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杜仲查尔酮异构酶基因家族全基因组鉴定及其表达模式分析
1
作者
程婷婷
刘俊
+7 位作者
王利丽
练从龙
魏文君
郭辉
吴尧琳
杨晶凡
兰金旭
陈随清
《生物技术通报》
北大核心
2025年第9期242-255,共14页
【目的】查尔酮异构酶(CHI)是类黄酮生物合成途径中的关键限速酶。对杜仲CHI基因家族成员进行全基因组鉴定,系统分析其表达特征,以探究其在杜仲生长发育及逆境响应中的生物学功能。【方法】基于杜仲基因组数据,采用生物信息学方法系统鉴...
【目的】查尔酮异构酶(CHI)是类黄酮生物合成途径中的关键限速酶。对杜仲CHI基因家族成员进行全基因组鉴定,系统分析其表达特征,以探究其在杜仲生长发育及逆境响应中的生物学功能。【方法】基于杜仲基因组数据,采用生物信息学方法系统鉴定CHI基因家族成员,并全面分析其理化性质、染色体定位、启动子顺式作用元件、进化关系、保守基序和基因结构等特征。同时,结合转录组数据和RT-qPCR技术,探究EuCHIs在不同组织及非生物胁迫处理下的表达模式。【结果】在杜仲基因组中共鉴定出7个EuCHI基因家族成员(EuCHI-1-EuCHI-7),其编码蛋白的氨基酸长度为84-388 aa,分子量为9473.24-43248.30Da,等电点范围为4.81-9.42,不稳定指数范围为23.09-46.43,亲疏水性范围为-0.381-0.206,不均匀地分布在5条染色体上。亚细胞定位预测显示,除EuCHI-2定位于细胞核中;其余成员均定位于叶绿体中,此外,EuCHI-1在细胞膜中也有分布,EuCHI-4在细胞质和线粒体中也有分布。系统进化分析将EuCHIs划分为GroupⅠ、GroupⅡ和GroupⅥ3个亚家族,各成员含有1-10个外显子。启动子分析表明,EuCHIs可能参与生长发育和激素响应等生物学过程,转录组数据表明大部分EuCHIs基因参与杜仲叶色形成以及花发育等多种生物学过程。RT-q PCR结果显示,EuCHIs具有组织表达特异性,除EuCHI-3外,其余均在根部高量表达;与ABA和GA3胁迫处理相比,干旱胁迫处理更能显著诱导EuCHI基因的表达。【结论】鉴定出7个EuCHIs基因,分为3个亚家族,EuCHIs在杜仲不同组织和不同胁迫中表达模式存在差异,表明它们在杜仲生长发育和非生物胁迫中发挥重要作用。
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关键词
杜仲
CHI基因家族
全基因组鉴定
生物信息学分析
荧光定量PCR
激素处理
非生物胁迫
表达特征
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职称材料
一套高效制作腊叶标本的装置及其应用
被引量：
1
2
作者
邱田田
田慧宇
+3 位作者
刘汶泽
杨佳婷
严鲸
刘孟奇
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2022年第6期131-135,145,共6页
为解决目前腊叶标本制作过程中普遍存在的制作时间长、标本色差大、烘干装置操作不便等问题,实现高效、高质地制作腊叶标本。在总结当前腊叶标本制作方法基础上,设计了一套制作腊叶标本的装置。这套装置具体包括通风板和可变式加热箱,...
