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题名microRNAs功能相似性计算方法研究进展
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作者
李建伟
杜燕波
张山
宋子健
郑希强
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机构
河北工业大学人工智能与数据科学学院计算医学研究所
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出处
《生理科学进展》
CAS
北大核心
2020年第3期206-210,共5页
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基金
国家自然科学基金(81672113)
河北省自然科学基金(C2018202083)资助课题。
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文摘
microRNAs(mi RNAs)是一类非编码小RNA分子,在生命过程中发挥着广泛而又重要的调控功能。迄今只有极少数mi RNAs具有明确功能,通过计算mi RNAs功能相似性推测mi RNAs调控功能已成为mi RNAs研究中的一个热点,在mi RNAs功能识别研究中发挥着重要作用。本文综述了计算mi RNAs功能相似性方法的研究进展,总结了各种主流计算方法的算法思想和优缺点,探讨了该领域的进一步发展方向。
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关键词
microRNAs(miRNAs)
功能相似性
生物信息
计算方法
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分类号
Q811
[生物学—生物工程]
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题名microRNA集合富集分析工具的研究进展
被引量：1
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作者
李建伟
徐梦梦
杨宵月
刘磊波
杜燕波
韩小芬
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机构
河北工业大学人工智能与数据科学学院计算医学研究所
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出处
《生理科学进展》
CAS
北大核心
2019年第5期391-395,共5页
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基金
国家自然科学基金(81672113)
河北省自然科学基金(C2018202083)资助课题
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文摘
随着新一代高通量测序技术的快速发展,microRNA(miRNA)组学数据以井喷之势快速积累,进而导致多种预测miRNA调控功能的集合富集分析工具应运而生。它们为预测miRNA功能、探寻与疾病之间的关系提供了一类高效方法。本文综述了多个预测miRNA集合富集分析工具,介绍了它们的主要算法思想及其优缺点。最后,在总结现有分析工具的基础上,探讨了该领域的进一步研究方向。
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关键词
microRNA(miRNA)
miRNA-人类疾病关联关系
基因集合富集分析
生物信息
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分类号
Q811
[生物学—生物工程]
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题名非编码RNA与小分子药物关联预测方法的研究进展
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作者
李建伟
陈龙跃
张旭坤
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机构
河北工业大学人工智能与数据科学学院计算医学研究所
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出处
《生理科学进展》
2025年第4期331-338,共8页
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基金
国家自然科学基金(620721547)资助课题。
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文摘
非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是基因组转录产生的一类不编码蛋白质的RNA分子,涵盖微小RNA(microRNA,miRNA)和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)等多种类型,在基因表达、细胞发育、疾病发生和发展中扮演着重要的调控角色,是一类新型的潜在药物靶点。小分子药物作为临床治疗的关键手段,通过与特定靶点相互作用,在多种复杂疾病治疗过程中发挥关键作用。采用智能计算方法预测潜在的ncRNA与小分子药物的关联对于药物研发、疾病治疗策略的拓展以及生物学机制的解析均具有重要意义。本文综述了预测ncRNA与小分子药物关联的智能计算方法的研究进展,并对其未来发展方向进行了展望。
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关键词
非编码RNA
小分子药物
miRNA
lncRNA
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Keywords
non-coding RNA
small molecule drug
miRNA
lncRNA
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分类号
R914
[医药卫生]
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