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食管鳞癌差异表达基因的筛选及其与免疫细胞浸润和预后的相关性
1
作者
王高燕
李青园
+2 位作者
杨荣芳
王永红
沈素朋
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2024年第4期337-347,共11页
目的:利用GEO数据库筛选食管鳞癌的差异表达基因(DEGs),并进一步分析这些基因与食管鳞癌中免疫细胞浸润之间的相关性,以及对预后的影响。方法:从GEO数据库筛选食管鳞状细胞癌芯片数据集GSE23400,使用R软件中的Limma包来分析DEGs。整合GS...
目的:利用GEO数据库筛选食管鳞癌的差异表达基因(DEGs),并进一步分析这些基因与食管鳞癌中免疫细胞浸润之间的相关性,以及对预后的影响。方法:从GEO数据库筛选食管鳞状细胞癌芯片数据集GSE23400,使用R软件中的Limma包来分析DEGs。整合GSE23400芯片中的两平台数据并通过GSVA包的ssGSEA算法计算每个样本免疫细胞浸润程度,并分别计算免疫浸润细胞与DEGs之间的相关性。结合GSE53624数据集分析DEGs对患者生存的影响,分析生存相关基因表达与免疫细胞浸润程度的相关性。使用GSE53622数据集验证食管鳞癌生存相关基因的表达,以及其与患者预后的关系。在38例食管鳞癌和相应癌旁非肿瘤组织中,采用免疫组织化学方法(IHC)检测EHF和CSTB的蛋白表达水平。使用RT-qPCR和Western blot检测EHF和CSTB在食管鳞癌中的mRNA和蛋白表达水平。结果:通过对104例食管鳞癌患者癌组织和正常组织的数据进行分析,共获得38个DEGs。免疫浸润研究发现免疫细胞在癌组织和正常组织中的浸润程度有所不同,38个DEGs与免疫细胞浸润程度具有相关性。在GSE53624数据集中,EHF基因表达与CD4^(+)T细胞和B细胞的浸润程度呈显著正相关,相关系数r分别为0.69和0.67(均P<0.01),CSTB基因表达与CD8^(+)T细胞和自然杀伤T细胞的浸润程度显著正相关,相关系数r分别为0.76和0.62(均P<0.01);食管癌患者中EHF和CSTB基因表达与生存时间显著相关(均P<0.05),EHF和CSTB基因高表达患者的生存时间显著高于低表达患者(中位生存期59.1 vs.24.1个月;63.1 vs.23.9个月)。在GSE53622数据集中,EHF和CSTB基因表达下调(均P<0.01),EHF和CSTB基因高表达的食管鳞癌患者比低表达患者预后好(中位生存期NA vs.29.7个月;NA vs.17.9个月,均P<0.05)。IHC结果显示,EHF和CSTB在食管鳞癌中的蛋白表达水平均低于相应癌旁组织(均P<0.05)。RT-qPCR和Western blot结果显示,EHF和CSTB在食管鳞癌细胞中的表达显著低于食管正常鳞状上皮细胞(均P<0.05)。结论:EHF和CSTB基因可能在食管鳞癌的肿瘤免疫及预后中发挥着重要作用,可以为患者免疫治疗和预后判断提供理论依据。
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关键词
食管鳞癌
EHF基因
CSTB基因
免疫细胞浸润
生存分析
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职称材料
芍药苷对代谢功能障碍相关脂肪性肝病大鼠肝脏中TLR4/MyD88通路的影响
被引量:
1
2
作者
张婷
孔令雅
+2 位作者
戴军
李龙易
马志红
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期2099-2105,共7页
目的:探讨芍药苷(PF)对代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MAFLD)大鼠肝脏中TLR4/MyD88通路的影响。方法:雄性SPF级SD大鼠随机分为正常对照(NC)组、模型对照(MC)组、芍药苷低剂量(PL)组和芍药苷高剂量(PH)组。正常对照组给予标准饲料,其余3组...
