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茶树RCI2基因家族成员的鉴定及其低温胁迫下表达分析
1
作者
张毕阳
许芳芳
+1 位作者
刘伯选
李文杨
《江苏农业科学》
北大核心
2024年第19期57-64,共8页
茶树具有较高的经济价值,而低温胁迫不仅会影响茶叶的产量和质量,还会导致经济效益下降,因此茶树抗低温育种研究迫在眉睫。稀有冷诱导(RCI2)基因是一类与低温胁迫密切相关的基因,目前有关茶树低温胁迫的研究并不太多,本研究团队首次通...
茶树具有较高的经济价值,而低温胁迫不仅会影响茶叶的产量和质量,还会导致经济效益下降,因此茶树抗低温育种研究迫在眉睫。稀有冷诱导(RCI2)基因是一类与低温胁迫密切相关的基因,目前有关茶树低温胁迫的研究并不太多,本研究团队首次通过生物信息学手段从茶树基因组中鉴定出11个RCI2基因,并对基因的氨基酸序列、保守结构域及启动子顺式作用元件和低温胁迫表达模式等进行分析。通过氨基酸序列比对和基序分析,发现茶树RCI2基因结构高度保守;启动子顺式作用元件分析结果显示,大部分茶树RCI2基因含有如ARE、ABRE等与抗逆相关的启动子顺式作用元件,相关基因可能具有较强的抗应激能力并参与复杂的调控网络。低温胁迫下基因的转录丰度分析结果显示,CsRCI2B、CsRCI2D、CsRCI2I和CsRCI2J都受到低温诱导表达,而qRT-PCR分析结果显示,CsRCI2B、CsRCI2J在低温胁迫下6 h、7 d时的表达量显著升高,CsRCI2I在低温胁迫下7 d时的表达显著受到抑制,表明上述3个基因可能参与低温胁迫响应途径。通过突变位点数量统计发现,CsRCI2B、CsRCI2I和CsRCI2J的变异位点分别有90、96、79个,突变位点远少于大部分基因,表明这些基因结构稳定,可能在进化过程中规避了有害突变并在茶树体内发挥重要作用。研究结果初步证实,茶树CsRCI2B、CsRCI2I和CsRCI2J响应低温胁迫并具有潜在的重要作用,也为后续茶树抗逆育种研究提供参考信息和信息支撑。
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关键词
茶树
RCI2基因
低温胁迫
突变
表达分析
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题名
茶树RCI2基因家族成员的鉴定及其低温胁迫下表达分析
1
作者
张毕阳
许芳芳
刘伯选
李文杨
机构
信阳农林学院林学院
河南省鸡公山国家级自然保护区事务中心
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2024年第19期57-64,共8页
基金
信阳农林学院林学院/信阳市林木遗传育种重点实验室项目。
文摘
茶树具有较高的经济价值,而低温胁迫不仅会影响茶叶的产量和质量,还会导致经济效益下降,因此茶树抗低温育种研究迫在眉睫。稀有冷诱导(RCI2)基因是一类与低温胁迫密切相关的基因,目前有关茶树低温胁迫的研究并不太多,本研究团队首次通过生物信息学手段从茶树基因组中鉴定出11个RCI2基因,并对基因的氨基酸序列、保守结构域及启动子顺式作用元件和低温胁迫表达模式等进行分析。通过氨基酸序列比对和基序分析,发现茶树RCI2基因结构高度保守;启动子顺式作用元件分析结果显示,大部分茶树RCI2基因含有如ARE、ABRE等与抗逆相关的启动子顺式作用元件,相关基因可能具有较强的抗应激能力并参与复杂的调控网络。低温胁迫下基因的转录丰度分析结果显示,CsRCI2B、CsRCI2D、CsRCI2I和CsRCI2J都受到低温诱导表达,而qRT-PCR分析结果显示,CsRCI2B、CsRCI2J在低温胁迫下6 h、7 d时的表达量显著升高,CsRCI2I在低温胁迫下7 d时的表达显著受到抑制,表明上述3个基因可能参与低温胁迫响应途径。通过突变位点数量统计发现,CsRCI2B、CsRCI2I和CsRCI2J的变异位点分别有90、96、79个,突变位点远少于大部分基因,表明这些基因结构稳定,可能在进化过程中规避了有害突变并在茶树体内发挥重要作用。研究结果初步证实,茶树CsRCI2B、CsRCI2I和CsRCI2J响应低温胁迫并具有潜在的重要作用,也为后续茶树抗逆育种研究提供参考信息和信息支撑。
关键词
茶树
RCI2基因
低温胁迫
突变
表达分析
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
S794.4 [农业科学—林木遗传育种]
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题名
作者
出处
发文年
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1
茶树RCI2基因家族成员的鉴定及其低温胁迫下表达分析
张毕阳
许芳芳
刘伯选
李文杨
《江苏农业科学》
北大核心
2024
0
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