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结核分枝杆菌RD12区T细胞表位分布情况预测及分析
被引量：
13
1
作者
叶娟
张舒林
刘文第
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期7-12,共6页
目的预测并分析结核分枝杆菌(MTB)RD12区4个抗原的CD4+T和CD8+T细胞表位分布情况。方法在NCBI数据库上查询并获得各个抗原的氨基酸序列,用Blast分析其与MTB复合群及人类蛋白的同源性。利用SYFPEITHI、NETCTL、BIMAS和NetMHC数据库预测...
目的预测并分析结核分枝杆菌(MTB)RD12区4个抗原的CD4+T和CD8+T细胞表位分布情况。方法在NCBI数据库上查询并获得各个抗原的氨基酸序列,用Blast分析其与MTB复合群及人类蛋白的同源性。利用SYFPEITHI、NETCTL、BIMAS和NetMHC数据库预测并分析MTB的RD12区抗原CD8+T细胞表位的分布情况;利用NetMHC数据库预测并分析MTB的RD12区抗原的CD4+T细胞表位的分布情况。然后,综合CD4与CD8表位预测,筛选出优势表位肽段。结果通过预测与分析,初步筛选出MTB的RD12区4个抗原的CD8+T细胞候选表位16个;CD4+T细胞的强结合候选表位234个,弱结合候选表位505个,综合CD4与CD8表位预测并分析,最终筛选出13个优势表位肽段。结论预测出来的T细胞候选表位将为结核病的特异性诊断及新的抗结核多表位疫苗的研究奠定基础。
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关键词
结核分枝杆菌
RD12区
T细胞
表位分析
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职称材料
复合抗原ESAT-6/CFP-10/Rv0315在活动性肺结核辅助诊断中的价值
被引量：
9
2
作者
陈翠翠
叶娟
+3 位作者
赵俊伟
张舒林
孙战强
汤兵祥
《郑州大学学报（医学版）》
CAS
北大核心
2014年第2期211-214,共4页
目的:评价结核分枝杆菌复合抗原ESAT-6/CFP-10/Rv0315在活动性肺结核诊断中的应用价值。方法:选取初治肺结核病患者70例和健康体检者34例作为结核组和健康对照组,分离PBMCs,分别用复合抗原ESAT-6/CFP-10/Rv0315、ESAT-6肽段库和CFP-10...
目的:评价结核分枝杆菌复合抗原ESAT-6/CFP-10/Rv0315在活动性肺结核诊断中的应用价值。方法:选取初治肺结核病患者70例和健康体检者34例作为结核组和健康对照组,分离PBMCs,分别用复合抗原ESAT-6/CFP-10/Rv0315、ESAT-6肽段库和CFP-10肽段库作为抗原进行ELISPOT实验,检测斑点形成细胞数。结果:复合抗原ESAT-6/CFP-10/Rv0315、ESAT-6肽段库和CFP-10肽段库检测结核分枝杆菌感染的阳性率依次为85.7%(60/70)、77.1%(54/70)、72.9%(51/70),特异性依次为82.4%(28/34)、85.3%(29/34)、88.2%(30/34)。结论:复合抗原ESAT-6/CFP-10/Rv0315作为抗原建立的ELISPOT检测方法在活动性肺结核的辅助诊断中有较高的应用价值。
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关键词
肺结核
结核分枝杆菌
ESAT-6
CFP-10
Rv0315
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职称材料
题名
结核分枝杆菌RD12区T细胞表位分布情况预测及分析
被引量：
13
1
作者
叶娟
张舒林
刘文第
机构
河南中医学院医学免疫学重点实验室
上海交通大
学
基础
医学院
免疫
学
与微生物
学
系
出处
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期7-12,共6页
基金
"十二五"国家科技重大专项(2013ZX10003002-005)
国家自然基金项目(81271794)
上海市科委技术支撑项目(12441903300)~~
文摘
目的预测并分析结核分枝杆菌(MTB)RD12区4个抗原的CD4+T和CD8+T细胞表位分布情况。方法在NCBI数据库上查询并获得各个抗原的氨基酸序列,用Blast分析其与MTB复合群及人类蛋白的同源性。利用SYFPEITHI、NETCTL、BIMAS和NetMHC数据库预测并分析MTB的RD12区抗原CD8+T细胞表位的分布情况;利用NetMHC数据库预测并分析MTB的RD12区抗原的CD4+T细胞表位的分布情况。然后,综合CD4与CD8表位预测,筛选出优势表位肽段。结果通过预测与分析,初步筛选出MTB的RD12区4个抗原的CD8+T细胞候选表位16个;CD4+T细胞的强结合候选表位234个,弱结合候选表位505个,综合CD4与CD8表位预测并分析,最终筛选出13个优势表位肽段。结论预测出来的T细胞候选表位将为结核病的特异性诊断及新的抗结核多表位疫苗的研究奠定基础。
关键词
结核分枝杆菌
RD12区
T细胞
表位分析
Keywords
Mycobacterium tuberculosis
specific RD12 region
T cell
epitope analysis
分类号
R392 [医药卫生—免疫学]
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职称材料
题名
复合抗原ESAT-6/CFP-10/Rv0315在活动性肺结核辅助诊断中的价值
被引量：
9
2
作者
陈翠翠
叶娟
赵俊伟
张舒林
孙战强
汤兵祥
机构
郑州大
学
第一附属医院呼吸内科
河南中医学院医学免疫学重点实验室
上海交通大
学
基础
医学院
病原生物
学
教研室
复旦大
学
生命科
学
学院
河南
省胸科医院呼吸内科
出处
《郑州大学学报（医学版）》
CAS
北大核心
2014年第2期211-214,共4页
基金
"十二.五"国家科技重大专项2013ZX10003002-005
国家自然科学基金81271794
+1 种基金
上海市科委科技支撑项目12441903300
河南省卫生厅科技攻关项目201203163
文摘
目的:评价结核分枝杆菌复合抗原ESAT-6/CFP-10/Rv0315在活动性肺结核诊断中的应用价值。方法:选取初治肺结核病患者70例和健康体检者34例作为结核组和健康对照组,分离PBMCs,分别用复合抗原ESAT-6/CFP-10/Rv0315、ESAT-6肽段库和CFP-10肽段库作为抗原进行ELISPOT实验,检测斑点形成细胞数。结果:复合抗原ESAT-6/CFP-10/Rv0315、ESAT-6肽段库和CFP-10肽段库检测结核分枝杆菌感染的阳性率依次为85.7%(60/70)、77.1%(54/70)、72.9%(51/70),特异性依次为82.4%(28/34)、85.3%(29/34)、88.2%(30/34)。结论:复合抗原ESAT-6/CFP-10/Rv0315作为抗原建立的ELISPOT检测方法在活动性肺结核的辅助诊断中有较高的应用价值。
关键词
肺结核
结核分枝杆菌
ESAT-6
CFP-10
Rv0315
Keywords
pulmonary tuberculosis
Mycobacterium. tuberculosis
ESAT-6
CFP-10
Rv0315
分类号
R521 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
结核分枝杆菌RD12区T细胞表位分布情况预测及分析
叶娟
张舒林
刘文第
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014
13
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
复合抗原ESAT-6/CFP-10/Rv0315在活动性肺结核辅助诊断中的价值
陈翠翠
叶娟
赵俊伟
张舒林
孙战强
汤兵祥
《郑州大学学报（医学版）》
CAS
北大核心
2014
9
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职称材料
已选择
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引证文献
统计分析
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