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基于改进YOLO v5-pose的群养生猪体尺自动测量方法
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作者 刘刚 曾雪婷 +3 位作者 刘晓文 李涛 丁向东 米阳 《农业机械学报》 北大核心 2025年第5期455-465,共11页
针对群养生猪体尺自动测量中体尺测点难以高效和精确提取的问题,提出一种基于改进YOLO v5-pose的群养生猪体尺自动测量方法。在YOLO v5-pose主干网络中融合卷积块注意力模块(Convolutional block attention module,CBAM),更好地捕捉到... 针对群养生猪体尺自动测量中体尺测点难以高效和精确提取的问题,提出一种基于改进YOLO v5-pose的群养生猪体尺自动测量方法。在YOLO v5-pose主干网络中融合卷积块注意力模块(Convolutional block attention module,CBAM),更好地捕捉到测点相关特征;将Neck层的C3传统模块替换为C3Ghost轻量模块,降低模型参数量和内存占用量;在模型Head层引入DyHead(Dynamic head)目标检测头,提升模型对测点位置的表征能力。结果表明,改进模型的测点检测平均精度均值为92.6%,参数量为6.890×10^(6),内存占用量为14.1 MB,与原始YOLO v5-pose模型相比,平均精度均值增加2.1个百分点,参数量和内存占用量分别减少2.380×10^(5)、0.4 MB。与当前经典模型YOLO v7-pose、YOLO v8-pose、RTMPose(Real-time multi-person pose estimation based on mmpose)和CenterNet相比,该模型的召回率和平均精度均值更优且更轻量化。在2400幅群养生猪图像数据集上进行试验,结果表明,该方法测得体长、体宽、臀宽、体高和臀高的平均绝对误差分别为4.61、5.87、6.03、0.49、0.46 cm,平均相对误差分别为2.69%、11.53%、12.29%、0.90%和0.76%。综上所述,本文方法提高了体尺测点检测精度,降低了模型复杂度,取得了更精确的体尺测量结果,为群养环境下生猪体尺自动测量提供了一种有效的技术手段。 展开更多
关键词 群养生猪 体尺测量 改进YOLO v5-pose 关键点检测 坐标变换
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一株新型鹅星状病毒HNxy2111株全基因组测序分析 被引量:1
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作者 董建国 麻冰洁 +9 位作者 王瑞 芦一丹 杨海倩 杨大苗 梁自怡 王念念 饶丹 焦凤超 张宁 何书海 《中国家禽》 北大核心 2024年第10期173-178,共6页
为分析信阳地区鹅星状病毒(GAstV)的遗传变异情况,研究从信阳某鹅场痛风病鹅采集病料,进行病原分离鉴定和全基因组扩增测序,获得GAstV基因组,随后进行遗传进化和同源性分析。结果显示:分离一株GAstV,命名为HNxy2111,基因组全长7 175 bp;... 为分析信阳地区鹅星状病毒(GAstV)的遗传变异情况,研究从信阳某鹅场痛风病鹅采集病料,进行病原分离鉴定和全基因组扩增测序,获得GAstV基因组,随后进行遗传进化和同源性分析。结果显示:分离一株GAstV,命名为HNxy2111,基因组全长7 175 bp;HNxy2111基因组及ORF2基因均与参考毒株G519亲缘关系最近,处于同一分支,属于GAstV-Ⅱ型;HNxy2111基因组、ORF1a、ORF1b编码氨基酸序列与GAstV-Ⅱ型中的G519同源性最高,均为99.2%。ORF1b编码的氨基酸序列与GD AHAU2同源性最高,为100%。与G519相比,HNxy2111 ORF1a、ORF1b和ORF2编码的蛋白质分别发生了8处、3处和5处突变。综上所述,HNxy2111属于GAstV-Ⅱ型,与国内经典鹅星状病毒有较近的遗传关系,ORF1a、ORF1b和ORF2编码的蛋白有一定的突变。 展开更多
关键词 鹅星状病毒 基因组 遗传进化分析 同源性 分离鉴定
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鹅星状病毒capsid蛋白对细胞因子的影响
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作者 饶丹 陈明睿 +5 位作者 刘佳音 高赛楠 何书海 张宁 董建国 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第4期193-196,共4页
为了解鹅星状病毒(GAstV)capsid蛋白对细胞因子的影响,试验将构建的pCMV-capsid真核质粒转染293细胞,并于转染后12、24、36h收集细胞,提取核酸检测细胞内CCL2、CCL5、IL-1β、TNF-α、IFITM1和IFITM2的转录水平。结果显示,capsid蛋白于1... 为了解鹅星状病毒(GAstV)capsid蛋白对细胞因子的影响,试验将构建的pCMV-capsid真核质粒转染293细胞,并于转染后12、24、36h收集细胞,提取核酸检测细胞内CCL2、CCL5、IL-1β、TNF-α、IFITM1和IFITM2的转录水平。结果显示,capsid蛋白于12、36h显著抑制CCL2转录,12h显著促进CCL5表达,24h显著抑制CCL5表达;capsid蛋白于24、36h显著促进IL-1β的转录;capsid蛋白于24、36h显著抑制IFN-α的转录;capsid蛋白于36h显著促进TNF-α的转录;capsid蛋白于24h显著抑制IFITM1的转录,于36h显著促进IFITM1和IFITM2的转录。结果表明,GAstVcapsid蛋白过表达能够诱导IL-1β、TNF-α和IFITM的转录,抑制CCL2和IFN-α的转录;对于CCL5,capsid蛋白早期促进CCL5的转录,后期抑制CCL5的转录;对于IFITM1,capsid蛋白早期抑制IFITM1转录,后期促进IFITM1转录。 展开更多
