期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
3
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
猪流行性腹泻病毒经典毒株与变异毒株双重荧光定量PCR检测方法的建立及应用
被引量：
1
1
作者
苏金辉
邓云贵
夏冰
《中国动物传染病学报》
北大核心
2024年第6期89-97,共9页
建立一种可以快速鉴别诊断猪流行性腹泻病毒(PEDV)经典毒株和变异毒株的TaqMan双重实时荧光定量PCR。参照GenBank中收录的36株经典毒株和变异毒株的基因序列,设计特异性引物和探针优化反应条件。进行双重实时荧光定量PCR的特异性试验、...
建立一种可以快速鉴别诊断猪流行性腹泻病毒(PEDV)经典毒株和变异毒株的TaqMan双重实时荧光定量PCR。参照GenBank中收录的36株经典毒株和变异毒株的基因序列,设计特异性引物和探针优化反应条件。进行双重实时荧光定量PCR的特异性试验、灵敏性试验和重复性试验,并绘制标准曲线。本研究建立的方法和国家标准方法同时对临床收集的样品进行检测。通过条件优化,该方法的最佳退火温度是60℃,最佳引物浓度为0.5μmol/L,最佳探针浓度为0.5μmol/L。本方法对猪场常见疫病病毒PRRSV、ASFV、CSFV、PCV2、PCV3、PRV、PPV、TGEV均无交叉反应,特异性强。对N基因和S基因的检测下限分别为1 copies/μL和10 copies/μL。以N基因和S基因重组质粒构建的标准曲线具有良好的线性关系,线性相关系数(R^(2))均为0.999。组内和组间变异系数均小于2%,具有良好的重复性。临床样品检测结果为阳性率17.09%,与国标推荐的检测方法阳性率一致;变异毒株阳性率80%,经典毒株阳性率20%,与扩增S基因测序比对后结果一致。本研究建立一种具有特异性强、灵敏度高、重复性好等优点的双重实时荧光定量PCR方法,对PED风险预警及毒株分型具有重要意义。
展开更多
关键词
猪流行性腹泻病毒
变异毒株
实时荧光定量PCR
在线阅读
下载PDF
职称材料
高职畜牧兽医专业学生典型就业案例分析
被引量：
2
2
作者
王洪芳
王俊萍
+2 位作者
张殿新
冀建军
杜超
《山东畜牧兽医》
2018年第2期67-68,共2页
我国是农业大国,党和政府十分关心农业,农村和农民问题,中国的强盛离不开农村的发展,大力发展畜牧业是农村三大出路之一.发展畜牧业,可以带动加工业,促进种植业,解决农村劳动力就业.现代畜牧业是一个朝阳产业,
关键词
劳动力就业
畜牧兽医专业
案例分析
现代畜牧业
学生
高职
农民问题
朝阳产业
在线阅读
下载PDF
职称材料
猪流行性腹泻病毒HB/HEBEU/2020株全基因组遗传变异与重组分析
被引量：
2
3
作者
翟新国
郑培培
+4 位作者
苏金辉
李庆阳
焦贺静
张若冰
李朋辉
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第8期3140-3150,共11页
【目的】了解猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的基因组特征及变异规律。【方法】以3只发病仔猪小肠病料作为模板,采用RT-PCR技术检测病原。以检测阳性的肝脏组织RNA为模板,进行RT-PCR,分段扩增PEDV全基因组,使...
