期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
1
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
2种常见CRISPR-Cas系统在苹果中的适用性特征
1
作者
岳鹏
高海琴
+3 位作者
李哲
米志波
郑博
赵彦敏
《江苏农业科学》
北大核心
2022年第7期43-51,共9页
运用生物信息学方法初步分析CRISPR-Cas9和Cpf1在苹果中的整体适用性特征,以期为苹果基因组编辑和CRISPR-Cas在苹果研究中的推广使用提供一定的参考和便利。结果表明,苹果染色体中有数量可观的PAM,平均间隔7 bp碱基有1个5′-NGG、间隔3...
运用生物信息学方法初步分析CRISPR-Cas9和Cpf1在苹果中的整体适用性特征,以期为苹果基因组编辑和CRISPR-Cas在苹果研究中的推广使用提供一定的参考和便利。结果表明,苹果染色体中有数量可观的PAM,平均间隔7 bp碱基有1个5′-NGG、间隔3 bp有1个5′-TTN;也就是说5′-TTN比5′-NGG的出现频率高。SpCas9、FnCpf1分别有29.0%、26.9%的作用位点几乎覆盖了所有染色体基因,个别不能被SpCas9识别的基因能被FnCpf1识别,反之亦然。苹果的CRISPR靶序列有大量重复,单一靶序列被视为能被Cas蛋白特异识别并有效编辑。在靶序列长度为20 nt时,99.5%的染色体基因可至少被其中1种Cas蛋白编辑,分别具有不同的可编辑度搭配;其中的237个基因只能被1种Cas蛋白编辑,填补了另一种Cas蛋白留下的编辑空白,另有220个染色体基因(0.5%)不能被任一种Cas蛋白编辑,即2种Cas蛋白同时留下编辑空白,没有互补。
展开更多
关键词
苹果
CRISPR-Cas
适用性特征
PAM出现频率
基因编辑
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
2种常见CRISPR-Cas系统在苹果中的适用性特征
1
作者
岳鹏
高海琴
李哲
米志波
郑博
赵彦敏
机构
张家口
开放大学
张家口市
第六中学
河北省张家口市涉密载体管理中心
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2022年第7期43-51,共9页
基金
中国成人教育协会“十四五”成人继续教育科研规划重点课题(编号:2021-323ZB)
河北省张家口市科技项目(编号:18110300043)
河北省张家口市社会科学立项研究课题(编号:2021121)。
文摘
运用生物信息学方法初步分析CRISPR-Cas9和Cpf1在苹果中的整体适用性特征,以期为苹果基因组编辑和CRISPR-Cas在苹果研究中的推广使用提供一定的参考和便利。结果表明,苹果染色体中有数量可观的PAM,平均间隔7 bp碱基有1个5′-NGG、间隔3 bp有1个5′-TTN;也就是说5′-TTN比5′-NGG的出现频率高。SpCas9、FnCpf1分别有29.0%、26.9%的作用位点几乎覆盖了所有染色体基因,个别不能被SpCas9识别的基因能被FnCpf1识别,反之亦然。苹果的CRISPR靶序列有大量重复,单一靶序列被视为能被Cas蛋白特异识别并有效编辑。在靶序列长度为20 nt时,99.5%的染色体基因可至少被其中1种Cas蛋白编辑,分别具有不同的可编辑度搭配;其中的237个基因只能被1种Cas蛋白编辑,填补了另一种Cas蛋白留下的编辑空白,另有220个染色体基因(0.5%)不能被任一种Cas蛋白编辑,即2种Cas蛋白同时留下编辑空白,没有互补。
关键词
苹果
CRISPR-Cas
适用性特征
PAM出现频率
基因编辑
分类号
S661.101 [农业科学—果树学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2种常见CRISPR-Cas系统在苹果中的适用性特征
岳鹏
高海琴
李哲
米志波
郑博
赵彦敏
《江苏农业科学》
北大核心
2022
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
