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浓香型白酒酒醅中总RNA提取方法评价
被引量：
2
1
作者
胡晓龙
王康丽
+7 位作者
宋丽丽
侯建光
曹振华
吴丽丽
牛广杰
马歌丽
赵书民
赵东
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期74-82,共9页
为探寻我国特有的复杂微生态环境——浓香型酒醅样品总RNA提取方法,本实验建立了一种改良的十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS)-苯酚法,并从提取成本及耗时、RNA质量浓度和纯度、电泳结果、反转录效果及高通量测序分析5个方面...
为探寻我国特有的复杂微生态环境——浓香型酒醅样品总RNA提取方法,本实验建立了一种改良的十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS)-苯酚法,并从提取成本及耗时、RNA质量浓度和纯度、电泳结果、反转录效果及高通量测序分析5个方面,比较其与试剂盒法、Trizol法、十六烷基三甲基溴化铵(hexadecyl trimethyl ammonium bromide,CTAB)法和月桂酸钠法提取酒醅样品总RNA的效果。结果表明,SDS-苯酚法和CTAB法成本较低,试剂盒法成本最高但耗时最短;试剂盒法提取的总RNA质量浓度最高,分别约为SDS-苯酚法、Trizol法、CTAB法和月桂酸钠法的1.84、2.33、19.14倍和3.09倍;SDS-苯酚法和试剂盒法提取样品总RNA的OD260 nm/OD280 nm和OD260 nm/OD230 nm均分别大于1.8和2.0;SDS-苯酚法电泳条带完整性优于其他方法,CTAB法无法检测到电泳条带。SDS-苯酚法、试剂盒法和Trizol法所提取的RNA能有效反转录为cDNA并将其用于高通量测序分析,3种方法所得优势微生物种属(Lactobacillus和Clostridium)及不同发酵节点酒醅之间的微生物群丰度变化情况基本一致,其中SDS-苯酚法获得的微生物群落多样性最高,且能较好地反映不同酒醅间微生物类群的差异;Trizol法和试剂盒法均能偏好性地多获得1个属,但其含量均很低(0.01%)。本研究系统地比较了5种常见的总RNA提取方法在浓香型酒醅RNA提取的应用效果,其中本研究建立的改良SDS-苯酚法具有一定的综合优势,为今后以RNA为基础的酒醅分子生物学研究提供理论依据,同时对其他富含糖、腐殖质及酚类等杂质的环境样品RNA提取具有较好的借鉴意义。
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关键词
浓香型白酒酒醅
宏转录组
总RNA提取
提取方法评价
微生物群落
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职称材料
基于高通量测序技术的中温大曲中微生物群落多样性解析
被引量：
14
2
作者
胡晓龙
王康丽
+3 位作者
牛广杰
乔亚娟
张玉
何培新
《轻工学报》
CAS
2019年第4期21-29,共9页
采用高通量测序技术对河南省某酒企中温大曲曲皮和曲心两个部位的真菌群落和细菌群落的多样性及其组成进行了研究.结果表明:1)中温大曲曲皮样品中真菌群落多样性和丰度均高于曲心样品;子囊菌门是大曲曲皮和曲心样品中的唯一优势菌门;大...
采用高通量测序技术对河南省某酒企中温大曲曲皮和曲心两个部位的真菌群落和细菌群落的多样性及其组成进行了研究.结果表明:1)中温大曲曲皮样品中真菌群落多样性和丰度均高于曲心样品;子囊菌门是大曲曲皮和曲心样品中的唯一优势菌门;大曲样品中共检测到15种真菌,其中扣囊复膜孢酵母、雪黄散囊菌和毕赤酵母sp1为曲皮和曲心样品中的优势真菌,扣囊复膜孢酵母在曲皮和曲心样品中的含量基本一致,而雪黄散囊菌和毕赤酵母sp1在曲皮和曲心样品中的含量差异较大.2)中温大曲曲心样品中细菌群落多样性高于曲皮样品,但其丰度低于曲皮样品;在大曲样品中共检测到28个属,其中肠杆菌属、乳杆菌属、乳球菌属、布氏杆菌属、肠球菌属和欧文氏菌属为大曲样品中的优势细菌属,除布氏杆菌属外,其他优势细菌属在曲皮和曲心样品中的含量差异较大.
