。大量实验证实,OPN能够促进细胞的增殖,抑制细胞凋亡,尤其是对于肿瘤细胞。但在有些细胞中,OPN对细胞命运的影响却恰恰相反。本文综述了OPN在不同条件下对细胞存活、活化和增殖,细胞自噬和细胞凋亡的多重作用及其作用途径,为进一步研究OPN对不同细胞作用的受体及其信号网络机制提供重要理论基础。 展开更多
关键词 骨桥蛋白 细胞存活 细胞活化 细胞增殖 细胞自噬 细胞凋亡
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大鼠再生肝8种细胞的一碳代谢相关基因转录谱研究
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作者 张春艳 于亚男 +2 位作者 宗慧 李静雯 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期181-184,共4页
为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的一碳代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的一碳代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,肝星形细胞的甲硫氨酸转化为S-腺苷甲硫氨酸活动... 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的一碳代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的一碳代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,肝星形细胞的甲硫氨酸转化为S-腺苷甲硫氨酸活动在肝再生启动阶段增强.胆管上皮细胞的S-腺苷甲硫氨酸转化为S-腺苷高半胱氨酸、N5-甲基四氢叶酸将甲基转移给甲硫氨酸活动在进展阶段增强.肝细胞、陷窝细胞、树突状细胞的聚谷氨酸水解、四氢叶酸与N5-甲酰基四氢叶酸相互转化在肝再生3个阶段增强.结论:大鼠肝再生与一碳代谢相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RAT GENOME 230 2.0芯片 基因转录谱 一碳代谢
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大鼠再生肝8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱预示的生理活动 被引量:4
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作者 杨莹 张丽君 +1 位作者 刘焕之 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期176-180,共5页
为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱及其预示的生理活动,用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞和树突状细胞等... 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱及其预示的生理活动,用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞和树突状细胞等8种细胞,用Rat Genome2302.0芯片等检测生物氧化相关基因在上述细胞中表达变化,用H-Cluster等软件及生物信息学和系统学生物等方法分析它们的表达模式及预示的生理活动.结果表明:38个生物氧化相关基因在大鼠肝再生中发生了有意义表达变化,相应细胞的基因数为6,32,0,2,3,1,3,2个.肝再生启动阶段和进展阶段的NAD+合成增强,从NADH到O2的电子传递及ATP合成增强.终止阶段的FADH2分解减弱,从FADH2到O2的电子传递减弱.结论:大鼠肝再生与生物氧化密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 Rat Genome 230 2.0芯片 基因转录谱 生物氧化
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人脐带间充质干细胞的分离、培养及其肝细胞生物学特性分析 被引量:5
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作者 李丽丽 王巧燕 +2 位作者 代克强 丁一 樊晋宇 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2015年第2期187-191,共5页
