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基于iTRAQ技术筛选儿童急性早幼粒细胞白血病血清差异蛋白
被引量：
3
1
作者
于润红
张靖宇
+1 位作者
刘玉峰
朱尊民
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1462-1470,共9页
目的:筛选并鉴定儿童急性早幼粒细胞白血病(APL)血清差异表达蛋白,寻找潜在的APL生物标记物。方法:选取APL与健康儿童血清各20例,采用同位素标记的相对和绝对定量(i TRAQ)联合二维液相色谱串联质谱(2DLC-MS/MS)技术筛查差异蛋白,并进行...
目的:筛选并鉴定儿童急性早幼粒细胞白血病(APL)血清差异表达蛋白,寻找潜在的APL生物标记物。方法:选取APL与健康儿童血清各20例,采用同位素标记的相对和绝对定量(i TRAQ)联合二维液相色谱串联质谱(2DLC-MS/MS)技术筛查差异蛋白,并进行生物信息学分析;对差异蛋白S100A8、LRG1及SPARC应用ELISA进一步验证;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析法,评价差异蛋白对儿童APL的诊断效能。结果:APL患儿血清中检测出83种差异表达蛋白,其中33种蛋白表达上调,50种蛋白表达下调;生物信息学分析显示这些差异蛋白涉及的生物功能包括细胞运动、免疫细胞运输、血液系统发育与功能、细胞间信号传导和相互作用、组织发育等;差异蛋白涉及多条信号通路,其中受影响最显著的2条通路为LXR/RXR活化与急性期反应信号通路。ELISA验证结果显示,S100A8与LRG1蛋白浓度高于正常对照组、SPARC蛋白浓度低于正常对照组,与蛋白质组学筛选结果一致。ROC曲线分析显示,S100A8、LRG1及SPARC的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.841、1.000、0.944。结论:血清中筛选出的差异表达蛋白S100A8、LRG1及SPARC是值得进一步研究的儿童APL候选血清标志物。
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关键词
急性早幼粒细胞白血病
蛋白质组学
儿童
血清
同位素标记的相对和绝对定量
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题名
基于iTRAQ技术筛选儿童急性早幼粒细胞白血病血清差异蛋白
被引量：
3
1
作者
于润红
张靖宇
刘玉峰
朱尊民
机构
河南省
人民医院
血液
病
研究所
河南省
干细胞
分化与
调控
重点
实验室
河南省
人民医院
(
郑州大学
人民医院
)
血液
科
郑州大学
第一附属
医院
检验
科
郑州大学
第一附属
医院
儿内
科
出处
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1462-1470,共9页
基金
河南省自然科学基金(162300410265)。
文摘
目的:筛选并鉴定儿童急性早幼粒细胞白血病(APL)血清差异表达蛋白,寻找潜在的APL生物标记物。方法:选取APL与健康儿童血清各20例,采用同位素标记的相对和绝对定量(i TRAQ)联合二维液相色谱串联质谱(2DLC-MS/MS)技术筛查差异蛋白,并进行生物信息学分析;对差异蛋白S100A8、LRG1及SPARC应用ELISA进一步验证;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析法,评价差异蛋白对儿童APL的诊断效能。结果:APL患儿血清中检测出83种差异表达蛋白,其中33种蛋白表达上调,50种蛋白表达下调;生物信息学分析显示这些差异蛋白涉及的生物功能包括细胞运动、免疫细胞运输、血液系统发育与功能、细胞间信号传导和相互作用、组织发育等;差异蛋白涉及多条信号通路,其中受影响最显著的2条通路为LXR/RXR活化与急性期反应信号通路。ELISA验证结果显示,S100A8与LRG1蛋白浓度高于正常对照组、SPARC蛋白浓度低于正常对照组,与蛋白质组学筛选结果一致。ROC曲线分析显示,S100A8、LRG1及SPARC的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.841、1.000、0.944。结论:血清中筛选出的差异表达蛋白S100A8、LRG1及SPARC是值得进一步研究的儿童APL候选血清标志物。
关键词
急性早幼粒细胞白血病
蛋白质组学
儿童
血清
同位素标记的相对和绝对定量
Keywords
acute promyelocytic leukemia
proteomics
children
serum
isobaric tag for relative and absolute quantification(iTRAQ)
分类号
R733.71 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
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1
基于iTRAQ技术筛选儿童急性早幼粒细胞白血病血清差异蛋白
于润红
张靖宇
刘玉峰
朱尊民
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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