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食管癌中miRNA枢纽靶基因的鉴定和验证
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作者 赵婷婷 宋爽 +3 位作者 石科 李晓英 李攀阳 李宁宁 《中国临床解剖学杂志》 北大核心 2025年第1期54-62,共9页
目的探讨与食管癌发生发展相关的miRNAs-mRNAs,研究PALB2对人食管癌EC109细胞生物学性状的影响。方法从GEO和TCGA数据库下载食管癌miRNAs数据集筛选交集,通过starbase数据库预测交集miRNAs的潜在靶基因,并使用PPI网络分析确定枢纽靶基因... 目的探讨与食管癌发生发展相关的miRNAs-mRNAs,研究PALB2对人食管癌EC109细胞生物学性状的影响。方法从GEO和TCGA数据库下载食管癌miRNAs数据集筛选交集,通过starbase数据库预测交集miRNAs的潜在靶基因,并使用PPI网络分析确定枢纽靶基因;对靶基因和枢纽靶基因分别进行GO和KEGG功能富集分析。选择预后差异显著的PALB2基因进行细胞试验,合成PALB2的特异性RNA(si-PALB2)转染EC109细胞,RT-qPCR检测细胞中PALB2的表达量,MTT、Transwell和流式分析PALB2对细胞活力、侵袭迁移和凋亡能力的影响;Western blot检测细胞周期蛋白CyclinD1、凋亡抑制蛋白Bcl-2和基质金属蛋白酶MMP-9的表达变化。结果生物信息学分析预测了参与食管癌发生发展的重要miRNAs-mRNAs,并通过实验验证敲降PALB2的表达后,EC109细胞活力、侵袭转移能力均明显降低,凋亡能力明显增加,cyclinD1、Bcl-2及MMP-9表达均明显下调。结论MiRNAs-mRNAs是预测食管癌发生发展的生物标志物;PALB2在食管癌中发挥促癌作用,与调控细胞周期蛋白、抗凋亡蛋白及侵袭转移相关蛋白密切相关,是诊断和治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 生物信息学分析 MIRNA 食管癌 PALB2
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黄芪注射液对人羊膜上皮细胞向神经细胞分化作用及存活的影响 被引量:3
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作者 陈旭东 华新宇 王晓兰 《神经解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期368-374,共7页
目的:探讨黄芪注射液体外定向诱导人羊膜上皮细胞分化的作用和黄芪注射液对分化细胞活力影响。方法:将人羊膜上皮细胞分为三组,即黄芪诱导组(设立四个浓度亚组)、全反式维甲酸组和对照组。分别采用化学诱导剂和黄芪注射液诱导hAECs分化... 目的:探讨黄芪注射液体外定向诱导人羊膜上皮细胞分化的作用和黄芪注射液对分化细胞活力影响。方法:将人羊膜上皮细胞分为三组,即黄芪诱导组(设立四个浓度亚组)、全反式维甲酸组和对照组。分别采用化学诱导剂和黄芪注射液诱导hAECs分化为神经细胞,在诱导前后,应用免疫细胞化学方法染色鉴定神经元特异性烯醇化酶、神经干细胞巢蛋白、胶质纤维酸性蛋白.逆转录-聚合酶链反应进一步鉴定细胞多能基因Oct4、神经干细胞标记物Nestin基因和神经元标记物NSE,四甲基偶氮唑盐比色法观察细胞活力。结果:倒置显微镜下见,RA诱导12 h后,黄芪诱导24 h后,由胞体伸出较长的轴突样和树突样突起,且有分支,48 h时100μl/ml黄芪诱导组,NSE阳性率低于RA诱导组(P<0.05),细胞活力较RA组高(P<0.05),两诱导组结果均高于对照组,而GFAP阳性率高于RA组(P<0.05),同时RT-PCR检测到诱导后多能基因Oct4表达减少,而Nestin、NSE表达增多。结论:黄芪和RA都可诱导人羊膜上皮细胞在体外分化为神经元样细胞,且黄芪于100μl/ml浓度时效果较好,黄芪诱导后对细胞毒性较小。 展开更多
关键词 人羊膜上皮细胞 RA 黄芪 诱导分化
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