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基于全基因组预测和分析花生果腐病原菌分泌蛋白
1
作者
王辉灵
韩会玲
+4 位作者
王晓晗
焦镇
李步阳
何弯弯
孙伟明
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期11-18,38,共9页
【目的】为分析花生果腐病病原菌-新孢镰刀菌的侵染机制并筛选可用基因。【方法】以全基因组测序结果为基础,根据分泌蛋白与效应因子的特点,采用SignalP、TMHMM、WoLF PSORT及NetGPI等软件一步步筛选,对新孢镰刀菌全基因组12756条蛋白...
【目的】为分析花生果腐病病原菌-新孢镰刀菌的侵染机制并筛选可用基因。【方法】以全基因组测序结果为基础,根据分泌蛋白与效应因子的特点,采用SignalP、TMHMM、WoLF PSORT及NetGPI等软件一步步筛选,对新孢镰刀菌全基因组12756条蛋白序列进行了分泌蛋白预测和功能分析。【结果】新孢镰刀菌全基因组编码蛋白中有701条序列具有典型的分泌蛋白特征,占蛋白总数的5.49%,其长度主要分布在101~700个氨基酸范围内。信号肽的分析结果表明,信号肽-3和-1位置的氨基酸相对保守,其切割位点属于典型的A-X-A型。对分泌蛋白功能预测结果表明,656个分泌蛋白获得了功能注释,其功能主要涉及碳水化合物的运输、代谢过程,蛋白翻译后修饰和氨基酸代谢、运输过程。分泌蛋白中效应蛋白预测结果表明,新孢镰刀菌分泌蛋白中共有161个潜在的效应蛋白。【结论】对新孢镰刀菌分泌蛋白的有效预测和功能分析,为筛选新效应蛋白,明确其致病机理,筛选寄主抗性基因奠定了基础。同时为花生果腐病抗性品种选育和综合防治提供理论依据。
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关键词
花生果腐病
新孢镰刀菌
生物信息学
分泌蛋白
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职称材料
花生果腐病新病症的发现及发生因素分析
被引量：
1
2
作者
何弯弯
胡朋举
+5 位作者
冯丽娜
赵凤颖
邢单润
韩金星
孙伟明
王晓晗
《花生学报》
北大核心
2023年第3期28-34,55,共8页
一种花生果腐病新症状,俗称花生果斑病或花生麻脸病,在我国冀东鲜食花生产区广泛发生,但其优势病原菌及发病因素尚不明确。本研究采集了冀东唐山市和秦皇岛市花生种植区发病样品,分别分离得到优势病原菌FN5和CLGB7-1,均鉴定为新孢镰刀菌...
一种花生果腐病新症状,俗称花生果斑病或花生麻脸病,在我国冀东鲜食花生产区广泛发生,但其优势病原菌及发病因素尚不明确。本研究采集了冀东唐山市和秦皇岛市花生种植区发病样品,分别分离得到优势病原菌FN5和CLGB7-1,均鉴定为新孢镰刀菌F.neocosmosporiellum。理化性质比较发现,发病田土壤和果壳中中微量金属元素总量高于健康区,尤其是Ca;且发病土壤pH值高于健康土壤。本研究明确了冀东地区花生果斑病病原菌为F.neocosmosporiellum,与花生果腐病病原菌一致。花生果斑病是我国首次报道的花生果腐病新症状,该症状的发生与土壤pH值和中微量金属元素含量密切相关。
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关键词
花生果腐病
新孢镰刀菌
病原菌鉴定
花生果斑病
土壤理化性质
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职称材料
题名
基于全基因组预测和分析花生果腐病原菌分泌蛋白
1
作者
王辉灵
韩会玲
王晓晗
焦镇
李步阳
何弯弯
孙伟明
机构
河北
科技师范学院海洋资源与环境学院/农学与生物科技学院/
河北
省作物逆境生物学重点实验室(筹)
河北长生果肥料研究院有限公司
出处
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期11-18,38,共9页
基金
河北省重点研发计划项目(花生现代种业科技创新团队21326316D-6)
河北省现代农业产业技术体系油料创新团队(HBCT2023030206)
