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半夏3种花叶病毒的mRT-PCR鉴定及遗传进化分析
被引量：
1
1
作者
李锦超
董俊美
+2 位作者
孟义江
杨太新
葛淑俊
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期80-87,共8页
半夏(Pinellia ternata)因长期无性繁殖导致病毒病高发。本研究以河北安国疑似病毒感染的半夏为材料,通过优化扩增反应体系及反应程序,建立了可以同时检测黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus, CMV)、大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus...
半夏(Pinellia ternata)因长期无性繁殖导致病毒病高发。本研究以河北安国疑似病毒感染的半夏为材料,通过优化扩增反应体系及反应程序,建立了可以同时检测黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus, CMV)、大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus, SMV)和芋花叶病毒(Dasheen mosaic virus, DsMV)的多重RT-PCR体系,RNA稀释106倍时亦能同时检测3种病毒。对侵染病毒外壳蛋白进行基因克隆和遗传进化分析,结果表明CMV的外壳蛋白编码区序列为657 bp,与浙江侵染半夏的CMV(DQ399550.1)序列相似性高达96.16%,与感染其他寄主的病毒序列差异较大;SMV和DsMV外壳蛋白序列分别为843和828 bp,与同种株系遗传变异度分别达到0.38和0.37以上,独立为1个进化支。生物信息学统计分析发现,病毒外壳蛋白序列高度保守,具有较为丰富的变异位点,碱基转换率大于颠换率,CMV AT偏倚度大于GC,SMV、DsMV与之相反。研究结果为半夏病毒检测和脱毒提供了技术和理论基础。
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关键词
半夏
花叶病毒
多重RT-PCR
遗传进化
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职称材料
题名
半夏3种花叶病毒的mRT-PCR鉴定及遗传进化分析
被引量：
1
1
作者
李锦超
董俊美
孟义江
杨太新
葛淑俊
机构
河北农业大学
农
学院
/教育部
华北
作物
种质
资源
研究与
利用
重点
实验室
河北农业大学生命科学学院/教育部华北作物种质资源研究与利用重点实验室
出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期80-87,共8页
基金
国家现代农业产业技术体系(CARS-21)
河北省现代农业产业技术体系中药材产业创新团队(HBCT201806201,HBCT201806202)。
文摘
半夏(Pinellia ternata)因长期无性繁殖导致病毒病高发。本研究以河北安国疑似病毒感染的半夏为材料,通过优化扩增反应体系及反应程序,建立了可以同时检测黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus, CMV)、大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus, SMV)和芋花叶病毒(Dasheen mosaic virus, DsMV)的多重RT-PCR体系,RNA稀释106倍时亦能同时检测3种病毒。对侵染病毒外壳蛋白进行基因克隆和遗传进化分析,结果表明CMV的外壳蛋白编码区序列为657 bp,与浙江侵染半夏的CMV(DQ399550.1)序列相似性高达96.16%,与感染其他寄主的病毒序列差异较大;SMV和DsMV外壳蛋白序列分别为843和828 bp,与同种株系遗传变异度分别达到0.38和0.37以上,独立为1个进化支。生物信息学统计分析发现,病毒外壳蛋白序列高度保守,具有较为丰富的变异位点,碱基转换率大于颠换率,CMV AT偏倚度大于GC,SMV、DsMV与之相反。研究结果为半夏病毒检测和脱毒提供了技术和理论基础。
关键词
半夏
花叶病毒
多重RT-PCR
遗传进化
Keywords
Pinellia ternata
mosaic virus
multiple RT-PCR
genetic evolution
分类号
S432.11 [农业科学—植物病理学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
半夏3种花叶病毒的mRT-PCR鉴定及遗传进化分析
李锦超
董俊美
孟义江
杨太新
葛淑俊
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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