目的:分离、培养人脐带基质来源的间充质干细胞(h UC-MSCs),观察其部分肝细胞生物学特性。方法:利用组织块贴壁培养法从脐带基质中分离培养h UC-MSCs,观察细胞形态,采用细胞免疫荧光法检测表面标记物CD44,通过RT-PCR法检测肝细胞标志基... 目的:分离、培养人脐带基质来源的间充质干细胞(h UC-MSCs),观察其部分肝细胞生物学特性。方法:利用组织块贴壁培养法从脐带基质中分离培养h UC-MSCs,观察细胞形态,采用细胞免疫荧光法检测表面标记物CD44,通过RT-PCR法检测肝细胞标志基因ALB、CK18、G6P、GLUL、MET、TAT的表达情况,并进行PAS糖原染色。结果:从脐带基质分离出成纤维样细胞形态的h UC-MSCs,CD44表达阳性;RT-PCR结果表明培养的h UC-MSCs表达成熟肝细胞的标志基因ALB、CK18、G6P、GLUL和MET,而不表达TAT,PAS糖原染色呈阳性反应。结论:组织块贴壁培养法可有效获得稳定、均质性良好的h UC-MSCs,其具备部分肝细胞生物学特性。 展开更多
关键词 脐带 间充质干细胞 肝细胞生物学特性
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大鼠再生肝8种细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱预示的生理活动 被引量:1
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作者 王撒 房连聪 +1 位作者 袁美玲 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期185-188,共4页
为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的嘧啶核苷酸代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,50个嘧啶核苷酸代谢相关基因在大鼠... 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的嘧啶核苷酸代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,50个嘧啶核苷酸代谢相关基因在大鼠肝再生中发生了有意义表达变化,8种细胞的相应基因数为25、33、16、24、15、15、21和18.肝细胞、胆管上皮细胞、窦内皮细胞的通过嘧啶核苷酸前体合成嘧啶核苷酸活动增强,除树突状细胞外其他7种细胞的嘧啶核苷酸分解代谢减弱.结论:大鼠肝再生与嘧啶核苷酸代谢密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 肝脏细胞 RAT Genome2302.0芯片 基因转录谱 嘧啶核苷酸代谢
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新基因BM390716、BI274487和AA963863与大鼠再生肝8种细胞的细胞外基质代谢
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作者 王泽 文园园 +3 位作者 程振朝 郭学强 张新胜 徐存拴 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期378-388,共11页
为了解新基因BM390716、BI274487、AA963863在细胞外基质代谢中的作用及其与大鼠肝再生的相关性,文章用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选分离大鼠再生肝的8种细胞,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们的基因表达变化,用Microsoft Exce... 为了解新基因BM390716、BI274487、AA963863在细胞外基质代谢中的作用及其与大鼠肝再生的相关性,文章用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选分离大鼠再生肝的8种细胞,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们的基因表达变化,用Microsoft Excel、BLAST等软件分析基因的共表达关系、序列同源性及参与的代谢活动。结果表明,BM390716与pparα同源和共表达,BI274487与timp2同源和共表达,AA963863与csgalnact1同源和共表达。根据上述基因的同源性和共表达推测,新基因BM390716、BI274487和AA963863参与大鼠再生肝8种细胞的细胞外基质代谢。 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RatGenome 230 2.0芯片 基因的同源性和共表达 细胞外基质代谢
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大鼠肝再生中肝细胞基因表达与DNA裸露的相关性研究
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作者 张亚磊 秦丹 +1 位作者 王改平 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2013年第6期172-177,共6页