河北省自然科学基金青年科学基金项目(C2021407021)。
文摘
【目的】为分析花生果腐病病原菌-新孢镰刀菌的侵染机制并筛选可用基因。【方法】以全基因组测序结果为基础,根据分泌蛋白与效应因子的特点,采用SignalP、TMHMM、WoLF PSORT及NetGPI等软件一步步筛选,对新孢镰刀菌全基因组12756条蛋白序列进行了分泌蛋白预测和功能分析。【结果】新孢镰刀菌全基因组编码蛋白中有701条序列具有典型的分泌蛋白特征,占蛋白总数的5.49%,其长度主要分布在101~700个氨基酸范围内。信号肽的分析结果表明,信号肽-3和-1位置的氨基酸相对保守,其切割位点属于典型的A-X-A型。对分泌蛋白功能预测结果表明,656个分泌蛋白获得了功能注释,其功能主要涉及碳水化合物的运输、代谢过程,蛋白翻译后修饰和氨基酸代谢、运输过程。分泌蛋白中效应蛋白预测结果表明,新孢镰刀菌分泌蛋白中共有161个潜在的效应蛋白。【结论】对新孢镰刀菌分泌蛋白的有效预测和功能分析,为筛选新效应蛋白,明确其致病机理,筛选寄主抗性基因奠定了基础。同时为花生果腐病抗性品种选育和综合防治提供理论依据。
关键词
花生果腐病
新孢镰刀菌
生物信息学
分泌蛋白
Keywords
peanut pod rot
Fusarium neocosmosporiellum
bioinformatics analysis
secreted proteins
分类号
S435.652 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
花生果腐病新病症的发现及发生因素分析
被引量：
1
2
作者
何弯弯
胡朋举
冯丽娜
赵凤颖
邢单润
韩金星
孙伟明
王晓晗
机构
河北
科技师范学院海洋资源与环境学院/农学与生物科技学院/
河北
省作物逆境生物学重点实验室(筹)
河北长生果肥料研究院有限公司
唐山市农业特色产业技术指导站
出处
《花生学报》
北大核心
2023年第3期28-34,55,共8页
基金
河北省重点研发计划项目(花生现代种业科技创新团队21326316D-6)
河北省研究生创新资助项目(CXZZSS2021148)
河北省现代农业产业技术体系油料创新团队项目(HBCT2023030206)。
文摘
一种花生果腐病新症状,俗称花生果斑病或花生麻脸病,在我国冀东鲜食花生产区广泛发生,但其优势病原菌及发病因素尚不明确。本研究采集了冀东唐山市和秦皇岛市花生种植区发病样品,分别分离得到优势病原菌FN5和CLGB7-1,均鉴定为新孢镰刀菌F.neocosmosporiellum。理化性质比较发现,发病田土壤和果壳中中微量金属元素总量高于健康区,尤其是Ca;且发病土壤pH值高于健康土壤。本研究明确了冀东地区花生果斑病病原菌为F.neocosmosporiellum,与花生果腐病病原菌一致。花生果斑病是我国首次报道的花生果腐病新症状,该症状的发生与土壤pH值和中微量金属元素含量密切相关。
关键词
花生果腐病
新孢镰刀菌
病原菌鉴定
花生果斑病
土壤理化性质
Keywords
peanut pod rot
F usarium neocosm osporiellum
identification of pathogen
peanut pod spot
physical and chemical properties of soil
分类号
S435.652 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
S432.44 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于全基因组预测和分析花生果腐病原菌分泌蛋白
王辉灵
韩会玲
王晓晗
焦镇
李步阳
何弯弯
孙伟明
《四川农业大学学报》
CSCD
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
花生果腐病新病症的发现及发生因素分析
何弯弯
胡朋举
冯丽娜
赵凤颖
邢单润
韩金星
孙伟明
王晓晗
《花生学报》
北大核心
2023
1
在线阅读
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职称材料
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