【目的】了解猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的基因组特征及变异规律。【方法】以3只发病仔猪小肠病料作为模板,采用RT-PCR技术检测病原。以检测阳性的肝脏组织RNA为模板,进行RT-PCR,分段扩增PEDV全基因组,使用DNAStar软件对PEDV基因组测序结果进行剪辑、拼接和相似性分析,利用Mega X 10.0.5软件对PEDV基因组和S基因进行遗传进化分析;利用RDP4软件对PEDV基因组进行重组分析。【结果】PCR检测结果表明,3只病仔猪的小肠组织均检测到PEDV阳性。采用RT-PCR分段扩增成功获得1株PEDV全基因组序列,命名为HB/HEBEU/2020株,基因组大小为28038 bp,含有7个开放阅读框,从5′到3′依次为复制酶1a基因、复制酶1b基因、S基因、ORF3基因、E基因、M基因和N基因。相似性分析结果显示,HB/HEBEU/2020与SNJ-P、USA/Colorado/2013和HB2018等变异毒株全基因组和S基因的相似性均较高,分别为97.8%~99.3%和95.7%~98.8%,在所有市售疫苗株中,与变异型疫苗株AJ1102毒株全基因组和S基因的相似性分别为98.3%和97.3%;遗传进化分析结果显示,21株PEDV可划分为G1群和G2群2个分支,G1群进一步分化为G1a亚群和G1b亚群,G2群进一步分化为G2a亚群和G2b亚群,HB/HEBEU/2020属于G2a亚群。在G2群内,所有流行株均为2010年后出现,HB/HEBEU/2020与市售疫苗株AJ1102遗传距离较近,其次是LW/L,与CV777和attenuated CV777株遗传距离较远;经重组分析,HB/HEBEU/2020基因组可能为重组毒株,存在3个潜在的重组事件,重组事件1~3的断点分别为15918—22119、100—734和2214—2729 bp,其中重组事件1和2发生概率较大。【结论】HB/HEBEU/2020为1株变异型PEDV,与以CV777为代表的经典毒株亲缘关系较远,与2010年后中国发生的变异型毒株亲缘性较近,并且存在潜在重组事件。本研究结果可为调研中国当前PEDV进化和变异提供重要资料,为遏制PEDV蔓延与进化、制定合理防控方案提供理论和现实依据。
展开更多
关键词
猪流行性腹泻病毒
全基因组
遗传变异
重组分析
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
猪流行性腹泻病毒经典毒株与变异毒株双重荧光定量PCR检测方法的建立及应用
被引量：
1
1
作者
苏金辉
邓云贵
夏冰
机构
北京
大北农
科技集团股份
有限公司
河北大北农农牧食品有限公司
中国中医科学院中药研究所
出处
《中国动物传染病学报》
北大核心
2024年第6期89-97,共9页
基金
北京市博士后工作经费资助项目(2022-22-130)
中药研究所中药药理学创新团队(CI2021B015)。
文摘
建立一种可以快速鉴别诊断猪流行性腹泻病毒(PEDV)经典毒株和变异毒株的TaqMan双重实时荧光定量PCR。参照GenBank中收录的36株经典毒株和变异毒株的基因序列,设计特异性引物和探针优化反应条件。进行双重实时荧光定量PCR的特异性试验、灵敏性试验和重复性试验,并绘制标准曲线。本研究建立的方法和国家标准方法同时对临床收集的样品进行检测。通过条件优化,该方法的最佳退火温度是60℃,最佳引物浓度为0.5μmol/L,最佳探针浓度为0.5μmol/L。本方法对猪场常见疫病病毒PRRSV、ASFV、CSFV、PCV2、PCV3、PRV、PPV、TGEV均无交叉反应,特异性强。对N基因和S基因的检测下限分别为1 copies/μL和10 copies/μL。以N基因和S基因重组质粒构建的标准曲线具有良好的线性关系,线性相关系数(R^(2))均为0.999。组内和组间变异系数均小于2%,具有良好的重复性。临床样品检测结果为阳性率17.09%,与国标推荐的检测方法阳性率一致;变异毒株阳性率80%,经典毒株阳性率20%,与扩增S基因测序比对后结果一致。本研究建立一种具有特异性强、灵敏度高、重复性好等优点的双重实时荧光定量PCR方法,对PED风险预警及毒株分型具有重要意义。
关键词
猪流行性腹泻病毒
变异毒株
实时荧光定量PCR
Keywords
Porcine epidemic diarrhea virus
variant strain
TaqMan real-time PCR
分类号
S852.651 [农业科学—基础兽医学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
高职畜牧兽医专业学生典型就业案例分析
被引量：
2
2
作者
