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SV40PolyA顺式活化基因元件中不完整茎环结构的发现和序列研究 被引量：1
1
作者 王红钢 马欢 +4 位作者 李珠 张彬 景向阳 张媛 吕占军 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期337-346,共10页
研究室的前期工作发现,Alu串连序列插入pEGFP-C1质粒的GFP基因下游,瞬时转染HeLa细胞抑制GFP基因表达,2F2R(来自SV40PolyA反序5′端的第2个60 bp)插入GFP和Alu串连序列之间可以解除Alu序列对GFP基因的抑制作用。文章通过删减2F2R发现,45... 研究室的前期工作发现,Alu串连序列插入pEGFP-C1质粒的GFP基因下游,瞬时转染HeLa细胞抑制GFP基因表达,2F2R(来自SV40PolyA反序5′端的第2个60 bp)插入GFP和Alu串连序列之间可以解除Alu序列对GFP基因的抑制作用。文章通过删减2F2R发现,45R(2F2R 5′端的45 bp)、30R和22R可以活化基因,且二串连体活化基因作用高于单体。Secloop(2F2R近中部的22 bp)和Poly4(2F2R 3′端的30 bp)不能活化基因。30R与Poly4用9碱基连接形成30R-Poly4,其活化基因作用低于2F2R,两个22R之间连接碱基数对活化GFP基因作用没有明显的影响。22R(5′-GTGAAAAAAATGCTTTATTTGT-3′)含有不完整的回文序列,可以形成不完整的茎环结构,包括一个3碱基loop、3 bp第一茎、2碱基泡和3 bp第二茎。改变22R茎环结构的碱基突变明显影响其活化GFP基因的作用,过多互补和过少互补的茎环结构均不利于活化基因,提示适当的不完整茎环结构与活化基因有关。 展开更多
关键词 非编码序列 GFP 茎环结构 ALU SV40PolyA
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L1-ORF2不同片段对报告基因表达产生不同影响 被引量：7
2
作者 段肖翠 靳霞 +4 位作者 谢英 焦宁 刘静 王晓燕 吕占军 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期50-56,共7页
长散布重复序列-1（Line-1，LI）是重要的人类基因组成分，完整的LI有6kb，在基因组中存在的L，多数是不完整序列，有必要研究LI片段对基因表达的调控作用。PCR扩增LI第二读码框（LI-ORF2）不同位置的280bp片段，共7段，同向8串联按正... 长散布重复序列-1（Line-1，LI）是重要的人类基因组成分，完整的LI有6kb，在基因组中存在的L，多数是不完整序列，有必要研究LI片段对基因表达的调控作用。PCR扩增LI第二读码框（LI-ORF2）不同位置的280bp片段，共7段，同向8串联按正、反方向分别插入pEGFP质粒GFP基因下游，观察插入序列对GFP报告基因表达的影响。构建的质粒瞬时转染HeLa细胞，经荧光显微镜和Northern检测，不同片段对转录量和终止影响不同。7个片段正序对GFP报告基因的抑制均高于其反序，在正序串联表达载体p280—1＊8和p280—9＊8的GFP基因转录量超过其他280正序插入片段，在反序串联表达载体p280—1＊8as和p280．9＊8as的G即基因转录量超过其他280反序片段。280．1。8、280—9＊8、280—1＊8as和280—9＊8as属于转录终止性序列。Alu在基因组的多数区段与L，分布呈反比，Alu正、反序均对GFP表达有抑制作用，但反序抑制作用高于正序，Alu正序属于转录延伸性序列。280bp片段反序插入的所有质粒荧光阳性细胞均高于正序插入质粒。经碱基分析，L1-ORF2各段均存在A碱基含量多，T碱基含量少的现象，这可能是其正、反序对基因表达影响不同的原因。 展开更多
关键词 L1 ALU PEGFP-C1 ORF2 GFP
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SV40 PolyA序列及其AATAAA信号对上游GFP基因表达及转录终止的影响 被引量：1
3
作者 李书平 冯晶晶 +2 位作者 王红钢 王秀芳 吕占军 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期113-119,共7页
SV40 PolyA(猴空泡病毒PolyA,简称PolyA)序列是有转录终止作用和使转录的mRNA添加PolyA尾的DNA序列(240 bp),含有AATAAA六核苷酸多腺苷化信号(Polyadenylation signal)。在pEGFP-C1质粒的GFP基因下游插入14个同向串联的Alu序列(Alu14),... SV40 PolyA(猴空泡病毒PolyA,简称PolyA)序列是有转录终止作用和使转录的mRNA添加PolyA尾的DNA序列(240 bp),含有AATAAA六核苷酸多腺苷化信号(Polyadenylation signal)。在pEGFP-C1质粒的GFP基因下游插入14个同向串联的Alu序列(Alu14),构建pAlu14质粒,瞬时转染HeLa细胞,用Northern blot检测和荧光显微镜观察GFP RNA和GFP蛋白表达,发现Alu串联序列强烈抑制GFP基因表达,该序列没有转录终止作用产生高分子量GFP融合RNA。又在pAlu14质粒GFP基因和Alu串联序列之间按正、反方向插入PolyA序列及去除AATAAA信号的PolyA序列,插入的这些PolyA序列均能部分解除Alu14对GFP基因的抑制作用;去除AATAAA信号的PolyA正、反序列仍然引起转录终止。将PolyA反序(PolyAas)分为4段每段60 bp,中间的2段分别称为2F2R和3F3R,将2F2R或3F3R插在pAlu14质粒的Alu串联序列的上游,随着插入2F2R片段拷贝数的增加转录的GFP融合RNA的分子量增加;2F2R的下游如果依然是2F2R那么2F2R可以支持转录延伸,如果2F2R下游是Alu串联序列则2F2R导致转录终止。无论插入一个3F3R或插入64个3F3R,均产生低分子量GFP RNA。 展开更多
关键词 ALU SV40 POLYA AATAAA信号 GFP 转录终止
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