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LINC00261通过靶向miR-23a-3p/ZNF292轴抑制食管鳞状细胞癌的增殖、侵袭与转移
1
作者
米源
李旭哲
+4 位作者
王占鹏
刘延杰
宋春涛
王澜涛
王雷
《南方医科大学学报》
北大核心
2025年第10期2118-2125,共8页
目的探讨长链非编码RNA LINC00261对食管鳞状细胞的增殖、侵袭及转移等生物学行为的影响。方法通过GEO数据库中GSE149612数据集分析食管鳞状细胞癌中的差异分子。收集临床食管鳞状细胞癌及正常食管组织样本及多种食管鳞状细胞癌细胞系...
目的探讨长链非编码RNA LINC00261对食管鳞状细胞的增殖、侵袭及转移等生物学行为的影响。方法通过GEO数据库中GSE149612数据集分析食管鳞状细胞癌中的差异分子。收集临床食管鳞状细胞癌及正常食管组织样本及多种食管鳞状细胞癌细胞系细胞和正常食管上皮细胞HEEC细胞,通过PCR技术检测LINC00261的表达变化。过表达LINC00261再分为pcDNA组和pcDNA-LINC00261组,CCK-8、克隆形成实验检测细胞增殖能力,Transwell和流式细胞术分析其对细胞侵袭转移和凋亡的影响。ENCORI等相关生物信息学网站对LINC00261的靶点进行预测,双荧光素酶实验及Western blotting实验进行验证,裸鼠皮下移植瘤实验验证了LINC00261对食管鳞状细胞癌的影响。结果LINC00261在食管鳞状细胞癌中显著低表达,并且在临床食管鳞状细胞癌样本及细胞系中同样表达量明显降低(P<0.05);通过过表达LINC00261,发现其明显抑制了食管鳞状细胞癌的增殖、侵袭和转移并促进了肿瘤细胞的凋亡(P<0.05)。通过生物信息学网站的预测和双荧光素酶报告基因测定,验证了LINC00261靶向miR-23a-3p/ZNF292的关系。裸鼠皮下移植瘤实验发现通过过表达LINC00261可以明显抑制食管鳞状细胞癌的增殖和转移(P<0.0001)。结论LINC00261可以通过靶向miR-23a-3p/ZNF292抑制人食管鳞状细胞癌的增殖、侵袭和转移,为食管鳞状细胞癌的治疗提供新的依据。
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关键词
食管鳞状细胞癌
LINC00261
miR-23a-3p
ZNF292
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职称材料
RNA结合蛋白与RNA相互作用鉴定技术
被引量：
6
2
作者
陈伟
许馨
孙绍光
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期103-107,共5页
RNA结合蛋白(RNA binding proteins,RBPs)通过与RNA相互作用,广泛参与到RNA的剪切、转运、编辑、胞内定位及翻译调控等过程中。RNA领域尤其是非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)研究的快速发展,催生了多种RBPs-RNAs相互作用鉴定技术。这...
RNA结合蛋白(RNA binding proteins,RBPs)通过与RNA相互作用,广泛参与到RNA的剪切、转运、编辑、胞内定位及翻译调控等过程中。RNA领域尤其是非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)研究的快速发展,催生了多种RBPs-RNAs相互作用鉴定技术。这些技术反之又推动了RNA领域的研究进程。本文对紫外交联免疫沉淀(ultraviolet crosslinking and immunoprecipitation,CLIP),CLIP cDNA文库高通量测序(high-throughput sequencing of CLIP cDNA library,HITS-CLIP),光活化核苷增强的CLIP(photoactivatable-ribonucleoside-enhanced crosslinking and immunoprecipitation,PAR-CLIP),单核苷酸分离CLIP(individual nucleotide resolution CLIP,i CLIP),TRIBE(targets of RNA-binding protein identified by editing),RNA标记,相互作用组捕获(interactome capture,IC)和Ser IC(serial RNA interactome capture)等RBPs-RNAs相互作用鉴定技术的基本原理和优缺点以及应用进行综述。
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关键词
RNA结合蛋白
紫外交联免疫沉淀
CLIP
cDNA文库高通量测序
光活化核苷增强的CLIP
RNA结合蛋白免疫沉淀微阵列
TRIBE
RNA标记
相互作用组捕获
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职称材料
circRNA相关数据库及其应用
被引量：
2
3
作者
陈伟
吴仙华
孙绍光
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期35-41,共7页
环状RNA(circular RNA, circRNA)是由真核生物中的前体mRNA反向剪接产生的环状内源性RNA分子,分布广泛、结构稳定、序列高度保守,具有细胞和组织特异性。circRNA以多种方式参与调控生物学过程以及疾病的发生发展。目前发现的功能模式包...
