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全基因组预测分析爪哇虫草菌候选效应因子
1
作者
雷妍圆
HUSSIN Abid
+4 位作者
武淑文
官昭瑛
许建新
JALEEL Waqar
李怡峰
《环境昆虫学报》
北大核心
2025年第2期621-629,共9页
爪哇虫草菌Cordyceps javanica是一种广谱性生防真菌,可防治多种农林害虫。效应因子在真菌致病寄主昆虫过程中发挥重要作用。本研究基于公布的爪哇虫草菌全基因组信息,对其中预测的11142个蛋白序列进行筛选,以寻找其候选效应因子并进行...
爪哇虫草菌Cordyceps javanica是一种广谱性生防真菌,可防治多种农林害虫。效应因子在真菌致病寄主昆虫过程中发挥重要作用。本研究基于公布的爪哇虫草菌全基因组信息,对其中预测的11142个蛋白序列进行筛选,以寻找其候选效应因子并进行功能分析。通过依次使用SignalP v5.0、TMHMM v2.0、TargetP v2.0和Protcomp v9.0等生物信息学工具进行预测,筛选出611个可能位于细胞质中的蛋白,并进一步分析了其中348个半胱氨酸含量较高的蛋白序列及117个具有串联重复单元的蛋白。通过比对病原物-寄主互作数据库(PHI-base),从鉴定出的57个具有注释的蛋白筛选出10个候选效应因子。最终,基于突变表型预测,筛选出4个与致病性相关的细胞质效应因子,并通过实时荧光定量PCR技术研究了两个效应因子编码基因(细胞壁蛋白TQW04886和疏水蛋白TQW02068)在爪哇虫草菌营养至生殖生长转变过程中的表达特征,结果表明这两个效应因子主要在产孢阶段高表达。本研究不仅为深入理解爪哇虫草菌与寄主昆虫互作的分子机制提供了基础,也为其他昆虫病原真菌效应因子的预测提供了参考。
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关键词
爪哇虫草菌
全基因组
候选效应因子
预测
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职称材料
题名
全基因组预测分析爪哇虫草菌候选效应因子
1
作者
雷妍圆
HUSSIN Abid
武淑文
官昭瑛
许建新
JALEEL Waqar
李怡峰
机构
广东省
农业
科学院植物保护研究所/广东省植物保护新技术重点实验室
沙特阿拉伯环境、水和农业部
南京
农业
大学植物保护学院
深圳城市职业学院
出处
《环境昆虫学报》
北大核心
2025年第2期621-629,共9页
基金
国家重点研发计划(2022YFD1401200)
广东省普通高校工程技术研究中心项目(2024GCZX016)
+1 种基金
广东省科技计划(2020A1414010040)
深圳城市职业学院科研项目(2214007,2311008)。
文摘
爪哇虫草菌Cordyceps javanica是一种广谱性生防真菌,可防治多种农林害虫。效应因子在真菌致病寄主昆虫过程中发挥重要作用。本研究基于公布的爪哇虫草菌全基因组信息,对其中预测的11142个蛋白序列进行筛选,以寻找其候选效应因子并进行功能分析。通过依次使用SignalP v5.0、TMHMM v2.0、TargetP v2.0和Protcomp v9.0等生物信息学工具进行预测,筛选出611个可能位于细胞质中的蛋白,并进一步分析了其中348个半胱氨酸含量较高的蛋白序列及117个具有串联重复单元的蛋白。通过比对病原物-寄主互作数据库(PHI-base),从鉴定出的57个具有注释的蛋白筛选出10个候选效应因子。最终,基于突变表型预测,筛选出4个与致病性相关的细胞质效应因子,并通过实时荧光定量PCR技术研究了两个效应因子编码基因(细胞壁蛋白TQW04886和疏水蛋白TQW02068)在爪哇虫草菌营养至生殖生长转变过程中的表达特征,结果表明这两个效应因子主要在产孢阶段高表达。本研究不仅为深入理解爪哇虫草菌与寄主昆虫互作的分子机制提供了基础,也为其他昆虫病原真菌效应因子的预测提供了参考。
关键词
爪哇虫草菌
全基因组
候选效应因子
预测
Keywords
Cordyceps javanica
genome
candidate effectors
prediction
分类号
Q968.1 [生物学—昆虫学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
全基因组预测分析爪哇虫草菌候选效应因子
雷妍圆
HUSSIN Abid
武淑文
官昭瑛
许建新
JALEEL Waqar
李怡峰
《环境昆虫学报》
北大核心
2025
0
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