目的:探讨芍药苷(PF)对代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MAFLD)大鼠肝脏中TLR4/MyD88通路的影响。方法:雄性SPF级SD大鼠随机分为正常对照(NC)组、模型对照(MC)组、芍药苷低剂量(PL)组和芍药苷高剂量(PH)组。正常对照组给予标准饲料,其余3组给予高脂饲料8周建立大鼠MAFLD模型。造模4周后,肝组织进行HE和油红O染色确认造模成功。自第5周起开始给药,芍药苷组分别给予低剂量(25 mg·kg^(-1)·d^(-1))和高剂量(50 mg·kg^(-1)·d^(-1))芍药苷,正常对照组和模型对照组给予等容量生理盐水,连续4周。实验结束时,分别取血和肝脏用于指标检测。生化法检测各组大鼠血清中谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)、总胆固醇(TC)和甘油三酯(TG)含量;ELISA法检测各组大鼠血清中肿瘤坏死因子α(TNF-α)的水平;HE染色和油红O染色评估各组大鼠肝组织病理学变化并进行非酒精性脂肪肝病活动度评分(NAS);Western blot法和免疫组织化学法检测各组大鼠肝脏组织中Toll样受体4(TLR4)、髓样分化因子88(MyD88)和磷酸化的核因子(p-NF)-κB p65蛋白表达水平。结果:与正常对照组相比,连续8周高脂饲料喂养可使血清中TC、TG、ALT、AST和TNF-α明显增高(P<0.05),肝细胞内大量脂滴沉积、汇管区有明显的炎症细胞浸润,NAS评分增高(P<0.05),同时TLR4、MyD88和p-NF-κB p65蛋白表达增高(P<0.05)。与模型对照组相比,芍药苷可降低血清中TC、TG、ALT、AST和TNF-α水平(P<0.05),改善大鼠肝脏组织病理学变化,降低NAS评分(P<0.05),抑制TLR4/MyD88/p-NF-κB p65蛋白表达(P<0.05)。结论:芍药苷可改善MAFLD时的脂代谢紊乱、减轻肝脏炎症,该抗炎作用部分与抑制TLR4/MyD88通路蛋白表达有关。
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关键词
芍药苷
代谢功能障碍相关脂肪性肝病
TLR4/MyD88/NF-κB信号通路
炎症
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职称材料
题名
食管鳞癌差异表达基因的筛选及其与免疫细胞浸润和预后的相关性
1
作者
王高燕
李青园
杨荣芳
王永红
沈素朋
机构
河北中医药大学实验中心
河北
省中西医结合肺病重点
实验
室
石家庄市疾控
中心
河北
医科
大学
第四医院肿瘤研究所
出处
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2024年第4期337-347,共11页
基金
河北省重点研发计划项目(22377736D)
河北省自然科学基金项目(H2022423306,H2022206326)
+1 种基金
河北省卫健委课题项目(20221489)
河北中医学院博士基金项目(BSZ2021025)。
文摘
目的:利用GEO数据库筛选食管鳞癌的差异表达基因(DEGs),并进一步分析这些基因与食管鳞癌中免疫细胞浸润之间的相关性,以及对预后的影响。方法:从GEO数据库筛选食管鳞状细胞癌芯片数据集GSE23400,使用R软件中的Limma包来分析DEGs。整合GSE23400芯片中的两平台数据并通过GSVA包的ssGSEA算法计算每个样本免疫细胞浸润程度,并分别计算免疫浸润细胞与DEGs之间的相关性。结合GSE53624数据集分析DEGs对患者生存的影响,分析生存相关基因表达与免疫细胞浸润程度的相关性。使用GSE53622数据集验证食管鳞癌生存相关基因的表达,以及其与患者预后的关系。在38例食管鳞癌和相应癌旁非肿瘤组织中,采用免疫组织化学方法(IHC)检测EHF和CSTB的蛋白表达水平。使用RT-qPCR和Western blot检测EHF和CSTB在食管鳞癌中的mRNA和蛋白表达水平。结果:通过对104例食管鳞癌患者癌组织和正常组织的数据进行分析,共获得38个DEGs。免疫浸润研究发现免疫细胞在癌组织和正常组织中的浸润程度有所不同,38个DEGs与免疫细胞浸润程度具有相关性。在GSE53624数据集中,EHF基因表达与CD4^(+)T细胞和B细胞的浸润程度呈显著正相关,相关系数r分别为0.69和0.67(均P<0.01),CSTB基因表达与CD8^(+)T细胞和自然杀伤T细胞的浸润程度显著正相关,相关系数r分别为0.76和0.62(均P<0.01);食管癌患者中EHF和CSTB基因表达与生存时间显著相关(均P<0.05),EHF和CSTB基因高表达患者的生存时间显著高于低表达患者(中位生存期59.1 vs.24.1个月;63.1 vs.23.9个月)。在GSE53622数据集中,EHF和CSTB基因表达下调(均P<0.01),EHF和CSTB基因高表达的食管鳞癌患者比低表达患者预后好(中位生存期NA vs.29.7个月;NA vs.17.9个月,均P<0.05)。IHC结果显示,EHF和CSTB在食管鳞癌中的蛋白表达水平均低于相应癌旁组织(均P<0.05)。RT-qPCR和Western blot结果显示,EHF和CSTB在食管鳞癌细胞中的表达显著低于食管正常鳞状上皮细胞(均P<0.05)。结论:EHF和CSTB基因可能在食管鳞癌的肿瘤免疫及预后中发挥着重要作用,可以为患者免疫治疗和预后判断提供理论依据。