环状RNA(circular RNA, circRNA)是由真核生物中的前体mRNA反向剪接产生的环状内源性RNA分子,分布广泛、结构稳定、序列高度保守,具有细胞和组织特异性。circRNA以多种方式参与调控生物学过程以及疾病的发生发展。目前发现的功能模式包含竞争性内源性RNA作用、与蛋白质互作、翻译成蛋白质以及顺式调控亲本基因的转录等。随着circRNA的基本信息、功能分析和与人类疾病的关系等研究内容不断更新增加,急需对海量的信息进行整合分析,以及对相应细胞或组织来源的circRNA进行分类。本文从基本信息整合及分析、相关功能分析和与人类疾病的相关性等方面,对目前常用的circRNA数据库进行综述,以期为circRNA研究提供参考。
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关键词
环状RNA
数据库
信息整合
功能预测
人类疾病
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职称材料
题名
LINC00261通过靶向miR-23a-3p/ZNF292轴抑制食管鳞状细胞癌的增殖、侵袭与转移
1
作者
米源
李旭哲
王占鹏
刘延杰
宋春涛
王澜涛
王雷
机构
河北医科大学
第四医院急诊科
河北医科大学基础医学院临床医学系
故城县医院急诊科
河北医科大学
第四医院胸二科
出处
《南方医科大学学报》
北大核心
2025年第10期2118-2125,共8页
基金
河北省医学科学研究课题计划资助(20240625)
河北省省级科技计划项目(22377769D)
+3 种基金
河北省省级科技计划基础研究专项(自然科学基金)联合基金项目(H202206391)
河北医科大学第四医院科研创新团队项目(2023B02)
中国青年医学创新研究科研课题项目(P250125108786)
中国抗癌协会肿瘤领域区域性科研培育基金项目(CESTDQLCORP300-07)。
文摘
目的探讨长链非编码RNA LINC00261对食管鳞状细胞的增殖、侵袭及转移等生物学行为的影响。方法通过GEO数据库中GSE149612数据集分析食管鳞状细胞癌中的差异分子。收集临床食管鳞状细胞癌及正常食管组织样本及多种食管鳞状细胞癌细胞系细胞和正常食管上皮细胞HEEC细胞,通过PCR技术检测LINC00261的表达变化。过表达LINC00261再分为pcDNA组和pcDNA-LINC00261组,CCK-8、克隆形成实验检测细胞增殖能力,Transwell和流式细胞术分析其对细胞侵袭转移和凋亡的影响。ENCORI等相关生物信息学网站对LINC00261的靶点进行预测,双荧光素酶实验及Western blotting实验进行验证,裸鼠皮下移植瘤实验验证了LINC00261对食管鳞状细胞癌的影响。结果LINC00261在食管鳞状细胞癌中显著低表达,并且在临床食管鳞状细胞癌样本及细胞系中同样表达量明显降低(P<0.05);通过过表达LINC00261,发现其明显抑制了食管鳞状细胞癌的增殖、侵袭和转移并促进了肿瘤细胞的凋亡(P<0.05)。通过生物信息学网站的预测和双荧光素酶报告基因测定,验证了LINC00261靶向miR-23a-3p/ZNF292的关系。裸鼠皮下移植瘤实验发现通过过表达LINC00261可以明显抑制食管鳞状细胞癌的增殖和转移(P<0.0001)。结论LINC00261可以通过靶向miR-23a-3p/ZNF292抑制人食管鳞状细胞癌的增殖、侵袭和转移,为食管鳞状细胞癌的治疗提供新的依据。
关键词
食管鳞状细胞癌
LINC00261
miR-23a-3p
ZNF292
Keywords
esophageal squamous cell carcinoma
LINC00261
miR-23a-3p
ZNF292
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
RNA结合蛋白与RNA相互作用鉴定技术
被引量：
6
2
作者
陈伟
许馨
孙绍光
机构
河北医科大学基础医学院临床医学系
河北医科大学
基础
医学院
生物化学与分子生物学教研室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期103-107,共5页
基金
国家自然科学基金项目(No.81670273
No.81200215)
+2 种基金
河北省高层次人才资助项目(No.A2016002073)
河北省高校科技研究优秀青年基金项目(No.YQ2013023)
河北医科大学大学生创新性实验计划项目(No.USIP2016009)~~
文摘
