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地黄EST-SSR标记的开发及扩增体系的建立
被引量：
6
1
作者
冯法节
李明杰
+5 位作者
古力
张宝
何华勤
杨艳会
陈新建
张重义
《广东农业科学》
CAS
2015年第10期120-126,共7页
在转录组基础上批量开发地黄特异EST-SSR标记序列,同时通过优化DNA模板浓度、引物浓度、dNTP浓度、Taq酶浓度,结合正交优化试验建立地黄EST-SSR的PCR最佳扩增体系,为进一步鉴定和开发地黄多态性SSR提供重要的基础资料。结果表明:在地黄8...
在转录组基础上批量开发地黄特异EST-SSR标记序列,同时通过优化DNA模板浓度、引物浓度、dNTP浓度、Taq酶浓度,结合正交优化试验建立地黄EST-SSR的PCR最佳扩增体系,为进一步鉴定和开发地黄多态性SSR提供重要的基础资料。结果表明:在地黄87665条转录本序列中,共筛选了1812条不小于18bp的SSR序列,其中二核苷酸数量最多,共有721个(70.8%),其次为三核苷酸和六核苷酸,分别有486、578个。而在所有SSR类型中AG/CT(457个)为最多的重复类型,其次为AC/GT(256个)。EST-SSR体系优化结果表明:最佳反应体系为15μL体系中含80ng模板DNA、0.1μmol/L引物、150μmol/Ld NTPs和1.5U TaqDNA聚合酶,在退火温度55℃进行30个循环。
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关键词
地黄
EST-SSR
扩增体系
品种选育
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职称材料
题名
地黄EST-SSR标记的开发及扩增体系的建立
被引量：
6
1
作者
冯法节
李明杰
古力
张宝
何华勤
杨艳会
陈新建
张重义
机构
福建农林
大学
中药材
GAP
研究所
河南工业大学中药材研究所
河南
农业
大学
生命科学学院
出处
《广东农业科学》
CAS
2015年第10期120-126,共7页
基金
国家自然科学基金(81274022
30973875)
高等学校博士学科点专项科研基金(博导类)(20123515110005)
文摘
在转录组基础上批量开发地黄特异EST-SSR标记序列,同时通过优化DNA模板浓度、引物浓度、dNTP浓度、Taq酶浓度,结合正交优化试验建立地黄EST-SSR的PCR最佳扩增体系,为进一步鉴定和开发地黄多态性SSR提供重要的基础资料。结果表明:在地黄87665条转录本序列中,共筛选了1812条不小于18bp的SSR序列,其中二核苷酸数量最多,共有721个(70.8%),其次为三核苷酸和六核苷酸,分别有486、578个。而在所有SSR类型中AG/CT(457个)为最多的重复类型,其次为AC/GT(256个)。EST-SSR体系优化结果表明:最佳反应体系为15μL体系中含80ng模板DNA、0.1μmol/L引物、150μmol/Ld NTPs和1.5U TaqDNA聚合酶,在退火温度55℃进行30个循环。
关键词
地黄
EST-SSR
扩增体系
品种选育
Keywords
Rehmannia glutinosa Libosch
EST-SSR
amplification system
cultivar breeding
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
地黄EST-SSR标记的开发及扩增体系的建立
冯法节
李明杰
古力
张宝
何华勤
杨艳会
陈新建
张重义
《广东农业科学》
CAS
2015
6
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参考文献
引证文献
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