关键词
食管鳞癌
EHF基因
CSTB基因
免疫细胞浸润
生存分析
Keywords
esophageal squamous cell carcinoma
EHF gene
CSTB gene
immune cell infiltration
survival analysis
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
芍药苷对代谢功能障碍相关脂肪性肝病大鼠肝脏中TLR4/MyD88通路的影响
被引量:
1
2
作者
张婷
孔令雅
戴军
李龙易
马志红
机构
河北中医药大学实验中心
河北
医科
大学
第三医院
河北
中医药大学
基础医学院
河北
以岭医院
河北
省离子通道功能与创新中药国际联合研究
中心
出处
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期2099-2105,共7页
基金
河北省自然科学基金资助项目(No.H2021423034)。
文摘
目的:探讨芍药苷(PF)对代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MAFLD)大鼠肝脏中TLR4/MyD88通路的影响。方法:雄性SPF级SD大鼠随机分为正常对照(NC)组、模型对照(MC)组、芍药苷低剂量(PL)组和芍药苷高剂量(PH)组。正常对照组给予标准饲料,其余3组给予高脂饲料8周建立大鼠MAFLD模型。造模4周后,肝组织进行HE和油红O染色确认造模成功。自第5周起开始给药,芍药苷组分别给予低剂量(25 mg·kg^(-1)·d^(-1))和高剂量(50 mg·kg^(-1)·d^(-1))芍药苷,正常对照组和模型对照组给予等容量生理盐水,连续4周。实验结束时,分别取血和肝脏用于指标检测。生化法检测各组大鼠血清中谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)、总胆固醇(TC)和甘油三酯(TG)含量;ELISA法检测各组大鼠血清中肿瘤坏死因子α(TNF-α)的水平;HE染色和油红O染色评估各组大鼠肝组织病理学变化并进行非酒精性脂肪肝病活动度评分(NAS);Western blot法和免疫组织化学法检测各组大鼠肝脏组织中Toll样受体4(TLR4)、髓样分化因子88(MyD88)和磷酸化的核因子(p-NF)-κB p65蛋白表达水平。结果:与正常对照组相比,连续8周高脂饲料喂养可使血清中TC、TG、ALT、AST和TNF-α明显增高(P<0.05),肝细胞内大量脂滴沉积、汇管区有明显的炎症细胞浸润,NAS评分增高(P<0.05),同时TLR4、MyD88和p-NF-κB p65蛋白表达增高(P<0.05)。与模型对照组相比,芍药苷可降低血清中TC、TG、ALT、AST和TNF-α水平(P<0.05),改善大鼠肝脏组织病理学变化,降低NAS评分(P<0.05),抑制TLR4/MyD88/p-NF-κB p65蛋白表达(P<0.05)。结论:芍药苷可改善MAFLD时的脂代谢紊乱、减轻肝脏炎症,该抗炎作用部分与抑制TLR4/MyD88通路蛋白表达有关。
关键词
芍药苷
代谢功能障碍相关脂肪性肝病
TLR4/MyD88/NF-κB信号通路
炎症
Keywords
paeoniflorin
metabolic dysfunction-associated fatty liver disease
TLR4/MyD88/NF-κB signal-ing pathway
inflammation
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
R363.2 [医药卫生—病理学]
R575 [医药卫生—消化系统]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
食管鳞癌差异表达基因的筛选及其与免疫细胞浸润和预后的相关性
王高燕
李青园
杨荣芳
王永红
沈素朋
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2024
0
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职称材料
2
芍药苷对代谢功能障碍相关脂肪性肝病大鼠肝脏中TLR4/MyD88通路的影响
张婷
孔令雅
戴军
李龙易
马志红
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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