为解决目前腊叶标本制作过程中普遍存在的制作时间长、标本色差大、烘干装置操作不便等问题,实现高效、高质地制作腊叶标本。在总结当前腊叶标本制作方法基础上,设计了一套制作腊叶标本的装置。这套装置具体包括通风板和可变式加热箱,并以通风板代替瓦楞纸板和可变式加热箱配套使用,提高了该装置的通风性能,取得低温快速干燥腊叶标本的效果。使用此套装置可实现在32~33℃这一较低温条件下,8~11 h内烘干200~260份植物标本,从而满足野外条件下“白天采集,一夜干燥”的需求,且能最大限度地保证标本的原色。该套制作腊叶标本的装置为腊叶标本的高效、高质制作提供了可靠的技术保障。
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关键词
腊叶标本
干燥法
通风板
可变式加热箱
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职称材料
题名
杜仲查尔酮异构酶基因家族全基因组鉴定及其表达模式分析
1
作者
程婷婷
刘俊
王利丽
练从龙
魏文君
郭辉
吴尧琳
杨晶凡
兰金旭
陈随清
机构
河南
中医药大学
药学院
河南中医药大学本草书院
豫药全产业链研发
河南
省协同创新中心
出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第9期242-255,共14页
基金
河南省科技研发计划联合基金项目(222301420074)
2024年河南省林业草原专项资金项目(豫财环资[2024]47号)。
文摘
【目的】查尔酮异构酶(CHI)是类黄酮生物合成途径中的关键限速酶。对杜仲CHI基因家族成员进行全基因组鉴定,系统分析其表达特征,以探究其在杜仲生长发育及逆境响应中的生物学功能。【方法】基于杜仲基因组数据,采用生物信息学方法系统鉴定CHI基因家族成员,并全面分析其理化性质、染色体定位、启动子顺式作用元件、进化关系、保守基序和基因结构等特征。同时,结合转录组数据和RT-qPCR技术,探究EuCHIs在不同组织及非生物胁迫处理下的表达模式。【结果】在杜仲基因组中共鉴定出7个EuCHI基因家族成员(EuCHI-1-EuCHI-7),其编码蛋白的氨基酸长度为84-388 aa,分子量为9473.24-43248.30Da,等电点范围为4.81-9.42,不稳定指数范围为23.09-46.43,亲疏水性范围为-0.381-0.206,不均匀地分布在5条染色体上。亚细胞定位预测显示,除EuCHI-2定位于细胞核中;其余成员均定位于叶绿体中,此外,EuCHI-1在细胞膜中也有分布,EuCHI-4在细胞质和线粒体中也有分布。系统进化分析将EuCHIs划分为GroupⅠ、GroupⅡ和GroupⅥ3个亚家族,各成员含有1-10个外显子。启动子分析表明,EuCHIs可能参与生长发育和激素响应等生物学过程,转录组数据表明大部分EuCHIs基因参与杜仲叶色形成以及花发育等多种生物学过程。RT-q PCR结果显示,EuCHIs具有组织表达特异性,除EuCHI-3外,其余均在根部高量表达;与ABA和GA3胁迫处理相比,干旱胁迫处理更能显著诱导EuCHI基因的表达。【结论】鉴定出7个EuCHIs基因,分为3个亚家族,EuCHIs在杜仲不同组织和不同胁迫中表达模式存在差异,表明它们在杜仲生长发育和非生物胁迫中发挥重要作用。
关键词
杜仲
CHI基因家族
全基因组鉴定
生物信息学分析
荧光定量PCR
激素处理
非生物胁迫
表达特征
Keywords
Eucommia ulmoides
CHI gene family
genome-wide identification
bioinformatics analysis
quantitative real-time PCR(RTqPCR)
hormone treatment
abiotic stress
expression characteristics
分类号
S567.1 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
一套高效制作腊叶标本的装置及其应用
被引量：
1
2
作者
邱田田
田慧宇
刘汶泽
杨佳婷
严鲸
刘孟奇
机构
河南中医药大学本草书院
出处
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2022年第6期131-135,145,共6页
基金
2021年河南省高校国家级大学生创新创业训练计划项目(202110471003)
2018年中医药公共卫生服务补助专项(财社[2017]183号)。
文摘
为解决目前腊叶标本制作过程中普遍存在的制作时间长、标本色差大、烘干装置操作不便等问题,实现高效、高质地制作腊叶标本。在总结当前腊叶标本制作方法基础上,设计了一套制作腊叶标本的装置。这套装置具体包括通风板和可变式加热箱,并以通风板代替瓦楞纸板和可变式加热箱配套使用,提高了该装置的通风性能,取得低温快速干燥腊叶标本的效果。使用此套装置可实现在32~33℃这一较低温条件下,8~11 h内烘干200~260份植物标本,从而满足野外条件下“白天采集,一夜干燥”的需求,且能最大限度地保证标本的原色。该套制作腊叶标本的装置为腊叶标本的高效、高质制作提供了可靠的技术保障。
关键词
腊叶标本
干燥法
通风板
可变式加热箱
Keywords
herbarium specimen
drying method
ventilation board
variable heating box
分类号
Q94-34 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杜仲查尔酮异构酶基因家族全基因组鉴定及其表达模式分析
程婷婷
刘俊
王利丽
练从龙
魏文君
郭辉
吴尧琳
杨晶凡
兰金旭
陈随清
《生物技术通报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
一套高效制作腊叶标本的装置及其应用
邱田田
田慧宇
刘汶泽
杨佳婷
严鲸
刘孟奇
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2022
1
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职称材料
已选择
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