为了解大鼠肝再生中肝细胞的基因表达与DNA裸露的相关性,分离大鼠肝细胞,提取裸露DNA,用SOLEXA方法对DNA测序,用BWA软件拼装测序片段,用IPA软件分析拼装的基因种类和作用,用Rat Genome230 2.0芯片检测基因的转录情况.研究表明,大鼠肝再... 为了解大鼠肝再生中肝细胞的基因表达与DNA裸露的相关性,分离大鼠肝细胞,提取裸露DNA,用SOLEXA方法对DNA测序,用BWA软件拼装测序片段,用IPA软件分析拼装的基因种类和作用,用Rat Genome230 2.0芯片检测基因的转录情况.研究表明,大鼠肝再生的12h(PH后12h),肝细胞的裸露DNA涉及16 912个基因,1 701个基因发生了有意义裸露量变化.其中,25个基因的裸露量上调,1 676个基因的裸露量下调.与Rat Genome 230 2.0芯片的检测的基因转录比对表明,肝细胞的AKR7A3,BMYC,CDC25B等26个基因的裸露量和表达量均下调,表明大鼠肝再生12h时,这些基因的表达可能受染色体结构调控. 展开更多
关键词 大鼠肝细胞 大鼠肝再生 裸露DNA 基因转录
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FoxA3和Hnf4α对原代大鼠肝细胞体外增殖的促进效应
10
作者 王巧燕 李丽丽 徐存拴 《湖北农业科学》 2015年第7期1648-1651,1654,共5页
为研究Fox A3和Hnf4α组合对原代大鼠肝细胞体外增殖的作用,构建了Fox A3和Hnf4α基因的慢病毒载体,共转染体外培养的原代大鼠肝细胞;倒置荧光显微镜下观察转染细胞是否增殖;反转录PCR(Reverse transcription PCR,RT-PCR)检测外源基因... 为研究Fox A3和Hnf4α组合对原代大鼠肝细胞体外增殖的作用,构建了Fox A3和Hnf4α基因的慢病毒载体,共转染体外培养的原代大鼠肝细胞;倒置荧光显微镜下观察转染细胞是否增殖;反转录PCR(Reverse transcription PCR,RT-PCR)检测外源基因和肝细胞特异基因的表达情况;PAS(Periodic acidschiff)染色和吲哚菁绿(Indocyanine green,ICG)摄取检测转染细胞功能。结果表明,慢病毒转染4 d后表达绿色荧光蛋白的部分肝细胞呈现上皮样形态并增殖成簇,与正常培养的肝细胞相比增殖能力明显增强;PCR分析表明增殖的肝细胞除表达外源Fox A3和Hnf4α外,还表达肝细胞的标志基因Alb、CK18和G6p;功能检测结果表明增殖的肝细胞具有成熟肝细胞糖原合成和吲哚菁绿摄取的能力。以上结果表明,Fox A3和Hnf4α能促使体外培养的原代大鼠肝细胞进行增殖,并维持肝细胞的基本生物学特性。 展开更多
关键词 FOX A3 Hnf4α 大鼠肝细胞 细胞增殖
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非编码DNA序列的功能及其鉴定 被引量:5
11
作者 秦丹 徐存拴 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1253-1264,共12页
非编码DNA序列是指基因组中不编码蛋白质的DNA序列。这些序列可以结合调节因子、转录为功能性RNA、单独或协同地调节生理活动和病理过程。文章围绕基因表达调控作用,总结了近几年非编码DNA序列的研究成果,对其结构、功能和可能的作用机... 非编码DNA序列是指基因组中不编码蛋白质的DNA序列。这些序列可以结合调节因子、转录为功能性RNA、单独或协同地调节生理活动和病理过程。文章围绕基因表达调控作用,总结了近几年非编码DNA序列的研究成果,对其结构、功能和可能的作用机制进行了初步阐述,介绍了目前鉴定非编码DNA序列中功能元件的计算方法和实验技术,并对非编码DNA未来的研究进行了展望。 展开更多
关键词 非编码DNA序列 基因表达调控 功能元件 转录因子结合位点 非编码RNA 表观遗传学
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不同运动方式对哮喘患儿肺功能影响的网状Meta分析 被引量:2
12
作者 邢双涛 冯世杰 +2 位作者 张一凡 王兰 余国营 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2023年第2期149-156,共8页
[目的]通过网状Mate分析法比较呼吸训练、耐力训练、综合训练、其他训练对哮喘患儿肺功能的干预效果.[方法]计算机检索国内外有关运动对哮喘患儿肺功能影响的随机对照试验.采用Revman 5.3和Stata 16软件进行统计学分析.[结果]共纳入34项... [目的]通过网状Mate分析法比较呼吸训练、耐力训练、综合训练、其他训练对哮喘患儿肺功能的干预效果.[方法]计算机检索国内外有关运动对哮喘患儿肺功能影响的随机对照试验.采用Revman 5.3和Stata 16软件进行统计学分析.[结果]共纳入34项RCT,涉及研究总样本量2560人.分析结果显示:在改善哮喘患儿肺功能方面,呼吸训练、耐力训练、综合训练、其他训练均优于对照组.亚组分析结果显示:哮喘患儿短期内(<12周)的肺功能改善更显著.[结论]呼吸训练和耐力训练(<12周)是改善哮喘患儿肺功能的最佳运动方式和干预周期. 展开更多
关键词 运动 支气管哮喘 肺功能 网状Meta分析
