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陆地棉漆酶基因家族鉴定及在黄萎病菌胁迫下的表达分析
被引量：
11
1
作者
赵晶
李旭彤
+8 位作者
梁学忠
王志城
崔静
陈斌
吴立强
王省芬
张桂寅
马峙英
张艳
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期1784-1795,共12页
黄萎病是降低棉花产量和品质较为严重的维管束病害。棉花在抵抗病原菌的过程中,抗病基因起着尤为重要的作用。漆酶是一种多功能氧化酶,在植物木质素合成和提高植株抗逆性等方面发挥着重要作用。高质量版本的基因组是提升基因家族分析准...
黄萎病是降低棉花产量和品质较为严重的维管束病害。棉花在抵抗病原菌的过程中,抗病基因起着尤为重要的作用。漆酶是一种多功能氧化酶,在植物木质素合成和提高植株抗逆性等方面发挥着重要作用。高质量版本的基因组是提升基因家族分析准确性的必要条件。本研究以目前最新的陆地棉TM-1高质量版本基因组为参考,通过生物信息学分析鉴定了陆地棉基因组中的Laccase(GhirLAC)基因家族,并对其进行了理化性质、基因结构、染色体定位以及在黄萎病胁迫下的表达模式分析。结果表明,陆地棉TM-1基因组中共包含83个GhirLAC家族成员,分布在24条染色体上,所有GhirLAC蛋白均定位在胞外,且具有相同/相似的保守基序。系统发育树分析显示,GhirLAC基因家族成员可分为7个亚组。结合黄萎病胁迫下棉花转录组数据,将GhirLAC基因家族各成员的表达分为3种模式,其中第1类和第2类GhirLAC基因在黄萎病菌胁迫下分别呈现有规律的表达量升高和降低,推测这些基因在棉花抗黄萎病反应中发挥重要功能。荧光定量PCR结果表明,GhirLAC02(GhLAC4)、GhirLAC38(GhLAC11)和GhirLAC20(GhLAC12)3个候选基因均受黄萎病菌诱导表达,其表达趋势与转录组数据相吻合。本研究为以后深入解析棉花GhirLAC基因的抗病功能及分子机制奠定基础。
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关键词
陆地棉
漆酶
基因家族
黄萎病
基因表达
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题名
陆地棉漆酶基因家族鉴定及在黄萎病菌胁迫下的表达分析
被引量：
11
1
作者
赵晶
李旭彤
梁学忠
王志城
崔静
陈斌
吴立强
王省芬
张桂寅
马峙英
张艳
机构
河北农业大学/华北作物种质资源研究与利用重点实验室/河北省棉花产业协同创新中心
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期1784-1795,共12页
基金
河北省优秀青年科学基金项目(C2017204011)
河北省高等学校科学技术研究重点项目(ZD2014019)
河北省青年拔尖人才支持计划资助~~
文摘
黄萎病是降低棉花产量和品质较为严重的维管束病害。棉花在抵抗病原菌的过程中,抗病基因起着尤为重要的作用。漆酶是一种多功能氧化酶,在植物木质素合成和提高植株抗逆性等方面发挥着重要作用。高质量版本的基因组是提升基因家族分析准确性的必要条件。本研究以目前最新的陆地棉TM-1高质量版本基因组为参考,通过生物信息学分析鉴定了陆地棉基因组中的Laccase(GhirLAC)基因家族,并对其进行了理化性质、基因结构、染色体定位以及在黄萎病胁迫下的表达模式分析。结果表明,陆地棉TM-1基因组中共包含83个GhirLAC家族成员,分布在24条染色体上,所有GhirLAC蛋白均定位在胞外,且具有相同/相似的保守基序。系统发育树分析显示,GhirLAC基因家族成员可分为7个亚组。结合黄萎病胁迫下棉花转录组数据,将GhirLAC基因家族各成员的表达分为3种模式,其中第1类和第2类GhirLAC基因在黄萎病菌胁迫下分别呈现有规律的表达量升高和降低,推测这些基因在棉花抗黄萎病反应中发挥重要功能。荧光定量PCR结果表明,GhirLAC02(GhLAC4)、GhirLAC38(GhLAC11)和GhirLAC20(GhLAC12)3个候选基因均受黄萎病菌诱导表达,其表达趋势与转录组数据相吻合。本研究为以后深入解析棉花GhirLAC基因的抗病功能及分子机制奠定基础。
关键词
陆地棉
漆酶
基因家族
黄萎病
基因表达
Keywords
G.hirsutum L.
laccase
gene family
Verticillium wilt
gene expression
分类号
S43 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
陆地棉漆酶基因家族鉴定及在黄萎病菌胁迫下的表达分析
赵晶
李旭彤
梁学忠
王志城
崔静
陈斌
吴立强
王省芬
张桂寅
马峙英
张艳
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
11
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