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关键词
白酒
中温大曲
微生物群落
高通量测序技术
在线阅读
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职称材料
题名
浓香型白酒酒醅中总RNA提取方法评价
被引量：
2
1
作者
胡晓龙
王康丽
宋丽丽
侯建光
曹振华
吴丽丽
牛广杰
马歌丽
赵书民
赵东
机构
郑州轻工业大学食品与生物工程学院
河南
仰韶酒业
有限公司
博士后研发基地
河南
宋河酒业股份
有限公司
河南省寿酒有限公司
河南省
酒业协会
五粮液集团
有限公司
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期74-82,共9页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(31801535)
河南省重大科技专项(181100211400)
+1 种基金
中国轻工业浓香型白酒固态发酵重点实验室开放基金项目(2017JJ012,2018JJ017)
郑州轻工业学院博士科研启动基金项目(2016BSJJ018)。
文摘
为探寻我国特有的复杂微生态环境——浓香型酒醅样品总RNA提取方法,本实验建立了一种改良的十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS)-苯酚法,并从提取成本及耗时、RNA质量浓度和纯度、电泳结果、反转录效果及高通量测序分析5个方面,比较其与试剂盒法、Trizol法、十六烷基三甲基溴化铵(hexadecyl trimethyl ammonium bromide,CTAB)法和月桂酸钠法提取酒醅样品总RNA的效果。结果表明,SDS-苯酚法和CTAB法成本较低,试剂盒法成本最高但耗时最短;试剂盒法提取的总RNA质量浓度最高,分别约为SDS-苯酚法、Trizol法、CTAB法和月桂酸钠法的1.84、2.33、19.14倍和3.09倍;SDS-苯酚法和试剂盒法提取样品总RNA的OD260 nm/OD280 nm和OD260 nm/OD230 nm均分别大于1.8和2.0;SDS-苯酚法电泳条带完整性优于其他方法,CTAB法无法检测到电泳条带。SDS-苯酚法、试剂盒法和Trizol法所提取的RNA能有效反转录为cDNA并将其用于高通量测序分析,3种方法所得优势微生物种属(Lactobacillus和Clostridium)及不同发酵节点酒醅之间的微生物群丰度变化情况基本一致,其中SDS-苯酚法获得的微生物群落多样性最高,且能较好地反映不同酒醅间微生物类群的差异;Trizol法和试剂盒法均能偏好性地多获得1个属,但其含量均很低(0.01%)。本研究系统地比较了5种常见的总RNA提取方法在浓香型酒醅RNA提取的应用效果,其中本研究建立的改良SDS-苯酚法具有一定的综合优势,为今后以RNA为基础的酒醅分子生物学研究提供理论依据,同时对其他富含糖、腐殖质及酚类等杂质的环境样品RNA提取具有较好的借鉴意义。
关键词
浓香型白酒酒醅
宏转录组
总RNA提取
提取方法评价
微生物群落
Keywords
fermented grains of Chinese strong-flavor Baijiu
metatranscriptome
total RNA extraction
evaluation of extraction methods
microbial community
分类号
TS261 [轻工技术与工程—发酵工程]
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职称材料
题名
基于高通量测序技术的中温大曲中微生物群落多样性解析
被引量：
14
2
作者
胡晓龙
王康丽
牛广杰
乔亚娟
张玉
何培新
机构
郑州轻工业大学
河南省
寿酒
集团
有限公司
出处
《轻工学报》
CAS
2019年第4期21-29,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31801535)
河南省重大科技专项项目(181100211400)
+2 种基金
中国轻工业浓型白酒固态发酵重点实验室开放基金项目(2018JJ017)
郑州轻工业学院博士科研启动基金项目(2016BSJJ018)
河南省自然科学基金项目(182300410070)
文摘
采用高通量测序技术对河南省某酒企中温大曲曲皮和曲心两个部位的真菌群落和细菌群落的多样性及其组成进行了研究.结果表明:1)中温大曲曲皮样品中真菌群落多样性和丰度均高于曲心样品;子囊菌门是大曲曲皮和曲心样品中的唯一优势菌门;大曲样品中共检测到15种真菌,其中扣囊复膜孢酵母、雪黄散囊菌和毕赤酵母sp1为曲皮和曲心样品中的优势真菌,扣囊复膜孢酵母在曲皮和曲心样品中的含量基本一致,而雪黄散囊菌和毕赤酵母sp1在曲皮和曲心样品中的含量差异较大.2)中温大曲曲心样品中细菌群落多样性高于曲皮样品,但其丰度低于曲皮样品;在大曲样品中共检测到28个属,其中肠杆菌属、乳杆菌属、乳球菌属、布氏杆菌属、肠球菌属和欧文氏菌属为大曲样品中的优势细菌属,除布氏杆菌属外,其他优势细菌属在曲皮和曲心样品中的含量差异较大.
关键词
白酒
中温大曲
微生物群落
高通量测序技术
Keywords
Chinese liquor
medium temperature Daqu
microbial community
high-throughput sequencing technology
分类号
TS261.1 [轻工技术与工程—发酵工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
浓香型白酒酒醅中总RNA提取方法评价
胡晓龙
王康丽
宋丽丽
侯建光
曹振华
吴丽丽
牛广杰
马歌丽
赵书民
赵东
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于高通量测序技术的中温大曲中微生物群落多样性解析
胡晓龙
王康丽
牛广杰
乔亚娟
张玉
何培新
《轻工学报》
CAS
2019
14
在线阅读
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职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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