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花生CC-NBS-LRR家族基因鉴定及在青枯病和网斑病胁迫下的表达分析
1
作者
汪晓
齐飞艳
+7 位作者
孙子淇
郑峥
徐静
王娟
韩锁义
黄冰艳
董文召
张新友
《中国油料作物学报》
北大核心
2025年第2期344-355,共12页
为明确花生基因组中CC-NBS-LRR(CNL)的家族成员及其功能,对其基因家族成员进行生物信息学分析和表达模式分析,研究花生如何响应病害胁迫。以花生基因组序列为参考,利用Pfam、HMMER、NCBI和Coiled-Coil等软件和在线网站筛选,共鉴定得到85...
为明确花生基因组中CC-NBS-LRR(CNL)的家族成员及其功能,对其基因家族成员进行生物信息学分析和表达模式分析,研究花生如何响应病害胁迫。以花生基因组序列为参考,利用Pfam、HMMER、NCBI和Coiled-Coil等软件和在线网站筛选,共鉴定得到85个AhCNL家族成员,分布在20条染色体中的15条上,以A02和A12染色体上分布最多,并且大多成簇存在于染色体末端;系统进化树分析表明其可分为4个亚族,每个亚族中的基因成员保守性较高;共线性分析表明在物种内有16对基因存在共线性关系,物种间分析表明相比于拟南芥和苜蓿,花生与大豆的CNL具有较高的同源性;启动子上含有大量与激素相关和抗病相关的顺式作用元件;大部分CNL家族基因在病菌入侵前后均不表达,少部分基因受到病菌诱导后表达量有变化。
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关键词
花生
CC-NBS-LRR
青枯病
网斑病
表达分析
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职称材料
题名
花生CC-NBS-LRR家族基因鉴定及在青枯病和网斑病胁迫下的表达分析
1
作者
汪晓
齐飞艳
孙子淇
郑峥
徐静
王娟
韩锁义
黄冰艳
董文召
张新友
机构
沈阳
农业
大学
神农种业
实验室
河南省作物分子育种研究院/国家生物育种产业创新中心/农业农村部黄淮海油料作物重点实验室/河南省油料作物遗传改良重点实验室/河南生物育种中心有限公司
出处
《中国油料作物学报》
北大核心
2025年第2期344-355,共12页
基金
神农种业实验室一流课题(SN01-2022-03)
河南省农业科学院杰出青年科技基金(2024JQ06)
+3 种基金
河南省农科院自主创新项目(2023ZC092)
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助(CARS-13)
河南省花生产业技术体系(S2012-5)
优质抗病花生新品种选育(2024TD01)。
文摘
为明确花生基因组中CC-NBS-LRR(CNL)的家族成员及其功能,对其基因家族成员进行生物信息学分析和表达模式分析,研究花生如何响应病害胁迫。以花生基因组序列为参考,利用Pfam、HMMER、NCBI和Coiled-Coil等软件和在线网站筛选,共鉴定得到85个AhCNL家族成员,分布在20条染色体中的15条上,以A02和A12染色体上分布最多,并且大多成簇存在于染色体末端;系统进化树分析表明其可分为4个亚族,每个亚族中的基因成员保守性较高;共线性分析表明在物种内有16对基因存在共线性关系,物种间分析表明相比于拟南芥和苜蓿,花生与大豆的CNL具有较高的同源性;启动子上含有大量与激素相关和抗病相关的顺式作用元件;大部分CNL家族基因在病菌入侵前后均不表达,少部分基因受到病菌诱导后表达量有变化。
关键词
花生
CC-NBS-LRR
青枯病
网斑病
表达分析
Keywords
peanut
CC-NBS-LRR
bacterial wilt
web blotch
gene expression
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
花生CC-NBS-LRR家族基因鉴定及在青枯病和网斑病胁迫下的表达分析
汪晓
齐飞艳
孙子淇
郑峥
徐静
王娟
韩锁义
黄冰艳
董文召
张新友
《中国油料作物学报》
北大核心
2025
0
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