王洪芳
王俊萍
张殿新
冀建军
杜超
机构
沧州职业技术学院
河北大北农农牧食品有限公司
出处
《山东畜牧兽医》
2018年第2期67-68,共2页
文摘
我国是农业大国,党和政府十分关心农业,农村和农民问题,中国的强盛离不开农村的发展,大力发展畜牧业是农村三大出路之一.发展畜牧业,可以带动加工业,促进种植业,解决农村劳动力就业.现代畜牧业是一个朝阳产业,
关键词
劳动力就业
畜牧兽医专业
案例分析
现代畜牧业
学生
高职
农民问题
朝阳产业
分类号
S8-05 [农业科学—畜牧兽医]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
猪流行性腹泻病毒HB/HEBEU/2020株全基因组遗传变异与重组分析
被引量：
2
3
作者
翟新国
郑培培
苏金辉
李庆阳
焦贺静
张若冰
李朋辉
机构
河北
工程大学生命科学与
食品
工程学院
河北大北农农牧食品有限公司
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第8期3140-3150,共11页
基金
河北工程大学创新基金-博士专项基金。
文摘
【目的】了解猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的基因组特征及变异规律。【方法】以3只发病仔猪小肠病料作为模板,采用RT-PCR技术检测病原。以检测阳性的肝脏组织RNA为模板,进行RT-PCR,分段扩增PEDV全基因组,使用DNAStar软件对PEDV基因组测序结果进行剪辑、拼接和相似性分析,利用Mega X 10.0.5软件对PEDV基因组和S基因进行遗传进化分析;利用RDP4软件对PEDV基因组进行重组分析。【结果】PCR检测结果表明,3只病仔猪的小肠组织均检测到PEDV阳性。采用RT-PCR分段扩增成功获得1株PEDV全基因组序列,命名为HB/HEBEU/2020株,基因组大小为28038 bp,含有7个开放阅读框,从5′到3′依次为复制酶1a基因、复制酶1b基因、S基因、ORF3基因、E基因、M基因和N基因。相似性分析结果显示,HB/HEBEU/2020与SNJ-P、USA/Colorado/2013和HB2018等变异毒株全基因组和S基因的相似性均较高,分别为97.8%~99.3%和95.7%~98.8%,在所有市售疫苗株中,与变异型疫苗株AJ1102毒株全基因组和S基因的相似性分别为98.3%和97.3%;遗传进化分析结果显示,21株PEDV可划分为G1群和G2群2个分支,G1群进一步分化为G1a亚群和G1b亚群,G2群进一步分化为G2a亚群和G2b亚群,HB/HEBEU/2020属于G2a亚群。在G2群内,所有流行株均为2010年后出现,HB/HEBEU/2020与市售疫苗株AJ1102遗传距离较近,其次是LW/L,与CV777和attenuated CV777株遗传距离较远;经重组分析,HB/HEBEU/2020基因组可能为重组毒株,存在3个潜在的重组事件,重组事件1~3的断点分别为15918—22119、100—734和2214—2729 bp,其中重组事件1和2发生概率较大。【结论】HB/HEBEU/2020为1株变异型PEDV,与以CV777为代表的经典毒株亲缘关系较远,与2010年后中国发生的变异型毒株亲缘性较近,并且存在潜在重组事件。本研究结果可为调研中国当前PEDV进化和变异提供重要资料,为遏制PEDV蔓延与进化、制定合理防控方案提供理论和现实依据。
关键词
猪流行性腹泻病毒
全基因组
遗传变异
重组分析
Keywords
Porcine epidemic diarrhea virus
whole genome
genetic variation
recombination analysis
分类号
S855.3 [农业科学—临床兽医学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪流行性腹泻病毒经典毒株与变异毒株双重荧光定量PCR检测方法的建立及应用
苏金辉
邓云贵
夏冰
《中国动物传染病学报》
北大核心
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
高职畜牧兽医专业学生典型就业案例分析
王洪芳
王俊萍
张殿新
冀建军
杜超
《山东畜牧兽医》
2018
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
猪流行性腹泻病毒HB/HEBEU/2020株全基因组遗传变异与重组分析
翟新国
郑培培
苏金辉
李庆阳
焦贺静
张若冰
李朋辉
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