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CDR1as与疾病的相关性 被引量:5
13
作者 陈延慧 郭建林 徐存拴 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期984-989,共6页
环状RNA(circular RNA,circRNA)是存在于真核细胞中的一种非线性RNA,具有稳定性、特异性以及进化保守性等特征,通过发挥microRNA的海绵作用,对其靶基因进行调控。与线性RNA相比,环状RNA自身的闭合环状结构使其更具优越性。小脑变性相关... 环状RNA(circular RNA,circRNA)是存在于真核细胞中的一种非线性RNA,具有稳定性、特异性以及进化保守性等特征,通过发挥microRNA的海绵作用,对其靶基因进行调控。与线性RNA相比,环状RNA自身的闭合环状结构使其更具优越性。小脑变性相关蛋白1反义转录物(cerebellar degeneration-related protein 1 antisense,CDR1as)作为一种竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)间接调控miR-7靶标,通过多种途径影响多种疾病的发生和发展。本文就CDR1as的发现、来源及特征、功能以及与不同疾病的相关性作一概述。 展开更多
关键词 小脑变性相关蛋白1反义转录物 微小RNA海绵 疾病 基因表达调控
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基于弹性网络的大鼠肝再生关键基因选择 被引量:2
14
作者 王小玉 陈留院 +3 位作者 刘云卿 杨云 李钧涛 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2013年第5期26-28,共3页
针对大鼠肝再生基因表达谱芯片数据挖掘问题,通过把肝再生过程划分为8个不同时间的子过程,将其转化为二分类问题,进而利用弹性网络对每1个子过程分别进行分类和相关基因选择.此外,以细胞增殖为主线,分析了所选择基因间的通路关系,验证... 针对大鼠肝再生基因表达谱芯片数据挖掘问题,通过把肝再生过程划分为8个不同时间的子过程,将其转化为二分类问题,进而利用弹性网络对每1个子过程分别进行分类和相关基因选择.此外,以细胞增殖为主线,分析了所选择基因间的通路关系,验证了所选基因的生物合理性. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 弹性网络 基因选择
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长非编码RNA THOR在肿瘤中的作用 被引量:2
15
作者 白海静 靳伟 徐存拴 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1327-1332,共6页
长非编码RNA(long non?coding RNA,lncRNA)是一类长度超过200 nt并且缺乏蛋白质编码潜能的RNA分子。最初lncRNA被认为是由RNA聚合酶Ⅱ转录的副产物,且无生物学功能。随着转录组测序技术的发展,大规模的lncRNA被鉴定出来。越来越多的证... 长非编码RNA(long non?coding RNA,lncRNA)是一类长度超过200 nt并且缺乏蛋白质编码潜能的RNA分子。最初lncRNA被认为是由RNA聚合酶Ⅱ转录的副产物,且无生物学功能。随着转录组测序技术的发展,大规模的lncRNA被鉴定出来。越来越多的证据表明,lncRNA参与多种生物学过程,包括基因印记、基因组重排、染色质修饰、细胞周期调控、转录、剪接、mRNA降解和翻译。lncRNA异常表达与人类多种疾病相关,尤其是增生性疾病,包括胃癌、肝癌和直肠癌等。其中,睾丸相关的高度保守的致癌长非编码RNA(testis?associated highly?conserved oncogenic long non?coding RNA,THOR)是一种非常保守的非编码RNA,在睾丸中特异性表达,并广泛存在于人的多种肿瘤组织中,如肝癌、胃癌、鼻咽癌、肾细胞癌、骨肉瘤、视网膜母细胞瘤、黑色素瘤、非小细胞肺癌和舌鳞状细胞癌中,在其发生和发展过程中发挥重要作用。在鼻咽癌、肾细胞癌、骨肉瘤、黑色素瘤、非小细胞肺癌和舌鳞状细胞癌中,THOR主要通过与胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白1(insulin?like growth factor 2 mRNA?binding protein 1,IGF2BP1)相互作用,促进肿瘤细胞的增殖。在肝癌中,THOR分别通过PTEN在胃癌和骨肉瘤中,THOR主要通过提高SOX9的表达增强癌细胞的干性。在视网膜母细胞瘤中,THOR主要通过提高c?myc的表达促进癌细胞增殖。在鼻咽癌中,THOR主要通过提高YAP的表达增强癌细胞的干性。 展开更多
关键词 长非编码RNA 睾丸相关的高度保守的致癌长非编码RNA 肿瘤
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