RNA结合蛋白(RNA binding proteins,RBPs)通过与RNA相互作用,广泛参与到RNA的剪切、转运、编辑、胞内定位及翻译调控等过程中。RNA领域尤其是非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)研究的快速发展,催生了多种RBPs-RNAs相互作用鉴定技术。这些技术反之又推动了RNA领域的研究进程。本文对紫外交联免疫沉淀(ultraviolet crosslinking and immunoprecipitation,CLIP),CLIP cDNA文库高通量测序(high-throughput sequencing of CLIP cDNA library,HITS-CLIP),光活化核苷增强的CLIP(photoactivatable-ribonucleoside-enhanced crosslinking and immunoprecipitation,PAR-CLIP),单核苷酸分离CLIP(individual nucleotide resolution CLIP,i CLIP),TRIBE(targets of RNA-binding protein identified by editing),RNA标记,相互作用组捕获(interactome capture,IC)和Ser IC(serial RNA interactome capture)等RBPs-RNAs相互作用鉴定技术的基本原理和优缺点以及应用进行综述。
关键词
RNA结合蛋白
紫外交联免疫沉淀
CLIP
cDNA文库高通量测序
光活化核苷增强的CLIP
RNA结合蛋白免疫沉淀微阵列
TRIBE
RNA标记
相互作用组捕获
Keywords
RNA binding proteins
ultraviolet crosslinking and immunoprecipitation
high-throughput sequencing of CLIP cDNA library
photoactivatable-ribonucleoside-enhanced crosslinking and immunoprecipitation
RNA binding protein immunoprecipitation-Chip
TRIBE
RNA tagging
interactome capture
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
circRNA相关数据库及其应用
被引量：
2
3
作者
陈伟
吴仙华
孙绍光
机构
河北医科大学基础医学院临床医学系
河北医科大学
基础
医学院
生物化学与分子生物学教研室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期35-41,共7页
基金
国家自然科学基金项目(No.81670273
No.81200215)
+1 种基金
河北省高层次人才资助项目(No.A2016002073)
河北医科大学大学生创新性实验计划项目(No.USIP2017159)资助~~
文摘
环状RNA(circular RNA, circRNA)是由真核生物中的前体mRNA反向剪接产生的环状内源性RNA分子,分布广泛、结构稳定、序列高度保守,具有细胞和组织特异性。circRNA以多种方式参与调控生物学过程以及疾病的发生发展。目前发现的功能模式包含竞争性内源性RNA作用、与蛋白质互作、翻译成蛋白质以及顺式调控亲本基因的转录等。随着circRNA的基本信息、功能分析和与人类疾病的关系等研究内容不断更新增加,急需对海量的信息进行整合分析,以及对相应细胞或组织来源的circRNA进行分类。本文从基本信息整合及分析、相关功能分析和与人类疾病的相关性等方面,对目前常用的circRNA数据库进行综述,以期为circRNA研究提供参考。
关键词
环状RNA
数据库
信息整合
功能预测
人类疾病
Keywords
circular RNA(circRNA)
database
information integration
function prediction
human disease
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
LINC00261通过靶向miR-23a-3p/ZNF292轴抑制食管鳞状细胞癌的增殖、侵袭与转移
米源
李旭哲
王占鹏
刘延杰
宋春涛
王澜涛
王雷
《南方医科大学学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
RNA结合蛋白与RNA相互作用鉴定技术
陈伟
许馨
孙绍光
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
circRNA相关数据库及其应用
陈伟
吴仙华
孙绍光
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
2
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职称材料
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