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乌拉尔图小麦PBF基因克隆及其序列分析
被引量:
3
1
作者
胡喜贵
吴晓军
+4 位作者
姜小苓
王玉泉
李淦
胡铁柱
茹振钢
《江苏农业科学》
2018年第13期22-26,共5页
醇溶蛋白盒结合因子(prolamin-box binding factor,PBF)是胚乳组织特异的基因表达调控因子,主要调控籽粒蛋白基因表达效率进而影响面粉的加工品质。本研究采用同源克隆方法从2份乌拉尔图小麦(Triticum urartu Tum.)中克隆得到2个PBF基因...
醇溶蛋白盒结合因子(prolamin-box binding factor,PBF)是胚乳组织特异的基因表达调控因子,主要调控籽粒蛋白基因表达效率进而影响面粉的加工品质。本研究采用同源克隆方法从2份乌拉尔图小麦(Triticum urartu Tum.)中克隆得到2个PBF基因(Gen Bank登录号分别为MF547409和MF547410)。与已报道不同来源PBF基因比对分析发现,乌拉尔图小麦PBF存在丰富变异位点,高达45个单核苷酸多态性位点(SNPs)。其推导的PBF蛋白具有典型DOF结构特征,存在22个氨基酸变异位点,尤其第22位A→S和第23位G→A变异形成特有酪氨酸激酶Ⅱ磷酸化位点(CK2-phospho-site)。该结果表明乌拉尓图小麦PBF基因具有较高遗传多样性,也暗示了氨基酸变异位点可能对其PBF蛋白的调控功能产生影响。同时,聚类分析显示乌拉尓图小麦与普通小麦的PBF蛋白聚在1个亚组,进一步证实了二者亲缘关系较近。
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关键词
乌拉尔图小麦
PBF基因
序列分析
单核苷酸多态性位点(SNPs)
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题名
乌拉尔图小麦PBF基因克隆及其序列分析
被引量:
3
1
作者
胡喜贵
吴晓军
姜小苓
王玉泉
李淦
胡铁柱
茹振钢
机构
河南省现代生物育种协同创新中心/河南科技学院小麦研究中心
出处
《江苏农业科学》
2018年第13期22-26,共5页
基金
国家重点研发计划(编号:2017YFD0100705)
河南省科技攻关项目(编号:162102110060)
+1 种基金
河南省新乡市科技重大专项(编号:ZD17005)
河南科技学院引进高层次人才科研启动项目(编号:201010613001)
文摘
醇溶蛋白盒结合因子(prolamin-box binding factor,PBF)是胚乳组织特异的基因表达调控因子,主要调控籽粒蛋白基因表达效率进而影响面粉的加工品质。本研究采用同源克隆方法从2份乌拉尔图小麦(Triticum urartu Tum.)中克隆得到2个PBF基因(Gen Bank登录号分别为MF547409和MF547410)。与已报道不同来源PBF基因比对分析发现,乌拉尔图小麦PBF存在丰富变异位点,高达45个单核苷酸多态性位点(SNPs)。其推导的PBF蛋白具有典型DOF结构特征,存在22个氨基酸变异位点,尤其第22位A→S和第23位G→A变异形成特有酪氨酸激酶Ⅱ磷酸化位点(CK2-phospho-site)。该结果表明乌拉尓图小麦PBF基因具有较高遗传多样性,也暗示了氨基酸变异位点可能对其PBF蛋白的调控功能产生影响。同时,聚类分析显示乌拉尓图小麦与普通小麦的PBF蛋白聚在1个亚组,进一步证实了二者亲缘关系较近。
关键词
乌拉尔图小麦
PBF基因
序列分析
单核苷酸多态性位点(SNPs)
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
乌拉尔图小麦PBF基因克隆及其序列分析
胡喜贵
吴晓军
姜小苓
王玉泉
李淦
胡铁柱
茹振钢
《江苏农业科学》
2018
3
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