关键词 鹅星状病毒 细胞因子 转录 RdRp蛋白
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鹅星状病毒RdRp蛋白对细胞因子转录水平的影响
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作者 饶丹 尹磊 +4 位作者 吴佩 王媛媛 何书海 张宁 董建国 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第7期164-168,共5页
为了解鹅星状病毒(GAstV)RdRp蛋白对细胞因子转录水平的影响,试验将构建的pCMV-RdRp真核质粒转染293细胞,并于转染后12、24、36 h收集细胞,提取核酸检测细胞内CCL2、CCL5、IL-1β、IFN-α、TNF-α、IFITM1和IFITM2的转录水平。结果发现,... 为了解鹅星状病毒(GAstV)RdRp蛋白对细胞因子转录水平的影响,试验将构建的pCMV-RdRp真核质粒转染293细胞,并于转染后12、24、36 h收集细胞,提取核酸检测细胞内CCL2、CCL5、IL-1β、IFN-α、TNF-α、IFITM1和IFITM2的转录水平。结果发现,GAstV RdRp蛋白于12、24、36 h极显著抑制CCL2转录,12 h极显著促进CCL5表达,24、36 h极显著抑制CCL5表达(P<0.01);GAstV RdRp蛋白于24、36 h极显著促进IL-1β转录(P<0.01);GAstV RdRp蛋白于12 h极显著促进IFN-α的转录,于24、36 h极显著抑制IFN-α转录(P<0.01);GAstV RdRp蛋白于12、24、36 h显著或极显著抑制TNF-α转录(P<0.01);GAstV RdRp蛋白于24 h极显著抑制IFITM1转录(P<0.01),于36 h显著抑制IFITM1转录(P<0.05),于12、36 h极显著促进IFITM2转录(P<0.01),于24 h极显著抑制IFITM2的转录(P<0.01)。表明GAstV RdRp蛋白过表达能够诱导IL-1β的转录,抑制CCL2、TNF-α和IFITM1的转录;GAstV RdRp蛋白早期促进CCL5和IFN-α的转录,后期抑制CCL5和IFN-α的转录;GAstV RdRp蛋白早期和晚期促进IFITM2转录,中期抑制IFITM2转录。 展开更多
关键词 鹅星状病毒 细胞因子 转录 RdRp蛋白
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集约化养殖场“三级圈”常态下非洲猪瘟的防控 被引量:3
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作者 崔孟梅 李俊跃 赵世玉 《养殖与饲料》 2024年第2期60-63,共4页
非洲猪瘟是一种高度接触性传染病,以发热,全身性出血以及高死亡率为特征,给疫区造成重大经济损失,在我国被列为国家一类动物疫病。由于目前还没有有效安全的非洲猪瘟疫苗或治疗方法,因此控制该病仍需要严格的生物安全措施。本文通过调... 非洲猪瘟是一种高度接触性传染病,以发热,全身性出血以及高死亡率为特征,给疫区造成重大经济损失,在我国被列为国家一类动物疫病。由于目前还没有有效安全的非洲猪瘟疫苗或治疗方法,因此控制该病仍需要严格的生物安全措施。本文通过调研浙江青莲食品股份有限公司以及河南丰源和普农牧股份有限公司规模化养殖场在非洲猪瘟进入我国以来的经验做法,总结了目前集约化养殖场按生产实际,根据不同区域划分“防疫圈”,通过科学检测,严格消毒,做好病媒生物防治以及猪群、人员、车辆、物资管理的综合措施,高效防控非洲猪瘟,减少经济损失,以期为集约化养殖场非洲猪瘟的防控提供实践性指导。 展开更多
关键词 “三级圈”防控 消毒 病媒生物防治 非洲猪瘟 集约化养殖场
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猪流行性腹泻病毒变异株XP2018的分离及S基因序列分析 被引量:7
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作者 赵攀登 冀梦瑶 +9 位作者 朱文龙 陈益 卢建洲 杨霞 朱芳 田欣 程云 潘颂佳 张宁 范宝超 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2022年第1期64-70,共7页
本研究旨在从临床仔猪腹泻样品中分离猪流行性腹泻病毒(PEDV),并对其S基因进行测序分析。对腹泻仔猪小肠样品进行RT-PCR检测、病毒的分离培养、RT-PCR和间接免疫荧光鉴定、S基因测序及遗传演化分析。结果显示:仔猪腹泻由流行性腹泻病毒... 本研究旨在从临床仔猪腹泻样品中分离猪流行性腹泻病毒(PEDV),并对其S基因进行测序分析。对腹泻仔猪小肠样品进行RT-PCR检测、病毒的分离培养、RT-PCR和间接免疫荧光鉴定、S基因测序及遗传演化分析。结果显示:仔猪腹泻由流行性腹泻病毒引起;在Vero细胞上成功分离流行性腹泻病毒,命名为XP2018,该毒株细胞病变明显,并且连续传代细胞病变稳定;该毒株S基因全长为4161 bp,与中国经典毒株CV777 S基因核苷酸同源性为92.6%,氨基酸同源性为91.0%;与近年来中国分离的其他毒株S基因核苷酸同源性为96.9%~97.6%,氨基酸同源性为96.9%~98.0%;与美国参考毒株S基因核苷酸同源性为96.9%~97.6%,氨基酸同源性为96.6%~98.3%;遗传进化分析显示XP2018毒株与与目前中国流行毒株在同一分支,与经典毒株CV777不在一个分支上。本研究成功分离1株猪流行性腹泻病毒流行毒株,为PEDV疫苗研发奠定了基础。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 分离 S基因 遗传进化分析
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